RNA–Protein interactions for RNA: YGR296W

YRF1-3, Transcript of Helicase encoded by the Y' element of subtelomeric regions, yeastyeast

Gene YRF1-3, Length 5,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-3YGR296W SEF1P34228 1148 aa7.39□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W MAC1P35192 417 aa7.39□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W RAX1Q08760 435 aa7.39□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W RRG7Q08774 242 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W YIR035CP40579 254 aa7.39□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W RIM21P48565 533 aa7.39□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W NGL1Q08213 363 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W YBR085C-AO43137 85 aa7.38□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W RFA3P26755 122 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W CUE1P38428 203 aa7.38□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W MPC1P53157 130 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W NAM8Q00539 523 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W SAF1P38352 637 aa7.38□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W YML096WQ04489 525 aa7.38□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W FAS2P19097 1887 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W STE4P18851 423 aa7.38□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W YKL075CP36083 450 aa7.38□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W YBR071WP38243 211 aa7.38□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W VEL1P53058 206 aa7.38□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W HXT11P54862 567 aa7.38□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W SKO1Q02100 647 aa7.38□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W FRE3Q08905 711 aa7.38□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W RFA2P26754 273 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W RPL13BP40212 199 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W MEP3P53390 489 aa7.38□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W ROT1Q03691 256 aa7.38□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W YDR415CQ04033 374 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W ERP1Q05359 219 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W IRC13Q08630 104 aa7.38□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W GLO4Q12320 285 aa7.38□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W YOL114CQ12322 202 aa7.38□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W STE18P18852 110 aa7.38□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W RPA135P22138 1203 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W YNR048WP53740 393 aa7.38□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W SAM50P53969 484 aa7.38□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W RCN2Q12044 265 aa7.38□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W YAL064W-BO13512 126 aa7.37□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W ZRC1P20107 442 aa7.37□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W GOS1P38736 223 aa7.37□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W YJR011CP47086 261 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W IMO32P53219 342 aa7.37□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W YPL062WQ02781 134 aa7.37□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W COA4Q05809 96 aa7.37□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W AGC1Q12482 902 aa7.37□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W AI1P03875 834 aa7.37□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W GND1P38720 489 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W HXT9P40885 567 aa7.37□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W RPE1P46969 238 aa7.37□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W YJL043WP47053 257 aa7.37□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W GTF1P53260 183 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W AKR2Q12013 749 aa7.37□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W ALG7P07286 448 aa7.37□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W DFR1P07807 211 aaKnown RBP RIP-Chip data7.37□□□□□ -1.23not detected
YRF1-3YGR296W ERD1P16151 362 aa7.37□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W MKK1P32490 508 aa7.37□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W CDS1P38221 457 aa7.37□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W VPS73P53142 486 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W ERG13P54839 491 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W RHO4Q00246 291 aa7.37□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W SNP1Q00916 300 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W MET3P08536 511 aa7.37□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W STP22P25604 385 aa7.37□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W POA1P38218 177 aa7.37□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W YAE1P47118 141 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W CPR8P53728 308 aa7.37□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W BSC5P53755 489 aa7.37□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W BDS1Q08347 646 aa7.37□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W GLK1P17709 500 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W CHA1P25379 360 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W BUD23P25627 275 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W PTC6P25646 442 aa7.36□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W THI80P35202 319 aa7.36□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W ECM8P38246 354 aa7.36□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data7.36□□□□□ -1.23not detected
YRF1-3YGR296W SPG5P42933 373 aa7.36□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W MCM22P47167 239 aa7.36□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W INP1Q03694 420 aa7.36□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W VAM3Q12241 283 aa7.36□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W PUT3P25502 979 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W TRS65P32893 560 aa7.36□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W ARO9P38840 513 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W YLR456WQ06199 204 aa7.36□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W BSP1Q06604 576 aa7.36□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W RDR1Q08904 546 aa7.36□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W ODC2Q99297 307 aa7.36□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W ADK1P07170 222 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W IMG1P25626 169 aa7.36□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W MDH3P32419 343 aaKnown RBP RIP-Chip data7.36□□□□□ -1.23not detected
YRF1-3YGR296W CKA1P15790 372 aa7.36□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W CTS2Q06350 511 aa7.36□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W SME1Q12330 94 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W MHT1Q12525 324 aa7.36□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W ATG40Q99325 256 aa7.36□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W SPT3P06844 337 aa7.35□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W VBA1Q04301 562 aa7.35□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W YMR090WQ04304 227 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W UTP15Q04305 513 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W MSC3Q05812 728 aa7.35□□□□□ -1.23
YRF1-3YGR296W ISN1Q99312 450 aa7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 142.3 ms