RNA–Protein interactions for RNA: YJR104C

SOD1, Transcript of Cytosolic copper-zinc superoxide dismutase, yeast

Gene SOD1, Length 465 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOD1	YJR104C	VID24	P38263	362 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	GPI16	P38875	610 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	YEL057C	P39983	233 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	LRO1	P40345	661 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	AVT7	P40501	490 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	MET28	P40573	187 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	FKH2	P41813	862 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	IME4	P41833	600 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	IBA57	P47158	497 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	PEX31	P53203	462 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	APJ1	P53940	528 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	RHO4	Q00246	291 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	YKR011C	Q02209	353 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	GMC1	Q04399	608 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	EMI1	Q04406	187 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	ARG7	Q04728	441 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	RNH202	Q05635	350 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	HRD3	Q05787	833 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	TEN1	Q07921	160 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	COQ10	Q08058	207 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	IES4	Q08561	116 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.19	□□□□□ -1.9	not detected
SOD1	YJR104C	GPB1	Q08886	897 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	SRL2	Q12020	392 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	BTS1	Q12051	335 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	YPR027C	Q12079	277 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	SNF8	Q12483	233 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	DIF1	O13577	133 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	PRB1	P09232	635 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	TY2A-F	P0CX61	438 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	BOS1	P25385	244 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	RER1	P25560	188 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	YIH1	P25637	258 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	PRE4	P30657	266 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	HOG1	P32485	435 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	MKK1	P32490	508 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	YUH1	P35127	236 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	BNA4	P38169	460 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	YPC1	P38298	316 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	TRS20	P38334	175 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	CHL4	P38907	458 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	BDH1	P39714	382 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	HAT2	P39984	401 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	IRC22	P40006	225 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	QRI7	P43122	407 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	YHC3	P47040	408 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	AVT1	P47082	602 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	LCL3	P53153	274 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	YGR126W	P53274	230 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	RTT102	P53330	157 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	EOS1	P53938	366 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	YPL080C	Q02826	108 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	YML018C	Q03730	393 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	YDR132C	Q03900	495 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	YDR391C	Q04170	232 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	IPK1	Q06667	281 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	PAU23	Q07987	124 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	PER33	Q12144	273 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	UBX3	Q12229	455 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	PAU17	Q12370	124 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	SAL1	D6W196	494 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	MSW1	P04803	379 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	YFL068W	P0CX99	160 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	ANB1	P19211	157 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	TY2A-C	P25383	438 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	PCL2	P25693	308 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	SKN1	P33336	771 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	YKR073C	P36153	106 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	OMA1	P36163	345 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	MRPS9	P38120	278 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	SHE1	P38200	338 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	QDR3	P38227	689 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	YBR096W	P38256	230 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	YHL044W	P38727	235 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	CTF8	P38877	133 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	SPC25	P40014	221 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SOD1	YJR104C	ELO3	P40319	345 aa		3.17	□□□□□ -1.9

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 36.1 ms