RNA–Protein interactions for RNA: YHR195W

NVJ1, Transcript of Nuclear envelope protein, yeast

Gene NVJ1, Length 966 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NVJ1	YHR195W	TPO4	Q12256	659 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	HMS1	Q12398	434 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	RDI1	Q12434	202 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	YPR064W	Q12492	139 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	YOR1	P53049	1477 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	TFS1	P14306	219 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	AAT2	P23542	418 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	QRI5	P32344	111 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	OPY1	P38271	328 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	WSC4	P38739	605 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	OXA1	P39952	402 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	RRG9	P40156	214 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	YNL320W	P42840	284 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	CPR7	P47103	393 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	MAL13	P53338	473 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	YLR152C	P54072	576 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	YDR476C	Q03362	224 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	YPR098C	Q06089	161 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	SFH1	Q06168	426 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	DAS2	Q12084	232 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	AGC1	Q12482	902 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	SNT2	P53127	1403 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	POF1	P25576	258 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	YKL187C	P34231	750 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	KRE29	P40026	464 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	ALG13	P53178	202 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	CSN9	Q03981	162 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	GRX8	Q05926	109 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	DBF2	P22204	572 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	PPH21	P23594	369 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	INO2	P26798	304 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	PMT2	P31382	759 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	MRPL28	P36527	147 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	SDS24	P38314	527 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	EFM1	P38732	585 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	GOS1	P38736	223 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	YER186C	P40101	306 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	GDS1	P41913	522 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	ARL3	Q02804	198 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	YLR030W	Q07967	263 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	FRE8	Q12209	686 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	IES3	Q12345	250 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	HRT3	Q12347	344 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	SLO1	Q3E784	85 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	CTA1	P15202	515 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	IFM1	P25038	676 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	TRX3	P25372	127 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	UBC8	P28263	218 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	MIG3	P39943	394 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	MOB2	P43563	287 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	FAR7	P43592	221 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	PEX31	P53203	462 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	PDR17	P53844	350 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	TMA20	P89886	181 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	YMR279C	Q03263	540 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	RAV2	Q03956	351 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	YET2	Q04210	160 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	SDH7	Q04401	133 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	FSH2	Q05015	223 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	LIP2	Q06005	328 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	FRQ1	Q06389	190 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	ATP16	Q12165	160 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	ATP14	Q12349	124 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	TFC7	Q12415	435 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NVJ1	YHR195W	SIR4	P11978	1358 aa		4.03	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.4 ms