RNA–Protein interactions for RNA: YOR033C

EXO1, Transcript of 5'-3' exonuclease and flap-endonuclease, yeast

Gene EXO1, Length 2,109 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EXO1	YOR033C	ACB1	P31787	87 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	MTH1	P35198	433 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	MCH2	P36032	473 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	FRE2	P36033	711 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	MRPL28	P36527	147 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	BNA4	P38169	460 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	MGE1	P38523	228 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	CKB2	P38930	258 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	SLZ1	P40167	298 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	AAD14	P42884	376 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	PFD1	P46988	109 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	DAN1	P47178	298 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	COS10	P52924	374 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	not detected
EXO1	YOR033C	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	GIS1	Q03833	894 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	CRF1	Q04930	467 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	CTS2	Q06350	511 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	VMA9	Q3E7B6	73 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	BUD3	P25558	1636 aa		4.82	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	ERR1	P0CX10	437 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	ERR2	P0CX11	437 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	PET18	P25362	215 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	STP22	P25604	385 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	ATG15	P25641	520 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	MGT1	P26188	188 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	TRS65	P32893	560 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	CTP1	P38152	299 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	TAE1	P38340	232 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	ERG7	P38604	731 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	MDM31	P38880	579 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	AVT2	P39981	480 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	COX15	P40086	486 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	ATF1	P40353	525 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	NTA1	P40354	457 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	SMK1	P41808	388 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	ERR3	P42222	437 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	AIF1	P52923	378 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	SGF73	P53165	657 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	GRX5	Q02784	150 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	ATC1	Q04005	294 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YDR222W	Q04925	415 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.81	□□□□□ -1.64	not detected
EXO1	YOR033C	YLL058W	Q12198	575 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	ISA2	Q12425	185 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YIL134C-A	Q45U18	67 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	PPH21	P23594	369 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	PRE9	P23638	258 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	ADH7	P25377	361 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	STE14	P32584	239 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	MNS1	P32906	549 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	PRY2	P36110	329 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	SHU2	P38957	223 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	ALP1	P38971	573 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	GAT1	P43574	510 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	RMD8	P43620	662 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YJL163C	P46996	555 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	SSY5	P47002	699 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	AVT4	P50944	713 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	MDM34	P53083	459 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YGR151C	P53287	111 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YVH1	Q02256	364 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	TVP15	Q03860	143 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YDR132C	Q03900	495 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	MRPL35	Q06678	367 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	ERP3	Q12403	225 aa		4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
EXO1	YOR033C	PPZ1	P26570	692 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	AEP1	P32493	518 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.8	□□□□□ -1.64	not detected
EXO1	YOR033C	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YBR053C	P38235	358 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	CHS7	P38843	316 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	PFS1	P38872	237 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	FIR1	P40020	876 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	SHO1	P40073	367 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	MGS1	P40151	587 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	SPG5	P42933	373 aa		4.8	□□□□□ -1.64
EXO1	YOR033C	YJL132W	P47014	750 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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