RNA–Protein interactions for RNA: YJL134W

LCB3, Transcript of Long-chain base-1-phosphate phosphatase, yeastyeast

Gene LCB3, Length 1,230 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB3YJL134W CWP1P28319 239 aa5.76□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W AFR1P33304 620 aa5.76□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W ZRT3P34240 503 aa5.76□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W ALG14P38242 237 aa5.76□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W MBA1P38300 278 aa5.76□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W MIT1P40002 666 aa5.76□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W YPS6P40583 537 aa5.76□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W CAF16P43569 289 aa5.76□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W ATG18P43601 500 aa5.76□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W ALB1P47019 175 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W MDE1P47095 244 aa5.76□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W BPL1P48445 690 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W MSE1P48525 536 aa5.76□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W MRH4P53166 561 aa5.76□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W YGR012WP53206 393 aa5.76□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W PGA1P53896 198 aa5.76□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W SPC19Q03954 165 aa5.76□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W CDA2Q06703 312 aa5.76□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W BRX1Q08235 291 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W RTK1Q12100 620 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W YOL114CQ12322 202 aa5.76□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W TY1A-NL1Q12391 440 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W GPM1P00950 247 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W CAP2P13517 287 aa5.75□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W ERD2P18414 219 aa5.75□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W IMG1P25626 169 aa5.75□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W SPT14P32363 452 aa5.75□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W MDL1P33310 695 aa5.75□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W YBR137WP38276 179 aa5.75□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W ANS1P38832 159 aa5.75□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W HRB1P38922 454 aaKnown RBP RIP-Chip data5.75□□□□□ -1.49not detected
LCB3YJL134W RTT105P40063 208 aa5.75□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W YIL166CP40445 542 aa5.75□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W GDS1P41913 522 aa5.75□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W APS3P47064 194 aa5.75□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W NIT3P49954 291 aa5.75□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W ARO8P53090 500 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W RRN9P53437 365 aa5.75□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W TDA1Q03533 586 aa5.75□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W YMR315WQ04869 349 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W RGC1Q06108 1083 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W GPN3Q06543 272 aa5.75□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W SYO1Q07395 620 aa5.75□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W YDR061WQ12298 539 aa5.75□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W SFG1Q12507 346 aa5.75□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W AI1P03875 834 aa5.74□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W KIN28P06242 306 aa5.74□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W SIR2P06700 562 aa5.74□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W PDE2P06776 526 aa5.74□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W SNF5P18480 905 aa5.74□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W GPI12P23797 304 aa5.74□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W MXR2P25566 168 aa5.74□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W SNC1P31109 117 aa5.74□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data5.74□□□□□ -1.49 RIP-Chip
LCB3YJL134W PDR3P33200 976 aa5.74□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W RPS27AP35997 82 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W JEN1P36035 616 aa5.74□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W SDS22P36047 338 aa5.74□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W UTH1P36135 365 aa5.74□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W MRPL15P36523 253 aa5.74□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W DTR1P38125 572 aa5.74□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W RPS27BP38711 82 aa5.74□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W UTP25P40498 721 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W CIN1P40987 1014 aa5.74□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W YJR141WP47172 347 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W PLM2Q04383 521 aa5.74□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W SNO4Q04902 237 aa5.74□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W SNT309Q06091 175 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W DIC1Q06143 298 aa5.74□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W RRG7Q08774 242 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W HSP33Q08914 237 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W HSP32Q08992 237 aa5.74□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W YOR289WQ12012 251 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W YDL176WQ12027 708 aa5.74□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W PSF1Q12488 208 aa5.74□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W RPL1AP0CX43 217 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W RPL1BP0CX44 217 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W DBF2P22204 572 aa5.73□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W PBN1P25580 416 aa5.73□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W AHC2P25649 128 aa5.73□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W DCG1P32460 244 aa5.73□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W YEF1P32622 495 aa5.73□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W TIM12P32830 109 aa5.73□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W RCN1P36054 211 aa5.73□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W YBR238CP38330 731 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W LEU5P38702 357 aa5.73□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W PZF1P39933 429 aa5.73□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W DUG1P43616 481 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W MDV1P47025 714 aa5.73□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W YJR096WP47137 282 aa5.73□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W TRM9P49957 279 aa5.73□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W BUD9P53226 547 aa5.73□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W TNA1P53322 534 aa5.73□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W PAU12P53343 120 aa5.73□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W YNR062CP53748 327 aa5.73□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W YAT1P80235 687 aa5.73□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W SIZ1Q04195 904 aa5.73□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W BUR2Q05949 395 aa5.73□□□□□ -1.49
LCB3YJL134W YPL199CQ08954 240 aa5.73□□□□□ -1.49
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