RNA–Protein interactions for RNA: YBL037W

APL3, Transcript of Alpha-adaptin, yeastyeast

Gene APL3, Length 3,078 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
APL3YBL037W AI5_BETAQ9ZZX0 354 aa0.97□□□□□ -2.25
APL3YBL037W COX2P00410 251 aa0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W POX1P13711 748 aa0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W POL30P15873 258 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W FUS3P16892 353 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W CPT1P17898 393 aa0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W PHO80P20052 293 aa0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W BMH1P29311 267 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W AST1P35183 429 aa0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W GPX1P36014 167 aa0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W YBR062CP38239 180 aa0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W MBA1P38300 278 aa0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W NPT1P39683 429 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W ECO1P43605 281 aa0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W YPL113CQ02961 396 aa0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W GOT1Q03554 138 aa0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W SDO1Q07953 250 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W YDL211CQ12121 372 aa0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W TY3A-GQ12173 290 aa0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W TY3A-IQ99219 290 aa0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W TPI1P00942 248 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W PET494P07390 489 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W MSF1P08425 469 aa0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W NHP6BP11633 99 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W CUP2P15315 225 aa0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W SSO1P32867 290 aa0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W MED8P38304 223 aa0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W RRG9P40156 214 aa0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W YIL059CP40520 121 aa0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W TPN1P53099 579 aa0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W YGR067CP53243 804 aa0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W YNL095CP53932 642 aa0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W SRL4Q03085 281 aa0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W RNH1Q04740 348 aa0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W BOP2Q06150 570 aa0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W RRP40Q08285 240 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W SGT2Q12118 346 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W TIR4Q12218 487 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W YDL012CQ12489 107 aa0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W DFM1Q12743 341 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W SEY1Q99287 776 aa0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W SIR4P11978 1358 aa0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W PDR11P40550 1411 aa0.96□□□□□ -2.26
APL3YBL037W YAK1P14680 807 aa0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W RPB9P27999 122 aa0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W DBP7P36120 742 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W POP8P38208 133 aa0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W TRR2P38816 342 aa0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W BFR1P38934 470 aaKnown RBP RIP-Chip data0.95□□□□□ -2.26not detected
APL3YBL037W YMR144WP40214 342 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W IBA57P47158 497 aa0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W NIF3P53081 288 aa0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W MAL13P53338 473 aa0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W YNL040WP53960 456 aaPredicted RBP0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W ACT1P60010 375 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W BNA7Q04066 261 aa0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W YDR124WQ04608 324 aa0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W DXO1Q06349 442 aa0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W YDL144CQ07589 356 aa0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W MSH5Q12175 901 aa0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W ISD11Q6Q560 94 aa0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W YCR025CP25352 136 aa0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W QRI5P32344 111 aa0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W ARO4P32449 370 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W JEN1P36035 616 aa0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W MAL32P38158 584 aa0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W DED81P38707 554 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W YER085CP40058 173 aa0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W RTR1P40084 226 aaPredicted RBP0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W YAR1P46683 200 aa0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W NBP1P52919 319 aaPredicted RBP0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W MAL12P53341 584 aa0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W MYO5Q04439 1219 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W GTO3Q04806 366 aa0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W HEM25Q07534 307 aa0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W RLP24Q07915 199 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W YBL008W-AQ3E821 79 aa0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W RPB4P20433 221 aaPredicted RBP0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W LDB7P38210 180 aa0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W GCN20P43535 752 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W ILM1P47155 203 aa0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W HSH155P49955 971 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W ALG9P53868 555 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W YML108WQ03759 105 aa0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W GRX3Q03835 250 aa0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W ECM19Q06011 112 aa0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W CSM4Q08955 156 aa0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W YPR063CQ12160 140 aa0.95□□□□□ -2.26
APL3YBL037W MRX3P38172 270 aa0.94□□□□□ -2.26
APL3YBL037W ATG12P38316 186 aa0.94□□□□□ -2.26
APL3YBL037W YHR127WP38833 243 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
APL3YBL037W PRE6P40303 254 aaKnown RBP0.94□□□□□ -2.26
APL3YBL037W SYS1P41544 203 aa0.94□□□□□ -2.26
APL3YBL037W NSA1P53136 463 aaPredicted RBP0.94□□□□□ -2.26
APL3YBL037W SMD1Q02260 146 aaPredicted RBP0.94□□□□□ -2.26
APL3YBL037W TVP15Q03860 143 aa0.94□□□□□ -2.26
APL3YBL037W RFM1Q12192 310 aa0.94□□□□□ -2.26
APL3YBL037W YCT1Q12235 531 aa0.94□□□□□ -2.26
APL3YBL037W MRX4Q12467 430 aa0.94□□□□□ -2.26
APL3YBL037W SNF8Q12483 233 aa0.94□□□□□ -2.26
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