RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)M

tW(CCA)M, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)M, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)MtW(CCA)M REP1P03871 373 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M RPL24AP04449 155 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M RPL39P04650 51 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M MSW1P04803 379 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M OPI3P05375 206 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M MSI1P13712 422 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M URE2P23202 354 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M BOS1P25385 244 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M RPB9P27999 122 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M ASF2P32448 525 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data2.26□□□□□ -2.05not detected
tW(CCA)MtW(CCA)M GLC7P32598 312 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M NIC96P34077 839 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M RIB1P38066 345 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M CIN4P39110 191 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M PHO90P39535 881 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M BUR6P40096 142 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M FLX1P40464 311 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M SLS1P42900 643 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M QRI7P43122 407 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M SSY5P47002 699 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M SFH5P47008 294 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M YHC3P47040 408 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M TMA22P47089 198 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M NIT3P49954 291 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M PRM8P53174 237 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M YGR016WP53209 190 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M TNA1P53322 534 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M YNL095CP53932 642 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M APJ1P53940 528 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M NUP49Q02199 472 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M YMR102CQ03177 834 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M SPC24Q04477 213 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M RIM9Q04734 239 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M YMR226CQ05016 267 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M SSK1Q07084 712 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M CSI2Q08054 341 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M TY1A-BLQ12266 440 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M YCL048W-AQ2V2Q2 79 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M KIN28P06242 306 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M PDE2P06776 526 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M ARO3P14843 370 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M CNA1P23287 553 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M CLB4P24871 460 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M BUD5P25300 642 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M POL4P25615 582 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M TFC1P32367 649 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M VMA11P32842 164 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M YME2P32843 850 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M PEP12P32854 288 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M MNS1P32906 549 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M SPT10P35208 640 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M ECM8P38246 354 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M YBR138CP38277 524 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M VBA2P38358 474 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M YAR028WP39548 234 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M SLZ1P40167 298 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M PRE6P40303 254 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M MPH1P40562 993 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M POP1P41812 875 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M STB1P42845 420 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M IDS2P46958 469 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M YJL016WP47072 561 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M YJR098CP47139 656 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M EXG2P52911 562 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M YGL101WP53144 215 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M NQM1P53228 333 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M PXR1P53335 271 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M YNL165WP53891 406 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M PGA1P53896 198 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M YDR387CQ04162 555 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M SEC13Q04491 297 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M RNH1Q04740 348 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M TAZ1Q06510 381 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M YPR097WQ06839 1073 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M YDL114WQ07530 308 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M BRE4Q07660 1125 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M GAT3Q07928 141 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M MSA1Q08471 629 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M SYC1Q08553 188 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M YOR378WQ08902 515 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M UIP4Q08926 304 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M RDL1Q12305 139 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M APC2Q12440 853 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M IZH2Q12442 317 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M RPS23AP0CX29 145 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M RPS23BP0CX30 145 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M HAP4P14064 554 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M MEK1P24719 497 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M RRP7P25368 297 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M YCL002CP25565 263 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M RPC82P32349 654 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M PDB1P32473 366 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M PRP19P32523 503 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M BCK2P33306 851 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M HCS1P34243 683 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M MCH2P36032 473 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M SHM2P37291 469 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M APL3P38065 1025 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)MtW(CCA)M BAP2P38084 609 aa2.24□□□□□ -2.05
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