RNA–Protein interactions for RNA: YER063W

THO1, Transcript of Conserved nuclear RNA-binding protein, yeast

Gene THO1, Length 657 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
THO1	YER063W	RIB1	P38066	345 aa		2.76	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	PAN6	P40459	309 aa		2.76	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	YIL001W	P40560	513 aa		2.76	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	TIS11	P47977	285 aa		2.76	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	UBC13	P52490	153 aa		2.76	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	CLD1	P53264	445 aa		2.76	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	TRM82	Q03774	444 aa		2.76	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	DCR2	Q05924	578 aa		2.76	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	SNF8	Q12483	233 aa		2.76	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		2.75	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		2.75	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	NAM2	P11325	894 aa		2.75	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.75	□□□□□ -1.97	not detected
THO1	YER063W	ATP7	P30902	174 aa		2.75	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	PDC2	P32896	925 aa		2.75	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	OPY1	P38271	328 aa		2.75	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	FZO1	P38297	855 aa		2.75	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	MIC12	P38341	106 aa		2.75	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	FRT2	P39734	528 aa		2.75	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	GDS1	P41913	522 aa		2.75	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	MOB2	P43563	287 aa		2.75	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	USE1	P53146	245 aa		2.75	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	COS1	P53822	381 aa		2.75	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	GAS2	Q06135	555 aa		2.75	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	SFH1	Q06168	426 aa		2.75	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	POX1	P13711	748 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	YMR31	P19955	123 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	RPB5	P20434	215 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	RPO26	P20435	155 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	CMK2	P22517	447 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	URA10	P30402	227 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	YBR137W	P38276	179 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	ERG28	P40030	148 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	HOC1	P47124	396 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	GET1	P53192	235 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	MTM1	P53320	366 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	ZRG17	P53735	605 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	ASI3	P53983	676 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	YLR152C	P54072	576 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	TAF9	Q05027	157 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	SRO7	Q12038	1033 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	RPN6	Q12377	434 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	LAG2	Q92325	660 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	SIR4	P11978	1358 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	ADE6	P38972	1358 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	AUS1	Q08409	1394 aa		2.74	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	TRP1	P00912	224 aa		2.73	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	CBF1	P17106	351 aa		2.73	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	POF1	P25576	258 aa		2.73	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	PEX3	P28795	441 aa		2.73	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	MRPL10	P36520	322 aa		2.73	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	TRM5	P38793	499 aa		2.73	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	SUR2	P38992	349 aa		2.73	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	SEC72	P39742	193 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	DSN1	P40568	576 aa		2.73	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	CIN2	P46670	268 aa		2.73	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	VEL1	P53058	206 aa		2.73	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	COG7	P53195	279 aa		2.73	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	TDA1	Q03533	586 aa		2.73	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	FSH2	Q05015	223 aa		2.73	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	YLR446W	Q06204	433 aa		2.73	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	SEC10	Q06245	871 aa		2.73	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	VIK1	Q12045	647 aa		2.73	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	FRE8	Q12209	686 aa		2.73	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	YCT1	Q12235	531 aa		2.73	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	JID1	Q12350	301 aa		2.73	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	YDL199C	Q12407	687 aa		2.73	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	YAL064W-B	O13512	126 aa		2.72	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	HTB2	P02294	131 aa		2.72	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	MSI1	P13712	422 aa		2.72	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	YPC1	P38298	316 aa		2.72	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97
THO1	YER063W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	2.72	□□□□□ -1.97

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