RNA–Protein interactions for RNA: YGL238W

CSE1, Transcript of Nuclear envelope protein that mediates the nuclear export of Srp1p, yeast

Gene CSE1, Length 2,883 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSE1	YGL238W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	0.13	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.13	□□□□□ -2.39	not detected
CSE1	YGL238W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	JEM1	P40358	645 aa		0.13	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	RPS29A	P41057	56 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	MND1	P53102	219 aa		0.13	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	COS6	P53344	381 aa		0.13	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	0.13	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	0.13	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	YMR130W	Q04223	302 aa		0.13	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	YOR268C	Q08734	132 aa		0.13	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	0.13	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	YHR086W-A	Q3E746	53 aa		0.13	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		0.13	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	STE2	D6VTK4	431 aa		0.12	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	TPK3	P05986	398 aa		0.12	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	YCR051W	P25631	222 aa		0.12	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	ADK2	P26364	225 aa		0.12	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	BUD2	P33314	1104 aa		0.12	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	YKL187C	P34231	750 aa		0.12	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	MLH1	P38920	769 aa		0.12	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	GLE2	P40066	365 aa		0.12	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	ATM1	P40416	690 aa		0.12	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	MIC19	P43594	170 aa		0.12	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	RTT102	P53330	157 aa		0.12	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	0.12	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	CDD1	Q06549	142 aa		0.12	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	MED2	Q12124	431 aa		0.12	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	SCM3	Q12334	223 aa		0.12	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		0.12	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	GAL7	P08431	366 aa		0.12	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	YOL163W	P0CF20	169 aa		0.12	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	DSE1	P40077	573 aa		0.12	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	NDE1	P40215	560 aa		0.12	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	MOB2	P43563	287 aa		0.12	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	OST3	P48439	350 aa		0.12	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	RET3	P53600	189 aa		0.12	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	OSH6	Q02201	448 aa		0.12	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	INP1	Q03694	420 aa		0.12	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	YMR166C	Q03829	368 aa		0.12	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	ERP3	Q12403	225 aa		0.12	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	MYO1	P08964	1928 aa		0.12	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	PMT4	P46971	762 aa		0.12	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	0.12	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	0.12	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	0.12	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	SPH1	Q06160	661 aa		0.12	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	YPL150W	Q12152	901 aa		0.12	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	VPS63	O13549	108 aa		0.11	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	0.11	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	ERV1	P27882	189 aa		0.11	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.11	□□□□□ -2.39	not detected
CSE1	YGL238W	YKL102C	P34249	101 aa		0.11	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	ATG7	P38862	630 aa		0.11	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	MNL1	P38888	796 aa		0.11	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	YER188W	P40103	239 aa		0.11	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	PAC11	P40960	533 aa		0.11	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	0.11	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	0.11	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	ARR1	Q06596	294 aa		0.11	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	TIM22	Q12328	207 aa		0.11	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	CDC7	P06243	507 aa		0.11	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	CDC21	P06785	304 aa		0.11	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	KRE6	P32486	720 aa		0.11	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	COS9	P36034	407 aa		0.11	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	MOB1	P40484	314 aa		0.11	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	SLM1	P40485	686 aa		0.11	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	0.11	□□□□□ -2.39	not detected
CSE1	YGL238W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	0.11	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	NUP57	P48837	541 aa		0.11	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	MEH1	Q02205	184 aa		0.11	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	0.11	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	GRR1	P24814	1151 aa		0.1	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	CLB3	P24870	427 aa		0.1	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	CAB3	P36076	571 aa		0.1	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	AYR1	P40471	297 aa		0.1	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	CSM3	Q04659	317 aa		0.1	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	RNH1	Q04740	348 aa		0.1	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	MRX4	Q12467	430 aa		0.1	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	SFG1	Q12507	346 aa		0.1	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		0.1	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	MRP7	P12687	371 aa		0.1	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	CPR2	P23285	205 aa		0.1	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	YCR102C	P25608	368 aa		0.1	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.1	□□□□□ -2.39	not detected
CSE1	YGL238W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	0.1	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	0.1	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	COG3	P40094	801 aa		0.1	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	LST7	P53237	242 aa		0.1	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	0.1	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	PRR2	Q12310	699 aa		0.1	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		0.09	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	0.09	□□□□□ -2.39
CSE1	YGL238W	FAD1	P38913	306 aa		0.09	□□□□□ -2.39

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