RNA–Protein interactions for RNA: YJL109C

UTP10, Transcript of Nucleolar protein, yeast

Gene UTP10, Length 5,310 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UTP10	YJL109C	NGL3	Q03210	505 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YDR239C	Q03780	787 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	CSI1	Q04368	295 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	SMA2	Q04658	369 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	NAT4	Q04751	285 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	SEI1	Q06058	285 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	ATG39	Q06159	398 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	TPO3	Q06451	622 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	ECM30	Q06673	1274 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	THI13	Q07748	340 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	COQ10	Q08058	207 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	NDD1	Q08887	554 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	GET4	Q12125	312 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YOR214C	Q12282	236 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	CRC1	Q12289	327 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	HRT3	Q12347	344 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	HMS1	Q12398	434 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	PCL9	Q12477	304 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	KTI11	Q3E840	82 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	SIR2	P06700	562 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	RAD3	P06839	778 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YOL163W	P0CF20	169 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YAK1	P14680	807 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YPK2	P18961	677 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	SCO1	P23833	295 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	CPR4	P25334	318 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	SMI1	P32566	505 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	MID2	P36027	376 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YKL071W	P36086	256 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	MRPL10	P36520	322 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	SCO2	P38072	301 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	QDR3	P38227	689 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YHR022C	P38763	256 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	PCL5	P38794	229 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	TRR2	P38816	342 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	PEX22	P39718	180 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	AVT7	P40501	490 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	AZF1	P41696	914 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	SSU1	P41930	458 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	PMT6	P42934	759 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YJR030C	P47101	745 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	DOC1	P53068	250 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YGL149W	P53116	101 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	GET1	P53192	235 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	RSC1	P53236	928 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	RSM27	P53305	110 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	PDR17	P53844	350 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	KIN4	Q01919	800 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	TRM82	Q03774	444 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	RAD30	Q04049	632 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	SPC24	Q04477	213 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	ECM7	Q06200	448 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	RIF2	Q06208	395 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	PAM18	Q07914	168 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	RRT8	Q08219	342 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	THP1	Q08231	455 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	BSC6	Q08280	497 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YPL264C	Q08980	353 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	YLR049C	Q12110	428 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	PSF1	Q12488	208 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	CMC2	Q3E7A4	109 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	MHF1	Q3E835	90 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	SWI1	P09547	1314 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	LAM4	P38800	1345 aa		0.53	□□□□□ -2.32
UTP10	YJL109C	TAO3	P40468	2376 aa		0.53	□□□□□ -2.33
UTP10	YJL109C	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.33
UTP10	YJL109C	CUP2	P15315	225 aa		0.53	□□□□□ -2.33
UTP10	YJL109C	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.53	□□□□□ -2.33	not detected
UTP10	YJL109C	SPO12	P17123	173 aa		0.53	□□□□□ -2.33
UTP10	YJL109C	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.33
UTP10	YJL109C	MXR2	P25566	168 aa		0.53	□□□□□ -2.33
UTP10	YJL109C	YCR102C	P25608	368 aa		0.53	□□□□□ -2.33
UTP10	YJL109C	HYM1	P32464	399 aa		0.53	□□□□□ -2.33
UTP10	YJL109C	COT1	P32798	439 aa		0.53	□□□□□ -2.33
UTP10	YJL109C	RIB7	P33312	244 aa		0.53	□□□□□ -2.33
UTP10	YJL109C	CSG2	P35206	410 aa		0.53	□□□□□ -2.33
UTP10	YJL109C	KDX1	P36005	433 aa		0.53	□□□□□ -2.33
UTP10	YJL109C	SHB17	P36136	271 aa	Known RBP	0.53	□□□□□ -2.33
UTP10	YJL109C	MRPL28	P36527	147 aa		0.53	□□□□□ -2.33
UTP10	YJL109C	SWD3	P38123	315 aa		0.53	□□□□□ -2.33
UTP10	YJL109C	ARN2	P38724	620 aa		0.53	□□□□□ -2.33
UTP10	YJL109C	COX14	P39103	70 aa		0.53	□□□□□ -2.33

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