RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)P

tW(CCA)P, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)P, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)PtW(CCA)P REP1P03871 373 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P RPL24AP04449 155 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P RPL39P04650 51 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P MSW1P04803 379 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P OPI3P05375 206 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P MSI1P13712 422 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P URE2P23202 354 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P BOS1P25385 244 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P RPB9P27999 122 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P ASF2P32448 525 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data2.26□□□□□ -2.05not detected
tW(CCA)PtW(CCA)P GLC7P32598 312 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P NIC96P34077 839 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P RIB1P38066 345 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P CIN4P39110 191 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P PHO90P39535 881 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P BUR6P40096 142 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P FLX1P40464 311 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P SLS1P42900 643 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P QRI7P43122 407 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P SSY5P47002 699 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P SFH5P47008 294 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P YHC3P47040 408 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P TMA22P47089 198 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P NIT3P49954 291 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P PRM8P53174 237 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P YGR016WP53209 190 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P TNA1P53322 534 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P YNL095CP53932 642 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P APJ1P53940 528 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P NUP49Q02199 472 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P YMR102CQ03177 834 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P SPC24Q04477 213 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P RIM9Q04734 239 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P YMR226CQ05016 267 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P SSK1Q07084 712 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P CSI2Q08054 341 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P TY1A-BLQ12266 440 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P YCL048W-AQ2V2Q2 79 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P KIN28P06242 306 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P PDE2P06776 526 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P ARO3P14843 370 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P CNA1P23287 553 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P CLB4P24871 460 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P BUD5P25300 642 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P POL4P25615 582 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P TFC1P32367 649 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P VMA11P32842 164 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P YME2P32843 850 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P PEP12P32854 288 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P MNS1P32906 549 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P SPT10P35208 640 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P ECM8P38246 354 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P YBR138CP38277 524 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P VBA2P38358 474 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P YAR028WP39548 234 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P SLZ1P40167 298 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P PRE6P40303 254 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P MPH1P40562 993 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P POP1P41812 875 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P STB1P42845 420 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P IDS2P46958 469 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P YJL016WP47072 561 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P YJR098CP47139 656 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P EXG2P52911 562 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P YGL101WP53144 215 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P NQM1P53228 333 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P PXR1P53335 271 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P YNL165WP53891 406 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P PGA1P53896 198 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P YDR387CQ04162 555 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P SEC13Q04491 297 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P RNH1Q04740 348 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P TAZ1Q06510 381 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P YPR097WQ06839 1073 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P YDL114WQ07530 308 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P BRE4Q07660 1125 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P GAT3Q07928 141 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P MSA1Q08471 629 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P SYC1Q08553 188 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P YOR378WQ08902 515 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P UIP4Q08926 304 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P RDL1Q12305 139 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P APC2Q12440 853 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P IZH2Q12442 317 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P RPS23AP0CX29 145 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P RPS23BP0CX30 145 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P HAP4P14064 554 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P MEK1P24719 497 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P RRP7P25368 297 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P YCL002CP25565 263 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P RPC82P32349 654 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P PDB1P32473 366 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P PRP19P32523 503 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P BCK2P33306 851 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P HCS1P34243 683 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P MCH2P36032 473 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P SHM2P37291 469 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P APL3P38065 1025 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P BAP2P38084 609 aa2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.5 ms