RNA–Protein interactions for RNA: YER148W

SPT15, Transcript of TATA-binding protein, yeastyeast

Gene SPT15, Length 723 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT15YER148W APJ1P53940 528 aa2.81□□□□□ -1.96
SPT15YER148W YPL080CQ02826 108 aa2.81□□□□□ -1.96
SPT15YER148W ABZ2Q03266 374 aa2.81□□□□□ -1.96
SPT15YER148W YMR244WQ04018 355 aa2.81□□□□□ -1.96
SPT15YER148W YPR1Q12458 312 aa2.81□□□□□ -1.96
SPT15YER148W PRM7Q12459 698 aa2.81□□□□□ -1.96
SPT15YER148W BI3Q9ZZW7 517 aa2.81□□□□□ -1.96
SPT15YER148W YKR104WP0CE69 306 aa2.8□□□□□ -1.96
SPT15YER148W ERD1P16151 362 aa2.8□□□□□ -1.96
SPT15YER148W SAR1P20606 190 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
SPT15YER148W DAL81P21657 970 aa2.8□□□□□ -1.96
SPT15YER148W MRPL20P22354 195 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
SPT15YER148W RPL5P26321 297 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
SPT15YER148W ZRT1P32804 376 aa2.8□□□□□ -1.96
SPT15YER148W COS4P43542 379 aa2.8□□□□□ -1.96
SPT15YER148W PRP24P49960 444 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
SPT15YER148W VOA1P53262 265 aa2.8□□□□□ -1.96
SPT15YER148W RRG8Q06109 277 aa2.8□□□□□ -1.96
SPT15YER148W ATG10Q07879 167 aa2.8□□□□□ -1.96
SPT15YER148W VIK1Q12045 647 aa2.8□□□□□ -1.96
SPT15YER148W YDL211CQ12121 372 aa2.8□□□□□ -1.96
SPT15YER148W UTP23Q12339 254 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
SPT15YER148W GIS3Q12418 502 aa2.8□□□□□ -1.96
SPT15YER148W CAR2P07991 424 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
SPT15YER148W CPT1P17898 393 aa2.79□□□□□ -1.96
SPT15YER148W IFM1P25038 676 aa2.79□□□□□ -1.96
SPT15YER148W AGA2P32781 87 aa2.79□□□□□ -1.96
SPT15YER148W YMR262WP38430 313 aa2.79□□□□□ -1.96
SPT15YER148W COX16P47081 118 aa2.79□□□□□ -1.96
SPT15YER148W NBP35P52920 328 aa2.79□□□□□ -1.96
SPT15YER148W YLR446WQ06204 433 aa2.79□□□□□ -1.96
SPT15YER148W VAC14Q06708 880 aa2.79□□□□□ -1.96
SPT15YER148W YLR046CQ12253 270 aa2.79□□□□□ -1.96
SPT15YER148W MDY2Q12285 212 aa2.79□□□□□ -1.96
SPT15YER148W TFC7Q12415 435 aa2.79□□□□□ -1.96
SPT15YER148W DCP1Q12517 231 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
SPT15YER148W TDH3P00359 332 aaKnown RBP RIP-Chip data2.78□□□□□ -1.96not detected
SPT15YER148W SCL1P21243 252 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
SPT15YER148W AST1P35183 429 aa2.78□□□□□ -1.96
SPT15YER148W GLG2P47011 380 aa2.78□□□□□ -1.96
SPT15YER148W CPR7P47103 393 aa2.78□□□□□ -1.96
SPT15YER148W SWC4P53201 476 aa2.78□□□□□ -1.96
SPT15YER148W BIO4P53630 237 aa2.78□□□□□ -1.96
SPT15YER148W IGO1P53897 168 aa2.78□□□□□ -1.96
SPT15YER148W ACT1P60010 375 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
SPT15YER148W SPG3Q04398 127 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
SPT15YER148W YLR030WQ07967 263 aa2.78□□□□□ -1.96
SPT15YER148W APC9Q12107 265 aa2.78□□□□□ -1.96
SPT15YER148W SIA1Q12212 622 aa2.78□□□□□ -1.96
SPT15YER148W IZH4Q99393 312 aa2.78□□□□□ -1.96
SPT15YER148W INO2P26798 304 aa2.77□□□□□ -1.97
SPT15YER148W ASP1P38986 381 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
SPT15YER148W UBC13P52490 153 aa2.77□□□□□ -1.97
SPT15YER148W EMC4P53073 190 aa2.77□□□□□ -1.97
SPT15YER148W YGL118CP53132 145 aa2.77□□□□□ -1.97
SPT15YER148W RTC4P53850 401 aa2.77□□□□□ -1.97
SPT15YER148W SEC13Q04491 297 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
SPT15YER148W YPR195CQ06594 109 aa2.77□□□□□ -1.97
SPT15YER148W PBP4Q07362 185 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
SPT15YER148W ABP140Q08641 628 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
SPT15YER148W YOR292CQ08743 309 aa2.77□□□□□ -1.97
SPT15YER148W PRP46Q12417 451 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
SPT15YER148W PFK27Q12471 397 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
SPT15YER148W LAG2Q92325 660 aa2.77□□□□□ -1.97
SPT15YER148W GCG1P32656 232 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SPT15YER148W CDC13P32797 924 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
SPT15YER148W RPC17P47076 161 aa2.76□□□□□ -1.97
SPT15YER148W CAX4P53223 239 aa2.76□□□□□ -1.97
SPT15YER148W ARP5P53946 755 aa2.76□□□□□ -1.97
SPT15YER148W PIR1Q03178 341 aa2.76□□□□□ -1.97
SPT15YER148W YOR342CQ12182 319 aa2.76□□□□□ -1.97
SPT15YER148W BCY1P07278 416 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SPT15YER148W RPL31AP0C2H8 113 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SPT15YER148W VPS1P21576 704 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SPT15YER148W RRT12P25381 491 aa2.75□□□□□ -1.97
SPT15YER148W RPL16BP26785 198 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
SPT15YER148W RPC25P35718 212 aa2.75□□□□□ -1.97
SPT15YER148W GPX1P36014 167 aa2.75□□□□□ -1.97
SPT15YER148W AIM29P36154 155 aa2.75□□□□□ -1.97
SPT15YER148W SPO19Q03029 223 aa2.75□□□□□ -1.97
SPT15YER148W TAF9Q05027 157 aa2.75□□□□□ -1.97
SPT15YER148W NKP2Q06162 153 aa2.75□□□□□ -1.97
SPT15YER148W PLB3Q08108 686 aa2.75□□□□□ -1.97
SPT15YER148W YPL264CQ08980 353 aa2.75□□□□□ -1.97
SPT15YER148W VPS68Q12016 184 aa2.75□□□□□ -1.97
SPT15YER148W YPS3Q12303 508 aa2.75□□□□□ -1.97
SPT15YER148W PEX11Q12462 236 aa2.75□□□□□ -1.97
SPT15YER148W MATALPHA2P0CY08 210 aa2.74□□□□□ -1.97
SPT15YER148W HMLALPHA2P0CY09 210 aa2.74□□□□□ -1.97
SPT15YER148W IME2P32581 645 aa2.74□□□□□ -1.97
SPT15YER148W IMP3P32899 183 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
SPT15YER148W TPO5P36029 618 aa2.74□□□□□ -1.97
SPT15YER148W SWD2P36104 329 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
SPT15YER148W YPC1P38298 316 aa2.74□□□□□ -1.97
SPT15YER148W SPT8P38915 602 aa2.74□□□□□ -1.97
SPT15YER148W EDC2P40023 145 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
SPT15YER148W SPO73P40031 143 aa2.74□□□□□ -1.97
SPT15YER148W YIL059CP40520 121 aa2.74□□□□□ -1.97
SPT15YER148W PHB1P40961 287 aa2.74□□□□□ -1.97
SPT15YER148W GDS1P41913 522 aa2.74□□□□□ -1.97
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