RNA–Protein interactions for RNA: 15S_rRNA

15S_rRNA, Transcript of Ribosomal RNA of the small mitochondrial ribosomal subunit, yeastyeast

Gene 15S_rRNA, Length 1,649 nt, Biotype rRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
15S_rRNA15S_rRNA APS1P35181 156 aa1.41□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA YET1P35723 206 aa1.41□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA UMP1P38293 148 aa1.41□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA MIC12P38341 106 aa1.41□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA RTR1P40084 226 aaPredicted RBP1.41□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA RPL13BP40212 199 aaKnown RBP1.41□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA YRB2P40517 327 aa1.41□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA YRB1P41920 201 aaKnown RBP1.41□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA OTU1P43558 301 aa1.41□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA NUP57P48837 541 aa1.41□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA SWP1Q02795 286 aa1.41□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP1.41□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA TSC3Q3E790 80 aa1.41□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA TCA17P32613 152 aa1.4□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA ALG13P53178 202 aa1.4□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA TDA8Q6B2U8 126 aa1.4□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA FLO9P39712 1322 aa1.4□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA RPL28P02406 149 aaKnown RBP1.4□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA YBR121C-AP0C5L4 52 aa1.4□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA FPR1P20081 114 aaKnown RBP1.4□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA DBF2P22204 572 aa1.4□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA SNC2P33328 115 aa1.4□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA UPS2P35200 230 aa1.4□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA TMA19P35691 167 aaKnown RBP1.4□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA SKG1P36169 355 aa1.4□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA MRPL17P36528 281 aa1.4□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA RTC3P38804 111 aaPredicted RBP1.4□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA GLE2P40066 365 aa1.4□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA NCB2Q92317 146 aa1.4□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP1.39□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP1.39□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA GAA1P39012 614 aa1.39□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA NUP49Q02199 472 aa1.39□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA YKL183C-AQ3E765 70 aa1.39□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA NHP6BP11633 99 aaKnown RBP1.38□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA PBN1P25580 416 aa1.38□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA SEC17P32602 292 aa1.38□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA SIP3P38717 1229 aa1.38□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA TCD1P38756 429 aa1.38□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA GCN20P43535 752 aaKnown RBP1.38□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA SAY1P53324 424 aa1.38□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA GAS3Q03655 524 aa1.38□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA ANT1Q06497 328 aa1.38□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA MCP1Q12106 302 aa1.38□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA JLP1Q12358 412 aa1.38□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA MET5P47169 1442 aa1.38□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA PDR18P53756 1333 aa1.37□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA TIM9O74700 87 aa1.37□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA GPA2P10823 449 aa1.37□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA TFC1P32367 649 aa1.37□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA GVP36P40531 326 aaKnown RBP1.37□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA MGA1P53050 456 aa1.37□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA YNR077CP53758 84 aa1.37□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA GPM2Q12008 311 aa1.37□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA FSF1Q12029 327 aaKnown RBP1.37□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA RIO1Q12196 484 aaKnown RBP1.37□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA SEC4P07560 215 aaKnown RBP1.37□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA PRX1P34227 261 aaKnown RBP1.37□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA ERG28P40030 148 aa1.37□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA IRC18P47056 224 aa1.37□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA ADO1P47143 340 aaKnown RBP1.37□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA RUD3Q12234 484 aaKnown RBP1.37□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA GCN3P14741 305 aa1.36□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA STE18P18852 110 aa1.36□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA SHE2P36068 246 aaKnown RBP RIP-Chip data1.36□□□□□ -2.19not detected
15S_rRNA15S_rRNA UTP30P36144 274 aaKnown RBP1.36□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA YBR209WP38311 105 aa1.36□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA RMD6P39975 231 aa1.36□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA MSS2P40990 351 aa1.36□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA TUS1Q06412 1307 aa1.35□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA URA5P13298 226 aaKnown RBP1.35□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA COQ1P18900 473 aa1.35□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA IDH1P28834 360 aaKnown RBP RIP-Chip data1.35□□□□□ -2.19not detected
15S_rRNA15S_rRNA MGM101P32787 269 aaKnown RBP1.35□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA AST2P39945 430 aaKnown RBP1.35□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA YGR050CP53231 118 aa1.35□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA PDR17P53844 350 aa1.35□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA YDR249CQ03787 373 aa1.35□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA YPL162CQ12042 273 aa1.35□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA KSS1P14681 368 aa1.34□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA BET1P22804 142 aa1.34□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA YBR285WP38354 144 aa1.34□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA YNL194CP40169 301 aa1.34□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA ERJ5P43613 295 aaPredicted RBP1.34□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA RAD17P48581 401 aa1.34□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA CUS2P53830 285 aaPredicted RBP1.34□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA POP3P53833 195 aaPredicted RBP1.34□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA ATG40Q99325 256 aa1.34□□□□□ -2.19
15S_rRNA15S_rRNA PRP18P33411 251 aaPredicted RBP1.33□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA CBT1P36038 271 aaPredicted RBP1.33□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA EAF6P47128 113 aa1.33□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA QCR8P08525 94 aa1.33□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA MAG1P22134 296 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA PTM1P32857 523 aa1.33□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA CWC23P52868 283 aaPredicted RBP1.33□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA YDL180WQ12301 547 aa1.33□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA RPL25P04456 142 aaKnown RBP1.32□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA CDC33P07260 213 aaKnown RBP1.32□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA RPB3P16370 318 aaKnown RBP1.32□□□□□ -2.2
15S_rRNA15S_rRNA TVP38P36164 337 aa1.32□□□□□ -2.2
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