RNA–Protein interactions for RNA: YLR285W

NNT1, Transcript of S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase, yeast

Gene NNT1, Length 786 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NNT1	YLR285W	ZIP1	P31111	875 aa		2.63	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.63	□□□□□ -1.99	not detected
NNT1	YLR285W	SMP1	P38128	452 aa		2.63	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	RRG9	P40156	214 aa		2.63	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	HIT1	P46973	164 aa		2.63	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	TAD2	P47058	250 aa		2.63	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	RAD17	P48581	401 aa		2.63	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	KTR6	P54070	446 aa		2.63	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	PET117	Q02771	107 aa		2.63	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	OST6	Q03723	332 aa		2.63	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	YML018C	Q03730	393 aa		2.63	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	TAF9	Q05027	157 aa		2.63	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	SFH1	Q06168	426 aa		2.63	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	2.63	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	ATG31	Q12421	196 aa		2.63	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	DNA2	P38859	1522 aa		2.63	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	REV1	P12689	985 aa		2.62	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	DAL81	P21657	970 aa		2.62	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	EPT1	P22140	391 aa		2.62	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	MRPL25	P23369	157 aa		2.62	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	LDB16	P25587	256 aa		2.62	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	VPH2	P32341	215 aa		2.62	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	BIG1	P38813	335 aa		2.62	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	YGL262W	P53054	175 aa		2.62	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	TIM21	P53220	239 aa		2.62	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	FMP48	P53233	369 aa		2.62	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	MNT4	P53745	580 aa		2.62	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	HAL1	Q01766	294 aa		2.62	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	YOR029W	Q12243	111 aa		2.62	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	TRM10	Q12400	293 aa		2.62	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	RAX2	Q12465	1220 aa		2.62	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	PCL1	P24867	279 aa		2.61	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	FRM2	P37261	193 aa		2.61	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	MBA1	P38300	278 aa		2.61	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	SHC1	P39000	512 aa		2.61	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	RRT13	P40042	185 aa		2.61	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	ASG7	P46993	209 aa		2.61	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	VEL1	P53058	206 aa		2.61	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	PEX31	P53203	462 aa		2.61	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	SEC10	Q06245	871 aa		2.61	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	YOL029C	Q08187	201 aa		2.61	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	PER33	Q12144	273 aa		2.61	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	YOL085C	Q99345	113 aa		2.61	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	PEX3	P28795	441 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	MRX3	P38172	270 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	ATG12	P38316	186 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	YER085C	P40058	173 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	MIC19	P43594	170 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	LIF1	P53150	421 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	YGR018C	P53211	109 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	VPS60	Q03390	229 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	INP1	Q03694	420 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	YLR283W	Q05867	314 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	CTR3	Q06686	241 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	PAM18	Q07914	168 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	MSH5	Q12175	901 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	YOS9	Q99220	542 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	PSK1	P31374	1356 aa		2.6	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	YAL064W-B	O13512	126 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	CDC42	P19073	191 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	ATG15	P25641	520 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	DOA4	P32571	926 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	ZRT3	P34240	503 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	UTH1	P36135	365 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	AIM29	P36154	155 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	MRPL3	P36516	390 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	ECM34	P38728	170 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	YFL064C	P43540	174 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	MAL13	P53338	473 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	SWS2	P53937	143 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	YMR244W	Q04018	355 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	LOA1	Q06508	300 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	2.59	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	MCH1	Q07376	486 aa		2.59	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
NNT1	YLR285W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2

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