RNA–Protein interactions for RNA: YHR143W-A

RPC10, Transcript of RNA polymerase subunit ABC10-alpha, found in RNA pol I, II, and III, yeastyeast

Gene RPC10, Length 213 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPC10YHR143W-A YML108WQ03759 105 aa1.11□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A MSA1Q08471 629 aa1.11□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A ATG31Q12421 196 aa1.11□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A YPL229WQ99395 206 aa1.11□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A BEM2P39960 2167 aaKnown RBP1.11□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A INO80P53115 1489 aa1.11□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A MEI4P29467 408 aa1.1□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A YBR220CP38318 560 aa1.1□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A YNL134CP53912 376 aaKnown RBP1.1□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A SRL4Q03085 281 aa1.1□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A SML1Q04964 104 aa1.1□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A MRPL25P23369 157 aa1.09□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A CUE1P38428 203 aa1.09□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A PEX17P40155 199 aa1.09□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A FMC1P40491 155 aa1.09□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A ICE2P40499 491 aa1.09□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A MCM22P47167 239 aa1.09□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A YJR149WP47177 404 aa1.09□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A ERV29P53337 310 aa1.09□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A DID2P69771 204 aa1.09□□□□□ -2.23
RPC10YHR143W-A FPR1P20081 114 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A RPO26P20435 155 aa1.08□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A RPL13BP40212 199 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A PGD1P40356 397 aa1.08□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A TIR3P40552 269 aa1.08□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A YNL010WP53981 241 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data1.08□□□□□ -2.24not detected
RPC10YHR143W-A YMD8Q03697 442 aa1.08□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A YLR162WQ06235 118 aa1.08□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A PSF1Q12488 208 aa1.08□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP1.08□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A LSO2Q3E772 92 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A BCY1P07278 416 aaKnown RBP1.07□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A SRB4P32569 687 aa1.07□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A GLE2P40066 365 aa1.07□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A NUP84P52891 726 aa1.07□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A AIF1P52923 378 aa1.07□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A NSA1P53136 463 aaPredicted RBP1.07□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A NUP49Q02199 472 aa1.07□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A TRM12Q04235 462 aa1.07□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A CSI2Q08054 341 aa1.07□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A YHR139C-AO13536 103 aa1.06□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A SPT3P06844 337 aa1.06□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A YPR170W-BP0C5R9 85 aa1.06□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A FZF1P32805 299 aa1.06□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A LDB7P38210 180 aa1.06□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A DOG2P38773 246 aa1.06□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A TRM9P49957 279 aa1.06□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A BOL2P53082 120 aa1.06□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A YLR283WQ05867 314 aa1.06□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A RIO1Q12196 484 aaKnown RBP1.06□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A FLO9P39712 1322 aa1.06□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A REP2P03872 296 aa1.05□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A RPL27BP0C2H7 136 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A MRPS28P21771 286 aa1.05□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A NTF2P33331 125 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A UPS2P35200 230 aa1.05□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A IRC22P40006 225 aa1.05□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A YNL217WP40152 326 aa1.05□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A PET117Q02771 107 aa1.05□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A SPG3Q04398 127 aaPredicted RBP1.05□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A GPA2P10823 449 aa1.04□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A CDC10P25342 322 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A ATG22P25568 528 aa1.04□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A TMA19P35691 167 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A POP4P38336 279 aa1.04□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A COX15P40086 486 aa1.04□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A PRE6P40303 254 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A DOC1P53068 250 aa1.04□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A RRN5Q02983 363 aa1.04□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A LPP1Q04396 274 aa1.04□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A ANT1Q06497 328 aa1.04□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A DRS2P39524 1355 aa1.04□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A YCR016WP25617 290 aaKnown RBP1.03□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A MSN4P33749 630 aa1.03□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A VPS21P36017 210 aaKnown RBP1.03□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A RPC17P47076 161 aa1.03□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A PRM8P53174 237 aa1.03□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A SNZ1Q03148 297 aa1.03□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A YDR248CQ03786 193 aa1.03□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A MET5P47169 1442 aa1.03□□□□□ -2.24
RPC10YHR143W-A YLR156WP0CE96 114 aa1.02□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A YLR159WP0CE97 114 aa1.02□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A YLR161WP0CE98 114 aa1.02□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A YET1P35723 206 aa1.02□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A UMP1P38293 148 aa1.02□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A URA8P38627 578 aaPredicted RBP1.02□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A YRB2P40517 327 aa1.02□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A SWP1Q02795 286 aa1.02□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A YPL162CQ12042 273 aa1.02□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A TSC3Q3E790 80 aa1.02□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A URA6P15700 204 aa1.01□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A SSO1P32867 290 aa1.01□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A SNC2P33328 115 aa1.01□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A MRPL28P36527 147 aa1.01□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A GAA1P39012 614 aa1.01□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A LIA1P47120 325 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
RPC10YHR143W-A MIC26P50087 233 aa1.01□□□□□ -2.25
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