RNA–Protein interactions for RNA: YML116W

ATR1, Transcript of Multidrug efflux pump of the major facilitator superfamily, yeast

Gene ATR1, Length 1,629 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATR1	YML116W	SGT1	Q08446	395 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	RAX1	Q08760	435 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	SET6	Q12529	373 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	SEN2	P16658	377 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	PRR1	P28708	518 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	TAF6	P53040	516 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	HOP2	P53187	214 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	HER2	Q03557	464 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	YMR209C	Q03648	457 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	NNT1	Q05874	261 aa		4.68	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	APA2	P22108	325 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	RRT12	P25381	491 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	MNS1	P32906	549 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	SKT5	P34226	696 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	MOB1	P40484	314 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	YCH1	P42937	148 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	YNR048W	P53740	393 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	SPR6	Q01684	191 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	GMC2	Q06201	188 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	GPX2	P38143	162 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	LDB7	P38210	180 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	COA1	P40452	197 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	MRX5	P47007	382 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	CPR7	P47103	393 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	LST7	P53237	242 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	OKP1	P53298	406 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	STP1	Q00947	519 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	IRC15	Q02733	499 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	YPL080C	Q02826	108 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	PAM18	Q07914	168 aa		4.66	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	HAP2	P06774	265 aa		4.65	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	ACP1	P32463	125 aa		4.65	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	RSM22	P36056	628 aa		4.65	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	HMT1	P38074	348 aa		4.65	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	AGP3	P43548	558 aa		4.65	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	HIT1	P46973	164 aa		4.65	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	COX16	P47081	118 aa		4.65	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	MKC7	P53379	596 aa		4.65	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.66	not detected
ATR1	YML116W	SLT2	Q00772	484 aa		4.65	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	ECM11	Q04110	302 aa		4.65	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	CDD1	Q06549	142 aa		4.65	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
ATR1	YML116W	MKK1	P32490	508 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	SMF2	P38778	549 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	GWT1	P47026	490 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	MRS2	Q01926	470 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	YLR283W	Q05867	314 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	YDL009C	Q12210	107 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	CAP2	P13517	287 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	HEM15	P16622	393 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	EXO70	P19658	623 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	MRPL8	P22353	238 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	PTP1	P25044	335 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	SRB4	P32569	687 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	SSO1	P32867	290 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	CSG2	P35206	410 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	MAL32	P38158	584 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	GEP4	P38812	185 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	YHR182W	P38870	785 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	GUF1	P46943	645 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	AVT4	P50944	713 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	MAL12	P53341	584 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATR1	YML116W	COS1	P53822	381 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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