RNA–Protein interactions for RNA: YMR048W

CSM3, Transcript of Replication fork associated factor, yeast

Gene CSM3, Length 954 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSM3	YMR048W	YDL199C	Q12407	687 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	RGS2	Q99188	309 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	FSH3	Q99369	266 aa		3.01	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	COX5A	P00424	153 aa		3	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	CBF1	P17106	351 aa		3	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	CDC50	P25656	391 aa		3	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	TOA1	P32773	286 aa		3	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	PFS1	P38872	237 aa		3	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	ABM1	P47146	123 aa		3	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	SLM2	P53955	656 aa		3	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	YET3	Q07451	203 aa		3	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	FUN26	P31381	517 aa		2.99	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	TIP20	P33891	701 aa		2.99	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	HSM3	P38348	480 aa		2.99	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	WSC4	P38739	605 aa		2.99	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	MED6	P38782	295 aa		2.99	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	FRT2	P39734	528 aa		2.99	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	YJR030C	P47101	745 aa		2.99	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	COQ5	P49017	307 aa		2.99	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	BOL2	P53082	120 aa		2.99	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	SWC4	P53201	476 aa		2.99	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	MRS2	Q01926	470 aa		2.99	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	2.99	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	SEC10	Q06245	871 aa		2.99	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	GAT3	Q07928	141 aa		2.99	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	YLR053C	Q12026	108 aa		2.99	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	YLR422W	Q06409	1932 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	STE3	P06783	470 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	MSF1	P08425	469 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	EPT1	P22140	391 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	RBK1	P25332	333 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	HMX1	P32339	317 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	TIM17	P39515	158 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	PEP8	P40335	379 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	MKC7	P53379	596 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	YPL113C	Q02961	396 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	PIR1	Q03178	341 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	SMP3	Q04174	516 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	ARR1	Q06596	294 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	PER33	Q12144	273 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	2.98	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	MDY2	Q12285	212 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	OCA6	Q12454	224 aa		2.98	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	UBR2	Q07963	1872 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	RAD3	P06839	778 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	DEP1	P31385	405 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	CYM1	P32898	989 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	CAB3	P36076	571 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.97	□□□□□ -1.93	RIP-Chip
CSM3	YMR048W	IML3	P38265	245 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	FZO1	P38297	855 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	OM14	P38325	134 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	YHI9	P38765	294 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	CYC2	P38909	366 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	MDM34	P53083	459 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	COG7	P53195	279 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	YGR016W	P53209	190 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	GTR2	P53290	341 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	BIO4	P53630	237 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	YNL260C	P53846	198 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	TVP15	Q03860	143 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	SPC24	Q04477	213 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	YDR278C	Q05612	105 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	MSC3	Q05812	728 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	PLB3	Q08108	686 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	VPS68	Q12016	184 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	YDL109C	Q12103	647 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	GET4	Q12125	312 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	SAS5	Q99314	248 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CSM3	YMR048W	VPS13	Q07878	3144 aa		2.96	□□□□□ -1.94
CSM3	YMR048W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
CSM3	YMR048W	ZRC1	P20107	442 aa		2.96	□□□□□ -1.94
CSM3	YMR048W	GIT1	P25346	518 aa		2.96	□□□□□ -1.94
CSM3	YMR048W	ATP7	P30902	174 aa		2.96	□□□□□ -1.94
CSM3	YMR048W	YCR087C-A	P37263	153 aa		2.96	□□□□□ -1.94
CSM3	YMR048W	GPI18	P38211	433 aa		2.96	□□□□□ -1.94
CSM3	YMR048W	EFM1	P38732	585 aa		2.96	□□□□□ -1.94
CSM3	YMR048W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
CSM3	YMR048W	IGD1	P43598	195 aa		2.96	□□□□□ -1.94

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 9.2 ms