RNA–Protein interactions for RNA: YOR033C

EXO1, Transcript of 5'-3' exonuclease and flap-endonuclease, yeast

Gene EXO1, Length 2,109 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EXO1	YOR033C	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	GAC1	P28006	793 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	NTH1	P32356	751 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	MRPL6	P32904	214 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	SDH3	P33421	198 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	YHR130C	P38834	111 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	SRP14	P38985	146 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	SFH5	P47008	294 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	NIF3	P53081	288 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	LST7	P53237	242 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	VBA1	Q04301	562 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	CAB1	Q04430	367 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	PIN3	Q06449	215 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	SHS1	Q07657	551 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	BI3	Q9ZZW7	517 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	RIF1	P29539	1916 aa		4.7	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	PAI3	P01094	68 aa		4.69	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	ATP10	P18496	279 aa		4.69	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.69	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	SFC1	P33303	322 aa		4.69	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	RIB1	P38066	345 aa		4.69	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	JHD1	P40034	492 aa		4.69	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	MUP1	P50276	574 aa		4.69	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	SDT1	P53078	280 aa		4.69	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	RSM10	Q03201	203 aa		4.69	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	LDS2	Q08218	356 aa		4.69	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	MET32	Q12041	191 aa		4.69	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	NUS1	Q12063	375 aa		4.69	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	YLL056C	Q12177	298 aa		4.69	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	WTM2	Q12206	467 aa		4.69	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		4.69	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	COX3	P00420	269 aa		4.69	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		4.69	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	OCH1	P31755	480 aa		4.69	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	TMT1	P32643	299 aa		4.69	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	GEX2	P36173	615 aa		4.69	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	PAC2	P39937	518 aa		4.69	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	YFL052W	P43551	465 aa		4.69	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	GCV1	P48015	400 aa		4.69	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	CDC55	Q00362	526 aa		4.69	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	PRM6	Q04705	352 aa		4.69	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	YCT1	Q12235	531 aa		4.69	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	LAS17	Q12446	633 aa		4.69	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	HUT1	Q12520	339 aa		4.69	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	APC1	P53886	1748 aa		4.68	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	YCL068C	P25593	260 aa		4.68	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	MIG1	P27705	504 aa		4.68	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	PPA2	P28239	310 aa		4.68	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	PMU1	P36069	295 aa		4.68	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	MRPL16	P38064	232 aa		4.68	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	YHR210C	P38893	341 aa		4.68	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	MET30	P39014	640 aa		4.68	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	SSN3	P39073	555 aa		4.68	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	ARG2	P40360	574 aa		4.68	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	YFL054C	P43549	646 aa		4.68	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	ERG25	P53045	309 aa		4.68	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	NSG2	P53898	299 aa		4.68	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	UBC7	Q02159	165 aa		4.68	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	YKR011C	Q02209	353 aa		4.68	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	CAB5	Q03941	241 aa		4.68	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	MRX8	Q05473	314 aa		4.68	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	RDI1	Q12434	202 aa		4.68	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	MOT1	P32333	1867 aa		4.68	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	CUP2	P15315	225 aa		4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	MRP17	P28778	131 aa		4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	TOA2	P32774	122 aa		4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	EMP70	P32802	667 aa		4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	GCS1	P35197	352 aa		4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	YKL151C	P36059	337 aa		4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	RRG9	P40156	214 aa		4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	AVT7	P40501	490 aa		4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	PAU15	P40585	124 aa		4.67	□□□□□ -1.66
EXO1	YOR033C	BUL1	P48524	976 aa		4.67	□□□□□ -1.66

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