RNA–Protein interactions for RNA: YKL136W

YKL136W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YKL136W, Length 399 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL136W	YKL136W	OST2	P46964	130 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	MAL12	P53341	584 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	RCF1	Q03713	159 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	MRPS8	Q03799	155 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	VPS20	Q04272	221 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	BOP2	Q06150	570 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	CSI2	Q08054	341 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	MHT1	Q12525	324 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		0.25	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	DDI2	P0CH63	225 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	DDI3	P0CH64	225 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	MDH2	P22133	377 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	PEX3	P28795	441 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	0.24	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	YHL049C	P38722	271 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	AGP3	P43548	558 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	NBP35	P52920	328 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	SWS2	P53937	143 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	YNL050C	P53952	270 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	CDC14	Q00684	551 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	CYT2	Q00873	224 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	0.24	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	PRM15	Q03262	622 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	YLR162W	Q06235	118 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	SEC10	Q06245	871 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.24	□□□□□ -2.37	not detected
YKL136W	YKL136W	POM33	Q12164	279 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	PST1	Q12355	444 aa		0.24	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	PET18	P25362	215 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	UPS2	P35200	230 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	0.23	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	YHR022C	P38763	256 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	END3	P39013	349 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	PRM9	P39551	298 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	SSO2	P39926	295 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	YIA6	P40556	373 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	0.23	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	YGL034C	P53186	121 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	PEX31	P53203	462 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	YLR297W	Q05899	129 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	EMP46	Q12396	444 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	YOS9	Q99220	542 aa		0.23	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	COX5A	P00424	153 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	Q0255	P03881	472 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	UGA1	P17649	471 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	GPI12	P23797	304 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.22	□□□□□ -2.37	not detected
YKL136W	YKL136W	SMI1	P32566	505 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	RCN1	P36054	211 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	PRM10	P42946	383 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	LOH1	P47055	219 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	ASI3	P53983	676 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	VBA1	Q04301	562 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	VAC14	Q06708	880 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	AKR2	Q12013	749 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	YPR011C	Q12251	326 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	ATO3	Q12359	275 aa		0.22	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	0.22	□□□□□ -2.37
YKL136W	YKL136W	SEC22	P22214	214 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YKL136W	YKL136W	CWP1	P28319	239 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YKL136W	YKL136W	OAC1	P32332	324 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YKL136W	YKL136W	SWI3	P32591	825 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YKL136W	YKL136W	KDX1	P36005	433 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YKL136W	YKL136W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
YKL136W	YKL136W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.21	□□□□□ -2.38	not detected
YKL136W	YKL136W	HIS2	P38635	335 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YKL136W	YKL136W	TCD1	P38756	429 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YKL136W	YKL136W	APE4	P38821	490 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YKL136W	YKL136W	YHR125W	P38831	101 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YKL136W	YKL136W	VPS45	P38932	577 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YKL136W	YKL136W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	0.21	□□□□□ -2.38	not detected
YKL136W	YKL136W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	0.21	□□□□□ -2.38	not detected
YKL136W	YKL136W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	0.21	□□□□□ -2.38
YKL136W	YKL136W	YGL185C	P53100	379 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YKL136W	YKL136W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	0.21	□□□□□ -2.38
YKL136W	YKL136W	ABZ2	Q03266	374 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YKL136W	YKL136W	RRG8	Q06109	277 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YKL136W	YKL136W	SFH1	Q06168	426 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YKL136W	YKL136W	CUR1	Q06469	252 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YKL136W	YKL136W	ARV1	Q06541	321 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YKL136W	YKL136W	GPN3	Q06543	272 aa		0.21	□□□□□ -2.38
YKL136W	YKL136W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	0.21	□□□□□ -2.38
YKL136W	YKL136W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
YKL136W	YKL136W	VAR1	P02381	398 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YKL136W	YKL136W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
YKL136W	YKL136W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
YKL136W	YKL136W	POF1	P25576	258 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YKL136W	YKL136W	RPC25	P35718	212 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YKL136W	YKL136W	PEX18	P38855	283 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YKL136W	YKL136W	SHC1	P39000	512 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YKL136W	YKL136W	YKE4	P40544	346 aa		0.2	□□□□□ -2.38
YKL136W	YKL136W	RPL37A	P49166	88 aa	Known RBP	0.2	□□□□□ -2.38
YKL136W	YKL136W	ERG25	P53045	309 aa		0.2	□□□□□ -2.38

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