RNA–Protein interactions for RNA: YHR167W

THP2, Transcript of Subunit of the THO and TREX complexes, yeastyeast

Gene THP2, Length 786 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
THP2YHR167W CUP9P41817 306 aa2.76□□□□□ -1.97
THP2YHR167W ALB1P47019 175 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
THP2YHR167W YGL262WP53054 175 aa2.76□□□□□ -1.97
THP2YHR167W PRM8P53174 237 aa2.76□□□□□ -1.97
THP2YHR167W YMD8Q03697 442 aa2.76□□□□□ -1.97
THP2YHR167W MGR3Q04472 501 aa2.76□□□□□ -1.97
THP2YHR167W GGA1Q06336 557 aa2.76□□□□□ -1.97
THP2YHR167W YLR413WQ06689 675 aa2.76□□□□□ -1.97
THP2YHR167W ATP16Q12165 160 aa2.76□□□□□ -1.97
THP2YHR167W IES3Q12345 250 aa2.76□□□□□ -1.97
THP2YHR167W HMS1Q12398 434 aa2.76□□□□□ -1.97
THP2YHR167W MRX4Q12467 430 aa2.76□□□□□ -1.97
THP2YHR167W FSH3Q99369 266 aa2.76□□□□□ -1.97
THP2YHR167W CCH1P50077 2039 aa2.76□□□□□ -1.97
THP2YHR167W YPR096CO13587 100 aa2.75□□□□□ -1.97
THP2YHR167W RPL23AP0CX41 137 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
THP2YHR167W RPL23BP0CX42 137 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
THP2YHR167W GAL3P13045 520 aa2.75□□□□□ -1.97
THP2YHR167W RPS1BP23248 255 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
THP2YHR167W HSP150P32478 413 aa2.75□□□□□ -1.97
THP2YHR167W ECT1P33412 323 aa2.75□□□□□ -1.97
THP2YHR167W MRPS9P38120 278 aa2.75□□□□□ -1.97
THP2YHR167W PEX32P38292 413 aa2.75□□□□□ -1.97
THP2YHR167W SNL1P40548 159 aa2.75□□□□□ -1.97
THP2YHR167W TIR3P40552 269 aa2.75□□□□□ -1.97
THP2YHR167W EFM3P47163 339 aa2.75□□□□□ -1.97
THP2YHR167W NQM1P53228 333 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
THP2YHR167W YGR067CP53243 804 aa2.75□□□□□ -1.97
THP2YHR167W VOA1P53262 265 aa2.75□□□□□ -1.97
THP2YHR167W YNR062CP53748 327 aa2.75□□□□□ -1.97
THP2YHR167W TMA20P89886 181 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
THP2YHR167W NUP49Q02199 472 aa2.75□□□□□ -1.97
THP2YHR167W SWP1Q02795 286 aa2.75□□□□□ -1.97
THP2YHR167W MAK3Q03503 176 aa2.75□□□□□ -1.97
THP2YHR167W COX20Q04935 205 aa2.75□□□□□ -1.97
THP2YHR167W ATG17Q06410 417 aa2.75□□□□□ -1.97
THP2YHR167W MEU1Q07938 337 aaKnown RBP RIP-Chip data2.75□□□□□ -1.97not detected
THP2YHR167W BTS1Q12051 335 aa2.75□□□□□ -1.97
THP2YHR167W FOL3Q12676 427 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
THP2YHR167W VPS13Q07878 3144 aa2.75□□□□□ -1.97
THP2YHR167W YFR010W-AP0C5N0 62 aa2.74□□□□□ -1.97
THP2YHR167W IDP1P21954 428 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
THP2YHR167W RPL24BP24000 155 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
THP2YHR167W ITR2P30606 609 aa2.74□□□□□ -1.97
THP2YHR167W YHR180WP38868 163 aa2.74□□□□□ -1.97
THP2YHR167W AVT6P40074 448 aa2.74□□□□□ -1.97
THP2YHR167W YIL086CP40503 102 aa2.74□□□□□ -1.97
THP2YHR167W NAS2P40555 220 aa2.74□□□□□ -1.97
THP2YHR167W MSS2P40990 351 aa2.74□□□□□ -1.97
THP2YHR167W NUP57P48837 541 aa2.74□□□□□ -1.97
THP2YHR167W YGR266WP53326 701 aa2.74□□□□□ -1.97
THP2YHR167W DML1Q03652 475 aa2.74□□□□□ -1.97
THP2YHR167W SNX41Q04053 625 aa2.74□□□□□ -1.97
THP2YHR167W SMP3Q04174 516 aa2.74□□□□□ -1.97
THP2YHR167W FSH2Q05015 223 aa2.74□□□□□ -1.97
THP2YHR167W RNH202Q05635 350 aa2.74□□□□□ -1.97
THP2YHR167W SEI1Q06058 285 aa2.74□□□□□ -1.97
THP2YHR167W YLR446WQ06204 433 aa2.74□□□□□ -1.97
THP2YHR167W YPR172WQ06608 200 aa2.74□□□□□ -1.97
THP2YHR167W RRT8Q08219 342 aa2.74□□□□□ -1.97
THP2YHR167W BRX1Q08235 291 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
THP2YHR167W UIP4Q08926 304 aa2.74□□□□□ -1.97
THP2YHR167W SPC3Q12133 184 aa2.74□□□□□ -1.97
THP2YHR167W MDM32Q12171 622 aa2.74□□□□□ -1.97
THP2YHR167W NFI1Q12216 726 aa2.74□□□□□ -1.97
THP2YHR167W RPL40AP0CH08 128 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
THP2YHR167W RPL40BP0CH09 128 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
THP2YHR167W CTA1P15202 515 aa2.73□□□□□ -1.97
THP2YHR167W HSP30P25619 332 aa2.73□□□□□ -1.97
THP2YHR167W IDH1P28834 360 aaKnown RBP RIP-Chip data2.73□□□□□ -1.97not detected
THP2YHR167W LDS1P31379 325 aa2.73□□□□□ -1.97
THP2YHR167W ASF2P32448 525 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
THP2YHR167W ZUO1P32527 433 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
THP2YHR167W PDC2P32896 925 aa2.73□□□□□ -1.97
THP2YHR167W YKR015CP36111 568 aa2.73□□□□□ -1.97
THP2YHR167W YBR241CP38142 488 aa2.73□□□□□ -1.97
THP2YHR167W MPM1P40364 252 aa2.73□□□□□ -1.97
THP2YHR167W ICE2P40499 491 aa2.73□□□□□ -1.97
THP2YHR167W YFR054CP43622 192 aa2.73□□□□□ -1.97
THP2YHR167W BAT2P47176 376 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
THP2YHR167W MPC1P53157 130 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
THP2YHR167W PXR1P53335 271 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
THP2YHR167W MPA43P53583 542 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
THP2YHR167W PDR16P53860 351 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
THP2YHR167W ASI3P53983 676 aa2.73□□□□□ -1.97
THP2YHR167W YLR460CP54007 376 aa2.73□□□□□ -1.97
THP2YHR167W YMR099CQ03161 297 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
THP2YHR167W PIN3Q06449 215 aa2.73□□□□□ -1.97
THP2YHR167W HRT1Q08273 121 aa2.73□□□□□ -1.97
THP2YHR167W AKR2Q12013 749 aa2.73□□□□□ -1.97
THP2YHR167W YOR214CQ12282 236 aa2.73□□□□□ -1.97
THP2YHR167W YOL162WP0CF19 215 aa2.72□□□□□ -1.97
THP2YHR167W MIR1P23641 311 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
THP2YHR167W PMT2P31382 759 aa2.72□□□□□ -1.97
THP2YHR167W ARO7P32178 256 aa2.72□□□□□ -1.97
THP2YHR167W MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data2.72□□□□□ -1.97not detected
THP2YHR167W YOR062CP36025 268 aa2.72□□□□□ -1.97
THP2YHR167W JEN1P36035 616 aa2.72□□□□□ -1.97
THP2YHR167W RIB1P38066 345 aa2.72□□□□□ -1.97
THP2YHR167W SHE1P38200 338 aa2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 22 ms