RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J REP1P03871 373 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL24AP04449 155 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL39P04650 51 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J MSW1P04803 379 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J OPI3P05375 206 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J MSI1P13712 422 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J URE2P23202 354 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J BOS1P25385 244 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J RPB9P27999 122 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J ASF2P32448 525 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data2.26□□□□□ -2.05not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J GLC7P32598 312 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J NIC96P34077 839 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J RIB1P38066 345 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J CIN4P39110 191 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J PHO90P39535 881 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J BUR6P40096 142 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J FLX1P40464 311 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J SLS1P42900 643 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J QRI7P43122 407 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J SSY5P47002 699 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J SFH5P47008 294 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J YHC3P47040 408 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J TMA22P47089 198 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J NIT3P49954 291 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J PRM8P53174 237 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J YGR016WP53209 190 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J TNA1P53322 534 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J YNL095CP53932 642 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J APJ1P53940 528 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J NUP49Q02199 472 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J YMR102CQ03177 834 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J SPC24Q04477 213 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J RIM9Q04734 239 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J YMR226CQ05016 267 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J SSK1Q07084 712 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J CSI2Q08054 341 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J TY1A-BLQ12266 440 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J YCL048W-AQ2V2Q2 79 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J KIN28P06242 306 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J PDE2P06776 526 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J ARO3P14843 370 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J CNA1P23287 553 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J CLB4P24871 460 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J BUD5P25300 642 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J POL4P25615 582 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J TFC1P32367 649 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J VMA11P32842 164 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J YME2P32843 850 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J PEP12P32854 288 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J MNS1P32906 549 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J SPT10P35208 640 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J ECM8P38246 354 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J YBR138CP38277 524 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J VBA2P38358 474 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J YAR028WP39548 234 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J SLZ1P40167 298 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J PRE6P40303 254 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J MPH1P40562 993 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J POP1P41812 875 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J STB1P42845 420 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J IDS2P46958 469 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J YJL016WP47072 561 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J YJR098CP47139 656 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J EXG2P52911 562 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J YGL101WP53144 215 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J NQM1P53228 333 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J PXR1P53335 271 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J YNL165WP53891 406 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J PGA1P53896 198 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J YDR387CQ04162 555 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J SEC13Q04491 297 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J RNH1Q04740 348 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J TAZ1Q06510 381 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J YPR097WQ06839 1073 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J YDL114WQ07530 308 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J BRE4Q07660 1125 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J GAT3Q07928 141 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J MSA1Q08471 629 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J SYC1Q08553 188 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J YOR378WQ08902 515 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J UIP4Q08926 304 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J RDL1Q12305 139 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J APC2Q12440 853 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J IZH2Q12442 317 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J RPS23AP0CX29 145 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J RPS23BP0CX30 145 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J HAP4P14064 554 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J MEK1P24719 497 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J RRP7P25368 297 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J YCL002CP25565 263 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J RPC82P32349 654 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J PDB1P32473 366 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J PRP19P32523 503 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J BCK2P33306 851 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J HCS1P34243 683 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J MCH2P36032 473 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J SHM2P37291 469 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J APL3P38065 1025 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J BAP2P38084 609 aa2.24□□□□□ -2.05
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