RNA–Protein interactions for RNA: YKL086W

SRX1, Transcript of Sulfiredoxin, yeastyeast

Gene SRX1, Length 384 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRX1YKL086W HNT1Q04344 158 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SRX1YKL086W ODC2Q99297 307 aa14.63□□□□□ -0.07
SRX1YKL086W TPO3Q06451 622 aa14.62□□□□□ -0.07
SRX1YKL086W NGL1Q08213 363 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SRX1YKL086W YOR283WQ12040 230 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SRX1YKL086W RDL1Q12305 139 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SRX1YKL086W HTD2P38790 280 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SRX1YKL086W MID1P41821 548 aa14.61□□□□□ -0.07
SRX1YKL086W SER2P42941 309 aa14.61□□□□□ -0.07
SRX1YKL086W RPS0BP46654 252 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SRX1YKL086W GEP7P53171 287 aa14.61□□□□□ -0.07
SRX1YKL086W YNR064CP53750 290 aa14.61□□□□□ -0.07
SRX1YKL086W SOG2Q08817 791 aa14.61□□□□□ -0.07
SRX1YKL086W INP53Q12271 1107 aa14.61□□□□□ -0.07
SRX1YKL086W MPD1Q12404 318 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SRX1YKL086W APA2P22108 325 aa14.6□□□□□ -0.07
SRX1YKL086W RFA3P26755 122 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SRX1YKL086W IMP1P28627 190 aa14.6□□□□□ -0.07
SRX1YKL086W VAM7P32912 316 aa14.6□□□□□ -0.07
SRX1YKL086W YHK8P38776 514 aa14.6□□□□□ -0.07
SRX1YKL086W LNP1P38878 278 aa14.6□□□□□ -0.07
SRX1YKL086W YHC3P47040 408 aa14.6□□□□□ -0.07
SRX1YKL086W FMP48P53233 369 aa14.6□□□□□ -0.07
SRX1YKL086W RGC1Q06108 1083 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SRX1YKL086W CSI2Q08054 341 aa14.6□□□□□ -0.07
SRX1YKL086W PET122P10355 254 aa14.59□□□□□ -0.07
SRX1YKL086W CDC34P14682 295 aa14.59□□□□□ -0.07
SRX1YKL086W DBP2P24783 546 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SRX1YKL086W VMA5P31412 392 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SRX1YKL086W YIL060WP40519 144 aa14.59□□□□□ -0.07
SRX1YKL086W MRX5P47007 382 aa14.59□□□□□ -0.07
SRX1YKL086W ABM1P47146 123 aa14.59□□□□□ -0.07
SRX1YKL086W RPN13O13563 156 aa14.58□□□□□ -0.08
SRX1YKL086W CWC23P52868 283 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SRX1YKL086W RAI1P53063 387 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SRX1YKL086W YGR042WP53227 271 aa14.58□□□□□ -0.08
SRX1YKL086W PRM15Q03262 622 aa14.58□□□□□ -0.08
SRX1YKL086W CAC2Q04199 468 aa14.58□□□□□ -0.08
SRX1YKL086W PEX4P29340 183 aa14.57□□□□□ -0.08
SRX1YKL086W MIT1P40002 666 aa14.57□□□□□ -0.08
SRX1YKL086W SKP1P52286 194 aa14.57□□□□□ -0.08
SRX1YKL086W YGR054WP53235 642 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SRX1YKL086W GCD1P09032 578 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SRX1YKL086W URA6P15700 204 aa14.56□□□□□ -0.08
SRX1YKL086W YCR101CP25607 182 aa14.56□□□□□ -0.08
SRX1YKL086W FCY21P40039 528 aa14.56□□□□□ -0.08
SRX1YKL086W IRC18P47056 224 aa14.56□□□□□ -0.08
SRX1YKL086W LIP2Q06005 328 aa14.56□□□□□ -0.08
SRX1YKL086W IRC25Q07951 179 aa14.56□□□□□ -0.08
SRX1YKL086W RPS31P05759 152 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SRX1YKL086W CHO1P08456 276 aa14.55□□□□□ -0.08
SRX1YKL086W ZUO1P32527 433 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SRX1YKL086W PRS2P38620 318 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SRX1YKL086W HPA3P39979 161 aa14.55□□□□□ -0.08
SRX1YKL086W UPS1Q05776 175 aa14.55□□□□□ -0.08
SRX1YKL086W KEI1Q06346 221 aa14.55□□□□□ -0.08
SRX1YKL086W RRP15Q06511 250 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SRX1YKL086W IPI1P38803 334 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SRX1YKL086W CAT5P41735 233 aa14.54□□□□□ -0.08
SRX1YKL086W YPL199CQ08954 240 aa14.54□□□□□ -0.08
SRX1YKL086W WHI5Q12416 295 aa14.54□□□□□ -0.08
SRX1YKL086W ATG40Q99325 256 aa14.54□□□□□ -0.08
SRX1YKL086W YDL009CQ12210 107 aa14.53□□□□□ -0.08
SRX1YKL086W YMR105W-AQ8TGS8 64 aa14.53□□□□□ -0.08
SRX1YKL086W ERG3P32353 365 aa14.52□□□□□ -0.09
SRX1YKL086W GPI18P38211 433 aa14.52□□□□□ -0.09
SRX1YKL086W CCS1P40202 249 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
SRX1YKL086W OTU1P43558 301 aa14.52□□□□□ -0.09
SRX1YKL086W GWT1P47026 490 aa14.52□□□□□ -0.09
SRX1YKL086W RFA1P22336 621 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SRX1YKL086W VMA3P25515 160 aa14.51□□□□□ -0.09
SRX1YKL086W MSS1P32559 526 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
SRX1YKL086W SEC66P33754 206 aa14.51□□□□□ -0.09
SRX1YKL086W AIM46P38885 310 aa14.51□□□□□ -0.09
SRX1YKL086W XPT1P47165 209 aa14.51□□□□□ -0.09
SRX1YKL086W YOR029WQ12243 111 aa14.51□□□□□ -0.09
SRX1YKL086W YLL053CP0CD98 152 aa14.5□□□□□ -0.09
SRX1YKL086W RNP1P32385 249 aa14.5□□□□□ -0.09
SRX1YKL086W IES6P32617 166 aa14.5□□□□□ -0.09
SRX1YKL086W FIG1P38224 298 aa14.5□□□□□ -0.09
SRX1YKL086W PIR5P46999 287 aa14.5□□□□□ -0.09
SRX1YKL086W ARG5,6Q01217 863 aa14.5□□□□□ -0.09
SRX1YKL086W UTP15Q04305 513 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
SRX1YKL086W YLR031WQ07978 186 aa14.5□□□□□ -0.09
SRX1YKL086W VMA11P32842 164 aa14.49□□□□□ -0.09
SRX1YKL086W HNT2P49775 206 aa14.49□□□□□ -0.09
SRX1YKL086W RFM1Q12192 310 aa14.49□□□□□ -0.09
SRX1YKL086W PUP1P25043 261 aa14.48□□□□□ -0.09
SRX1YKL086W TCA17P32613 152 aa14.48□□□□□ -0.09
SRX1YKL086W IMD3P50095 523 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
SRX1YKL086W RPL3P14126 387 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SRX1YKL086W IFM1P25038 676 aa14.47□□□□□ -0.09
SRX1YKL086W YHR122WP38829 231 aa14.47□□□□□ -0.09
SRX1YKL086W SPT14P32363 452 aa14.46□□□□□ -0.09
SRX1YKL086W RIB7P33312 244 aa14.46□□□□□ -0.09
SRX1YKL086W OKP1P53298 406 aa14.46□□□□□ -0.09
SRX1YKL086W GIM3P53900 129 aa14.46□□□□□ -0.09
SRX1YKL086W PRP11Q07350 266 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
SRX1YKL086W AAC1P04710 309 aa14.45□□□□□ -0.1
SRX1YKL086W RPB9P27999 122 aa14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 31.1 ms