RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W FSH3Q99369 266 aa7.65□□□□□ -1.18
DDI1YER143W ARO3P14843 370 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
DDI1YER143W STF2P16965 84 aa7.64□□□□□ -1.19
DDI1YER143W HNM1P19807 563 aa7.64□□□□□ -1.19
DDI1YER143W UTP30P36144 274 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
DDI1YER143W GWT1P47026 490 aa7.64□□□□□ -1.19
DDI1YER143W GPG1P53130 126 aa7.64□□□□□ -1.19
DDI1YER143W NGL2Q03264 515 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
DDI1YER143W CRR1Q05790 422 aa7.64□□□□□ -1.19
DDI1YER143W RFU1Q08003 200 aa7.64□□□□□ -1.19
DDI1YER143W COX17Q12287 69 aa7.64□□□□□ -1.19
DDI1YER143W SAG1P20840 650 aa7.63□□□□□ -1.19
DDI1YER143W RFA1P22336 621 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
DDI1YER143W PEX4P29340 183 aa7.63□□□□□ -1.19
DDI1YER143W MCH2P36032 473 aa7.63□□□□□ -1.19
DDI1YER143W ARC40P38328 384 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
DDI1YER143W FLX1P40464 311 aa7.63□□□□□ -1.19
DDI1YER143W DLT1Q04216 342 aa7.63□□□□□ -1.19
DDI1YER143W MRL1Q06815 381 aa7.63□□□□□ -1.19
DDI1YER143W YLR125WQ12138 136 aa7.63□□□□□ -1.19
DDI1YER143W RDI1Q12434 202 aa7.63□□□□□ -1.19
DDI1YER143W ERP4Q12450 207 aa7.63□□□□□ -1.19
DDI1YER143W CUP1-1P0CX80 61 aa7.62□□□□□ -1.19
DDI1YER143W CUP1-2P0CX81 61 aa7.62□□□□□ -1.19
DDI1YER143W SAR1P20606 190 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
DDI1YER143W CPR4P25334 318 aa7.62□□□□□ -1.19
DDI1YER143W RFA3P26755 122 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
DDI1YER143W YKL063CP35725 167 aa7.62□□□□□ -1.19
DDI1YER143W RSM27P53305 110 aa7.62□□□□□ -1.19
DDI1YER143W VBA1Q04301 562 aa7.62□□□□□ -1.19
DDI1YER143W SYM1Q06563 197 aa7.62□□□□□ -1.19
DDI1YER143W RRS1Q08746 203 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
DDI1YER143W URA3P03962 267 aa7.61□□□□□ -1.19
DDI1YER143W RPP1AP05318 106 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
DDI1YER143W MET3P08536 511 aa7.61□□□□□ -1.19
DDI1YER143W GCD1P09032 578 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
DDI1YER143W PUT1P09368 476 aa7.61□□□□□ -1.19
DDI1YER143W MSI1P13712 422 aa7.61□□□□□ -1.19
DDI1YER143W IFM1P25038 676 aa7.61□□□□□ -1.19
DDI1YER143W YCR016WP25617 290 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
DDI1YER143W GLC7P32598 312 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
DDI1YER143W YBL010CP32788 280 aa7.61□□□□□ -1.19
DDI1YER143W CLB6P32943 380 aa7.61□□□□□ -1.19
DDI1YER143W LSM1P47017 172 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
DDI1YER143W SSN8P47821 323 aa7.61□□□□□ -1.19
DDI1YER143W SKP1P52286 194 aa7.61□□□□□ -1.19
DDI1YER143W UFD1P53044 361 aa7.61□□□□□ -1.19
DDI1YER143W NRG1Q03125 231 aa7.61□□□□□ -1.19
DDI1YER143W PET20Q99373 253 aa7.61□□□□□ -1.19
DDI1YER143W MEC1P38111 2368 aa7.61□□□□□ -1.19
DDI1YER143W ARG80P07249 177 aa7.6□□□□□ -1.19
DDI1YER143W MLF3P32047 452 aa7.6□□□□□ -1.19
DDI1YER143W GTF1P53260 183 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
DDI1YER143W OKP1P53298 406 aa7.6□□□□□ -1.19
DDI1YER143W SMX3P54999 86 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
DDI1YER143W ARG5,6Q01217 863 aa7.6□□□□□ -1.19
DDI1YER143W YPL077CQ02831 240 aa7.6□□□□□ -1.19
DDI1YER143W RPL35AP0CX84 120 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
DDI1YER143W RPL35BP0CX85 120 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
DDI1YER143W CDC34P14682 295 aa7.59□□□□□ -1.19
DDI1YER143W CKS1P20486 150 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
DDI1YER143W TRR1P29509 319 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
DDI1YER143W FIG1P38224 298 aa7.59□□□□□ -1.19
DDI1YER143W YER079WP40052 210 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
DDI1YER143W EGT2P42835 1041 aa7.59□□□□□ -1.19
DDI1YER143W LAP3Q01532 483 aaKnown RBP RIP-Chip data7.59□□□□□ -1.19not detected
DDI1YER143W ACS1Q01574 713 aa7.59□□□□□ -1.19
DDI1YER143W YPR098CQ06089 161 aa7.59□□□□□ -1.19
DDI1YER143W TDA6Q06466 467 aa7.59□□□□□ -1.19
DDI1YER143W GAT3Q07928 141 aa7.59□□□□□ -1.19
DDI1YER143W RNH203Q12338 110 aa7.59□□□□□ -1.19
DDI1YER143W TRM13Q12383 476 aa7.59□□□□□ -1.19
DDI1YER143W MPD1Q12404 318 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
DDI1YER143W YPR053CQ6Q5F3 151 aa7.59□□□□□ -1.19
DDI1YER143W SSA3P09435 649 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
DDI1YER143W YLL053CP0CD98 152 aa7.58□□□□□ -1.2
DDI1YER143W FAT1P38225 669 aa7.58□□□□□ -1.2
DDI1YER143W RRF1P38771 230 aa7.58□□□□□ -1.2
DDI1YER143W PIG2P40187 538 aa7.58□□□□□ -1.2
DDI1YER143W TOK1P40310 691 aa7.58□□□□□ -1.2
DDI1YER143W YIL029CP40538 142 aa7.58□□□□□ -1.2
DDI1YER143W GNA1P43577 159 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
DDI1YER143W YDC1Q02896 317 aa7.58□□□□□ -1.2
DDI1YER143W YML018CQ03730 393 aa7.58□□□□□ -1.2
DDI1YER143W YOR186WQ08560 144 aa7.58□□□□□ -1.2
DDI1YER143W REP2P03872 296 aa7.57□□□□□ -1.2
DDI1YER143W MRP17P28778 131 aa7.57□□□□□ -1.2
DDI1YER143W ERG3P32353 365 aa7.57□□□□□ -1.2
DDI1YER143W PAN3P36102 679 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
DDI1YER143W YGP1P38616 354 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
DDI1YER143W VMA22P38784 181 aa7.57□□□□□ -1.2
DDI1YER143W ARO9P38840 513 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
DDI1YER143W GIM3P53900 129 aa7.57□□□□□ -1.2
DDI1YER143W PIN3Q06449 215 aa7.57□□□□□ -1.2
DDI1YER143W OCH1P31755 480 aa7.56□□□□□ -1.2
DDI1YER143W YOX1P34161 385 aa7.56□□□□□ -1.2
DDI1YER143W POP8P38208 133 aa7.56□□□□□ -1.2
DDI1YER143W YBR197CP38306 217 aa7.56□□□□□ -1.2
DDI1YER143W YBR220CP38318 560 aa7.56□□□□□ -1.2
DDI1YER143W UBC13P52490 153 aa7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 88.6 ms