RNA–Protein interactions for RNA: YKL049C

CSE4, Transcript of Centromere protein that resembles histone H3, yeastyeast

Gene CSE4, Length 690 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4YKL049C RDL2Q08742 149 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C YDR262WQ12331 272 aa1.97□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C YOR093CQ12275 1648 aa1.97□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C TY1B-HO13535 1793 aa1.97□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa1.97□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa1.97□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa1.97□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa1.97□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C TY1B-JR1P47098 1755 aa1.97□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C TY1B-ER1Q03612 1755 aa1.97□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C TY1B-GR2Q12269 1755 aa1.97□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C TY1B-OLQ12273 1755 aa1.97□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C CDC25P04821 1589 aa1.97□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C NUP157P40064 1391 aaKnown RBP1.97□□□□□ -2.09
CSE4YKL049C NTE1Q04958 1679 aa1.96□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C RAD9P14737 1309 aa1.96□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C TY3B-IQ7LHG5 1498 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C BUD3P25558 1636 aa1.96□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C RNR2P09938 399 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C SMI1P32566 505 aa1.96□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C LIN1P38852 340 aaPredicted RBP1.96□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C SLM1P40485 686 aa1.96□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C YJL144WP47009 104 aa1.96□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C YGL118CP53132 145 aa1.96□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C RVB1Q03940 463 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C TRM10Q12400 293 aa1.96□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C PRP46Q12417 451 aaPredicted RBP1.96□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C MET5P47169 1442 aa1.96□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C RAD50P12753 1312 aa1.95□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C RPO21P04050 1733 aaKnown RBP1.95□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C YPR096CO13587 100 aa1.95□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C RPS23AP0CX29 145 aaKnown RBP1.95□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C RPS23BP0CX30 145 aa1.95□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C MRPL20P22354 195 aaPredicted RBP1.95□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C INO2P26798 304 aa1.95□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C ACB1P31787 87 aa1.95□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C BUD2P33314 1104 aa1.95□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C UIP5P36137 443 aa1.95□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C HRT1Q08273 121 aa1.95□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C YPL245WQ12179 454 aaKnown RBP1.95□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C TFC7Q12415 435 aa1.95□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C DOP1Q03921 1698 aa1.95□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP1.95□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C TY1B-ER2Q03619 1755 aa1.95□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C TY1B-MR1Q04214 1755 aa1.95□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP1.95□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP1.95□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C TY1B-NL1Q12112 1755 aa1.95□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C TY1B-GR1Q12141 1755 aa1.95□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C TY1B-BRQ12193 1756 aa1.95□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C TY1B-GR3Q12316 1755 aa1.95□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C TY1B-BLQ12490 1755 aa1.95□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C TY1B-ORQ92393 1755 aa1.95□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C LTE1P07866 1435 aa1.94□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C SNT2P53127 1403 aa1.94□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C JIP3O13555 125 aa1.94□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C PET8P38921 284 aa1.94□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C NAS2P40555 220 aa1.94□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C YGR016WP53209 190 aa1.94□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C YGR168CP53293 376 aa1.94□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C YLR012CQ07927 99 aa1.94□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C CHC1P22137 1653 aaKnown RBP1.93□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C PDR11P40550 1411 aa1.93□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C USO1P25386 1790 aa1.93□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C HAP1P0CE41 1502 aa1.93□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C ERD1P16151 362 aa1.93□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C HPR1P17629 752 aaKnown RBP1.93□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C ECM14P38836 430 aa1.93□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C ASP1P38986 381 aaPredicted RBP1.93□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C FYV8P46949 817 aaKnown RBP1.93□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C YNR066CP53752 436 aa1.93□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C ARP5P53946 755 aa1.93□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C MRS2Q01926 470 aa1.93□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C UBX2Q04228 584 aa1.93□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C VPS20Q04272 221 aa1.93□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C CSI1Q04368 295 aa1.93□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C YDR222WQ04925 415 aa1.93□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C NKP2Q06162 153 aa1.93□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C KRE5P22023 1365 aa1.93□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C DRS2P39524 1355 aa1.93□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C SPO14P36126 1683 aa1.93□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C PDR12Q02785 1511 aa1.92□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C CBP2P03874 630 aaPredicted RBP1.92□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C GAL3P13045 520 aa1.92□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C TPM1P17536 199 aaKnown RBP1.92□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C SHE4P51534 789 aa1.92□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C IRC4Q03036 179 aa1.92□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C GTO3Q04806 366 aa1.92□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C YPL264CQ08980 353 aa1.92□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C SGT2Q12118 346 aaKnown RBP1.92□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C YPR063CQ12160 140 aa1.92□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C ROM2P51862 1356 aaKnown RBP1.92□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C IML1P47170 1584 aa1.92□□□□□ -2.1
CSE4YKL049C DNF3Q12674 1656 aa1.91□□□□□ -2.1
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