RNA–Protein interactions for RNA: YMR001C-A

YMR001C-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR001C-A, Length 231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR001C-AYMR001C-A CYT2Q00873 224 aa0.5□□□□□ -2.33
YMR001C-AYMR001C-A RCF1Q03713 159 aa0.5□□□□□ -2.33
YMR001C-AYMR001C-A ATC1Q04005 294 aa0.5□□□□□ -2.33
YMR001C-AYMR001C-A RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
YMR001C-AYMR001C-A RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
YMR001C-AYMR001C-A MDH2P22133 377 aa0.49□□□□□ -2.33
YMR001C-AYMR001C-A SLD7Q08457 257 aa0.49□□□□□ -2.33
YMR001C-AYMR001C-A ATO3Q12359 275 aa0.49□□□□□ -2.33
YMR001C-AYMR001C-A DSF1P0CX08 502 aa0.48□□□□□ -2.33
YMR001C-AYMR001C-A YNR073CP0CX09 502 aa0.48□□□□□ -2.33
YMR001C-AYMR001C-A ECM13P38195 257 aa0.48□□□□□ -2.33
YMR001C-AYMR001C-A VTC1P40046 129 aaRIP-Chip data0.48□□□□□ -2.33not detected
YMR001C-AYMR001C-A DBP6P53734 629 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
YMR001C-AYMR001C-A TRM44Q02648 567 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
YMR001C-AYMR001C-A YLR297WQ05899 129 aa0.48□□□□□ -2.33
YMR001C-AYMR001C-A YAL064W-BO13512 126 aa0.47□□□□□ -2.33
YMR001C-AYMR001C-A SWI3P32591 825 aa0.47□□□□□ -2.33
YMR001C-AYMR001C-A YHL049CP38722 271 aa0.47□□□□□ -2.33
YMR001C-AYMR001C-A YHR022CP38763 256 aa0.47□□□□□ -2.33
YMR001C-AYMR001C-A DOG1P38774 246 aa0.47□□□□□ -2.33
YMR001C-AYMR001C-A ASI3P53983 676 aa0.47□□□□□ -2.33
YMR001C-AYMR001C-A CTR3Q06686 241 aa0.47□□□□□ -2.33
YMR001C-AYMR001C-A CDC40P40968 455 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A AGP3P43548 558 aa0.46□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A SEC10Q06245 871 aa0.46□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A AI5_BETAQ9ZZX0 354 aa0.46□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A ILV1P00927 576 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A RPL4AP10664 362 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A ICL1P28240 557 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A RCN1P36054 211 aa0.45□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A PHO88P38264 188 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A RPL37AP49166 88 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A RPL4BP49626 362 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A VPS20Q04272 221 aa0.45□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A PEX10Q05568 337 aa0.45□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A YPR011CQ12251 326 aa0.45□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A DDI2P0CH63 225 aa0.44□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A DDI3P0CH64 225 aa0.44□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A CWP1P28319 239 aa0.44□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A PEX3P28795 441 aa0.44□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A UIP5P36137 443 aa0.44□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A TDA11P38854 504 aa0.44□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A SSO2P39926 295 aa0.44□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A ERG25P53045 309 aa0.44□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A ABZ2Q03266 374 aa0.44□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A MEU1Q07938 337 aaKnown RBP RIP-Chip data0.44□□□□□ -2.34not detected
YMR001C-AYMR001C-A GPI12P23797 304 aa0.43□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A RCY1P39531 840 aa0.43□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A PRM9P39551 298 aa0.43□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A AVT2P39981 480 aa0.43□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A SFH1Q06168 426 aa0.43□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A YLR162WQ06235 118 aa0.43□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A GPN3Q06543 272 aa0.43□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A YOS9Q99220 542 aa0.43□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A YER188C-AP0C0V2 99 aa0.42□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A PET18P25362 215 aa0.42□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A PRS4P38063 326 aaPredicted RBP0.42□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A HEK2P38199 381 aaKnown RBP RIP-Chip data0.42□□□□□ -2.34not detected
YMR001C-AYMR001C-A CTR2P38865 189 aa0.42□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A SHC1P39000 512 aa0.42□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A SLX9P53251 210 aaPredicted RBP0.42□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A CPD1P53314 239 aa0.42□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A CDC14Q00684 551 aa0.42□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A RIO1Q12196 484 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A BBP1Q12365 385 aa0.42□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A Q0255P03881 472 aa0.41□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A RPP0P05317 312 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data0.41□□□□□ -2.34not detected
YMR001C-AYMR001C-A RPL13BP40212 199 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A NBP35P52920 328 aa0.41□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A VOA1P53262 265 aa0.41□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A BUD25P85052 153 aa0.41□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A YLR179CQ06252 201 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A BER1Q06688 274 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A AKR2Q12013 749 aa0.41□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP0.41□□□□□ -2.34
YMR001C-AYMR001C-A RPC40P07703 335 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
YMR001C-AYMR001C-A SEC22P22214 214 aa0.4□□□□□ -2.35
YMR001C-AYMR001C-A CSM1P25651 190 aa0.4□□□□□ -2.35
YMR001C-AYMR001C-A UPS2P35200 230 aa0.4□□□□□ -2.35
YMR001C-AYMR001C-A HIS2P38635 335 aa0.4□□□□□ -2.35
YMR001C-AYMR001C-A ARC15P40518 154 aaRIP-Chip data0.4□□□□□ -2.35not detected
YMR001C-AYMR001C-A LOH1P47055 219 aa0.4□□□□□ -2.35
YMR001C-AYMR001C-A SWS2P53937 143 aa0.4□□□□□ -2.35
YMR001C-AYMR001C-A YNL050CP53952 270 aa0.4□□□□□ -2.35
YMR001C-AYMR001C-A VBA1Q04301 562 aa0.4□□□□□ -2.35
YMR001C-AYMR001C-A VAC14Q06708 880 aa0.4□□□□□ -2.35
YMR001C-AYMR001C-A FLO9P39712 1322 aa0.39□□□□□ -2.35
YMR001C-AYMR001C-A VAR1P02381 398 aa0.39□□□□□ -2.35
YMR001C-AYMR001C-A UGA1P17649 471 aa0.39□□□□□ -2.35
YMR001C-AYMR001C-A KDX1P36005 433 aa0.39□□□□□ -2.35
YMR001C-AYMR001C-A TCD1P38756 429 aa0.39□□□□□ -2.35
YMR001C-AYMR001C-A YHR125WP38831 101 aa0.39□□□□□ -2.35
YMR001C-AYMR001C-A YGR219WP53307 113 aa0.39□□□□□ -2.35
YMR001C-AYMR001C-A EMP46Q12396 444 aa0.39□□□□□ -2.35
YMR001C-AYMR001C-A CPA1P07258 411 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
YMR001C-AYMR001C-A SAR1P20606 190 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
YMR001C-AYMR001C-A POF1P25576 258 aa0.38□□□□□ -2.35
YMR001C-AYMR001C-A OAC1P32332 324 aa0.38□□□□□ -2.35
YMR001C-AYMR001C-A RPC25P35718 212 aa0.38□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 38.1 ms