RNA–Protein interactions for RNA: YDR369C

XRS2, Transcript of Protein required for DNA repair, yeast

Gene XRS2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
XRS2	YDR369C	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	STP22	P25604	385 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	ATG15	P25641	520 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	ASH1	P34233	588 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YKL151C	P36059	337 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	PRY2	P36110	329 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	SFB3	P38810	929 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	WSS1	P38838	269 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YIL152W	P40455	235 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	KTR7	P40504	517 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	SMK1	P41808	388 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YFL052W	P43551	465 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	SDT1	P53078	280 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YNL184C	P53876	108 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	PLB2	Q03674	706 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	UPS3	Q04006	179 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YDR444W	Q04093	687 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	CNL1	Q06333	122 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	TEN1	Q07921	160 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.35	□□□□□ -1.87	not detected
XRS2	YDR369C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	PST1	Q12355	444 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	NDJ1	Q12366	352 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	PMD1	P32634	1753 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	PUP1	P25043	261 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	MSK1	P32048	576 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	SFK1	P35735	353 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	ADD66	P36040	267 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YBL029W	P38201	376 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YBR096W	P38256	230 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	MGE1	P38523	228 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	NPP2	P39997	493 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YIL089W	P40500	205 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	SYS1	P41544	203 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	OST3	P48439	350 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	GTR2	P53290	341 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	NUP100	Q02629	959 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YDR132C	Q03900	495 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YPR109W	Q06104	294 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	THI72	Q08579	599 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YPL260W	Q08977	551 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	UPC2	Q12151	913 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	FRE8	Q12209	686 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		3.35	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	PHO2	P07269	559 aa		3.34	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	PPH21	P23594	369 aa		3.34	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	ARE1	P25628	610 aa		3.34	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	URK1	P27515	501 aa		3.34	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	MRP20	P32387	263 aa		3.34	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	MDL1	P33310	695 aa		3.34	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	SDH3	P33421	198 aa		3.34	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	MCH2	P36032	473 aa		3.34	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YHR122W	P38829	231 aa		3.34	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	VAC8	P39968	578 aa		3.34	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	LRO1	P40345	661 aa		3.34	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	EXG2	P52911	562 aa		3.34	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	SAY1	P53324	424 aa		3.34	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	BOR1	P53838	576 aa		3.34	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	AAH1	P53909	347 aa		3.34	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	RHO4	Q00246	291 aa		3.34	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	VBA1	Q04301	562 aa		3.34	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	FIT1	Q04433	528 aa		3.34	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	TMN2	Q04562	672 aa		3.34	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	MRPL35	Q06678	367 aa		3.34	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	YDL057W	Q07379	328 aa		3.34	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	CSR2	Q12734	1121 aa		3.34	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	UBR1	P19812	1950 aa		3.34	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	MOT1	P32333	1867 aa		3.34	□□□□□ -1.87
XRS2	YDR369C	SNF5	P18480	905 aa		3.34	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	ELO2	P25358	347 aa		3.34	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	SYN8	P31377	255 aa		3.34	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	BNA4	P38169	460 aa		3.34	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	SPO73	P40031	143 aa		3.34	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	MGS1	P40151	587 aa		3.34	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	ALY2	P47029	1046 aa		3.34	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	ZAP1	P47043	880 aa		3.34	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	MTL1	P53214	551 aa		3.34	□□□□□ -1.88
XRS2	YDR369C	GIP3	Q03016	1276 aa		3.34	□□□□□ -1.88

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