RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)G2

tW(CCA)G2, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)G2, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 REP1P03871 373 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RPL24AP04449 155 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RPL39P04650 51 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MSW1P04803 379 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 OPI3P05375 206 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MSI1P13712 422 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 URE2P23202 354 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 BOS1P25385 244 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RPB9P27999 122 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 ASF2P32448 525 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data2.26□□□□□ -2.05not detected
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 GLC7P32598 312 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 NIC96P34077 839 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RIB1P38066 345 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 CIN4P39110 191 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PHO90P39535 881 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 BUR6P40096 142 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 FLX1P40464 311 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SLS1P42900 643 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 QRI7P43122 407 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SSY5P47002 699 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SFH5P47008 294 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YHC3P47040 408 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 TMA22P47089 198 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 NIT3P49954 291 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PRM8P53174 237 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YGR016WP53209 190 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 TNA1P53322 534 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YNL095CP53932 642 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 APJ1P53940 528 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 NUP49Q02199 472 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YMR102CQ03177 834 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SPC24Q04477 213 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RIM9Q04734 239 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YMR226CQ05016 267 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SSK1Q07084 712 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 CSI2Q08054 341 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 TY1A-BLQ12266 440 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YCL048W-AQ2V2Q2 79 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 KIN28P06242 306 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PDE2P06776 526 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 ARO3P14843 370 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 CNA1P23287 553 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 CLB4P24871 460 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 BUD5P25300 642 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 POL4P25615 582 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 TFC1P32367 649 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 VMA11P32842 164 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YME2P32843 850 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PEP12P32854 288 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MNS1P32906 549 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SPT10P35208 640 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 ECM8P38246 354 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YBR138CP38277 524 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 VBA2P38358 474 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YAR028WP39548 234 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SLZ1P40167 298 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PRE6P40303 254 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MPH1P40562 993 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 POP1P41812 875 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 STB1P42845 420 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 IDS2P46958 469 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YJL016WP47072 561 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YJR098CP47139 656 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 EXG2P52911 562 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YGL101WP53144 215 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 NQM1P53228 333 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PXR1P53335 271 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YNL165WP53891 406 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PGA1P53896 198 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YDR387CQ04162 555 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SEC13Q04491 297 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RNH1Q04740 348 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 TAZ1Q06510 381 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YPR097WQ06839 1073 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YDL114WQ07530 308 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 BRE4Q07660 1125 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 GAT3Q07928 141 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MSA1Q08471 629 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SYC1Q08553 188 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YOR378WQ08902 515 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 UIP4Q08926 304 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RDL1Q12305 139 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 APC2Q12440 853 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 IZH2Q12442 317 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RPS23AP0CX29 145 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RPS23BP0CX30 145 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 HAP4P14064 554 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MEK1P24719 497 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RRP7P25368 297 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 YCL002CP25565 263 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 RPC82P32349 654 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PDB1P32473 366 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 PRP19P32523 503 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 BCK2P33306 851 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 HCS1P34243 683 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 MCH2P36032 473 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 SHM2P37291 469 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 APL3P38065 1025 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)G2tW(CCA)G2 BAP2P38084 609 aa2.24□□□□□ -2.05
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