RNA–Protein interactions for RNA: YML116W

ATR1, Transcript of Multidrug efflux pump of the major facilitator superfamily, yeast

Gene ATR1, Length 1,629 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATR1	YML116W	ESBP6	P53918	673 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	ARO80	Q04052	950 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	GRS2	Q06817	618 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	TIM18	Q08749	192 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	APC9	Q12107	265 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	YCR022C	P25620	114 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	YEF1	P32622	495 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	FHL1	P39521	936 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	SED5	Q01590	340 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	ODC1	Q03028	310 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	RSC9	Q03124	581 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	ARR2	Q06597	130 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	MSH5	Q12175	901 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		4.63	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	IRA1	P18963	3092 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
ATR1	YML116W	MRPS28	P21771	286 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	AIM29	P36154	155 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	YHK8	P38776	514 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	PFS1	P38872	237 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	YRB2	P40517	327 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	PHB1	P40961	287 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	KEG1	P43614	200 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	BET4	Q00618	327 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	CCE1	Q03702	353 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	OST6	Q03723	332 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	BNA7	Q04066	261 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	YOS9	Q99220	542 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		4.62	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	KSS1	P14681	368 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	YPK2	P18961	677 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	PBN1	P25580	416 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	ZIP1	P31111	875 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	TIR2	P33890	251 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	FLO5	P38894	1075 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	RBG1	P39729	369 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	RRT5	P43607	289 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	POP6	P53218	158 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	YNL181W	P53878	407 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	ADH6	Q04894	360 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	THI7	Q05998	598 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	DAL82	P21705	255 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	PEX34	P25584	144 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	PPA2	P28239	310 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	ECM4	P36156	370 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	HAT2	P39984	401 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	SML1	Q04964	104 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	YOR387C	Q08910	206 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	DAS2	Q12084	232 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	GET4	Q12125	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	ATP6	P00854	259 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	SLY1	P22213	666 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	ERG9	P29704	444 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	ACB1	P31787	87 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	ZRT1	P32804	376 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	PTR2	P32901	601 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	YEL075C	P39972	122 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	AZF1	P41696	914 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	ASG7	P46993	209 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	SFH5	P47008	294 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	RTT101	P47050	842 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	YJR030C	P47101	745 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	YJR054W	P47114	497 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	CDC14	Q00684	551 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	YML108W	Q03759	105 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	VPS74	Q06385	345 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	YLR108C	Q12259	485 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	HRT3	Q12347	344 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	ZRC1	P20107	442 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	DCC1	P25559	380 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	CHK1	P38147	527 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	YBR137W	P38276	179 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	MST28	P39552	234 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	SNX4	P47057	423 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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