RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)G1

tW(CCA)G1, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)G1, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 REP1P03871 373 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 RPL24AP04449 155 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 RPL39P04650 51 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 MSW1P04803 379 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 OPI3P05375 206 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 MSI1P13712 422 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 URE2P23202 354 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 BOS1P25385 244 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 RPB9P27999 122 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 ASF2P32448 525 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data2.26□□□□□ -2.05not detected
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 GLC7P32598 312 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 NIC96P34077 839 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 RIB1P38066 345 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 CIN4P39110 191 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 PHO90P39535 881 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 BUR6P40096 142 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 FLX1P40464 311 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 SLS1P42900 643 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 QRI7P43122 407 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 SSY5P47002 699 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 SFH5P47008 294 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 YHC3P47040 408 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 TMA22P47089 198 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 NIT3P49954 291 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 PRM8P53174 237 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 YGR016WP53209 190 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 TNA1P53322 534 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 YNL095CP53932 642 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 APJ1P53940 528 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 NUP49Q02199 472 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 YMR102CQ03177 834 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 SPC24Q04477 213 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 RIM9Q04734 239 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 YMR226CQ05016 267 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 SSK1Q07084 712 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 CSI2Q08054 341 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 TY1A-BLQ12266 440 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 YCL048W-AQ2V2Q2 79 aa2.26□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 KIN28P06242 306 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 PDE2P06776 526 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 ARO3P14843 370 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 CNA1P23287 553 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 CLB4P24871 460 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 BUD5P25300 642 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 POL4P25615 582 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 TFC1P32367 649 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 VMA11P32842 164 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 YME2P32843 850 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 PEP12P32854 288 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 MNS1P32906 549 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 SPT10P35208 640 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 ECM8P38246 354 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 YBR138CP38277 524 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 VBA2P38358 474 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 YAR028WP39548 234 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 SLZ1P40167 298 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 PRE6P40303 254 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 MPH1P40562 993 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 POP1P41812 875 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 STB1P42845 420 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 IDS2P46958 469 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 YJL016WP47072 561 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 YJR098CP47139 656 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 EXG2P52911 562 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 YGL101WP53144 215 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 NQM1P53228 333 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 PXR1P53335 271 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 YNL165WP53891 406 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 PGA1P53896 198 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 YDR387CQ04162 555 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 SEC13Q04491 297 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 RNH1Q04740 348 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 TAZ1Q06510 381 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 YPR097WQ06839 1073 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 YDL114WQ07530 308 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 BRE4Q07660 1125 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 GAT3Q07928 141 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 MSA1Q08471 629 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 SYC1Q08553 188 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 YOR378WQ08902 515 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 UIP4Q08926 304 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 RDL1Q12305 139 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 APC2Q12440 853 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 IZH2Q12442 317 aa2.25□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 RPS23AP0CX29 145 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 RPS23BP0CX30 145 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 HAP4P14064 554 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 MEK1P24719 497 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 RRP7P25368 297 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 YCL002CP25565 263 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 RPC82P32349 654 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 PDB1P32473 366 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 PRP19P32523 503 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 BCK2P33306 851 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 HCS1P34243 683 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 MCH2P36032 473 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 SHM2P37291 469 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 APL3P38065 1025 aa2.24□□□□□ -2.05
tW(CCA)G1tW(CCA)G1 BAP2P38084 609 aa2.24□□□□□ -2.05
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