RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C YBL113CQ7M4S9 792 aa5.86□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C DEG1P31115 442 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C PDB1P32473 366 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C RPC34P32910 317 aa5.85□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C YOX1P34161 385 aa5.85□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C MCH2P36032 473 aa5.85□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C BAP2P38084 609 aa5.85□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C CTK2P46962 323 aa5.85□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C BNA2P47125 453 aa5.85□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C MTL1P53214 551 aa5.85□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C NQM1P53228 333 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C ASI3P53983 676 aa5.85□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C GPI17Q04080 534 aa5.85□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C YMR226CQ05016 267 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C MRX8Q05473 314 aa5.85□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C PIN3Q06449 215 aa5.85□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C PRP11Q07350 266 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C TGS1Q12052 315 aa5.85□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C MES1P00958 751 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C RAS1P01119 309 aa5.84□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C PMR1P13586 950 aa5.84□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C FUN19P28003 413 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C UBC8P28263 218 aa5.84□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C DAL3P32459 195 aa5.84□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C REC114P32841 428 aa5.84□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C MRT4P33201 236 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C AHP1P38013 176 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C ARC40P38328 384 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C LNP1P38878 278 aa5.84□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C ECM1P39715 212 aa5.84□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C RET2P43621 546 aa5.84□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C SAM50P53969 484 aa5.84□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C YPR098CQ06089 161 aa5.84□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C AIM6Q07716 390 aa5.84□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C USB1Q12208 290 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
SPE3YPR069C FBA1P14540 359 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C YAK1P14680 807 aa5.83□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C IES6P32617 166 aa5.83□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C YPK3P38070 525 aa5.83□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C ECM8P38246 354 aa5.83□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C GDT1P38301 280 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C IPT1P38954 527 aa5.83□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C THO1P40040 218 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C AAD14P42884 376 aa5.83□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C CIN2P46670 268 aa5.83□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C COG5P53951 403 aa5.83□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C FRE3Q08905 711 aa5.83□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C RPL24AP04449 155 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C TPK3P05986 398 aa5.82□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C SNF4P12904 322 aa5.82□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C OAC1P32332 324 aa5.82□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C FRM2P37261 193 aa5.82□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C PIC2P40035 300 aa5.82□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C YNR048WP53740 393 aa5.82□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C APJ1P53940 528 aa5.82□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C DTD1Q07648 150 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C ISA2Q12425 185 aa5.82□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C PCL9Q12477 304 aa5.82□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C TDH2P00358 332 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C HXT2P23585 541 aa5.81□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C ECT1P33412 323 aa5.81□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C RMD6P39975 231 aa5.81□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C SLM1P40485 686 aa5.81□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C CCC1P47818 322 aa5.81□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C ARG5,6Q01217 863 aa5.81□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C YPL108WQ02872 168 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C HOT1Q03213 719 aa5.81□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C RFU1Q08003 200 aa5.81□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C NOP56Q12460 504 aaKnown RBP RIP-Chip data5.81□□□□□ -1.48not detected
SPE3YPR069C RPL30P14120 105 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C SAM35P14693 329 aa5.8□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C SAG1P20840 650 aa5.8□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C RPA135P22138 1203 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C TCA17P32613 152 aa5.8□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C YKR015CP36111 568 aa5.8□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C YJL016WP47072 561 aa5.8□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C UFD1P53044 361 aa5.8□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C VOA1P53262 265 aa5.8□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C RNH201P53942 307 aa5.8□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C SMP3Q04174 516 aa5.8□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C GAL83Q04739 417 aa5.8□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C IRC25Q07951 179 aa5.8□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C PST2Q12335 198 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C RAX2Q12465 1220 aa5.8□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C YPL119C-AQ3E751 87 aa5.8□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C LSO1Q3E827 93 aa5.8□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C SOD2P00447 233 aa5.79□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C GCD1P09032 578 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C MRPS28P21771 286 aa5.79□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C FPS1P23900 669 aa5.79□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C ACH1P32316 526 aa5.79□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C SSE2P32590 693 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C PRY2P36110 329 aa5.79□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C ICS2P38284 255 aa5.79□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C OSH7P38755 437 aa5.79□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C ATF1P40353 525 aa5.79□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C TIR3P40552 269 aa5.79□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C SWP82P43554 623 aa5.79□□□□□ -1.48
SPE3YPR069C GON7P46984 123 aa5.79□□□□□ -1.48
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