RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W YML037CQ03703 340 aa3.2□□□□□ -1.9
VFA1YER128W AIM36Q03798 255 aa3.2□□□□□ -1.9
VFA1YER128W YDR391CQ04170 232 aa3.2□□□□□ -1.9
VFA1YER128W GMC1Q04399 608 aa3.2□□□□□ -1.9
VFA1YER128W MYO5Q04439 1219 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
VFA1YER128W YML096WQ04489 525 aa3.2□□□□□ -1.9
VFA1YER128W SMA2Q04658 369 aa3.2□□□□□ -1.9
VFA1YER128W TVP18Q04767 167 aa3.2□□□□□ -1.9
VFA1YER128W YMR253CQ04835 414 aa3.2□□□□□ -1.9
VFA1YER128W MDM30Q05930 598 aa3.2□□□□□ -1.9
VFA1YER128W YLR179CQ06252 201 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
VFA1YER128W CTS2Q06350 511 aa3.2□□□□□ -1.9
VFA1YER128W CDD1Q06549 142 aa3.2□□□□□ -1.9
VFA1YER128W BER1Q06688 274 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
VFA1YER128W CYK3Q07533 885 aa3.2□□□□□ -1.9
VFA1YER128W YLR036CQ07986 203 aa3.2□□□□□ -1.9
VFA1YER128W SPC3Q12133 184 aa3.2□□□□□ -1.9
VFA1YER128W YPL150WQ12152 901 aa3.2□□□□□ -1.9
VFA1YER128W YLR108CQ12259 485 aa3.2□□□□□ -1.9
VFA1YER128W ATP14Q12349 124 aa3.2□□□□□ -1.9
VFA1YER128W RTN2Q12443 393 aa3.2□□□□□ -1.9
VFA1YER128W ZPS1Q12512 249 aa3.2□□□□□ -1.9
VFA1YER128W DUR1,2P32528 1835 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
VFA1YER128W RSF2P46974 1380 aa3.2□□□□□ -1.9
VFA1YER128W TY3B-GQ99315 1547 aa3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W RPL7AP05737 244 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W SPS2P08459 502 aa3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W YFR010W-AP0C5N0 62 aa3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W RPS18AP0CX55 146 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W RPS18BP0CX56 146 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W CLN3P13365 580 aa3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W EST1P17214 699 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W GRX2P17695 143 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W PTC6P25646 442 aa3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W LDS1P31379 325 aa3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W APE2P32454 952 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W SLC1P33333 303 aa3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W ECT1P33412 323 aa3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W GCS1P35197 352 aa3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W PTK1P36002 662 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W YNK1P36010 153 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W YKL071WP36086 256 aa3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W YKL070WP36087 169 aa3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W AVT5P38176 459 aa3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W CST26P38226 397 aa3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W DER1P38307 211 aa3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W ARN1P38731 627 aa3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W EFM1P38732 585 aa3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W RPF1P38805 295 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W SEO1P39709 593 aa3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W YEL068CP39977 110 aa3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W RFC2P40348 353 aa3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W YIL067CP40514 678 aa3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W PRM2P40534 656 aa3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W TIR3P40552 269 aa3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W QRI7P43122 407 aa3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W MNN5P46982 586 aa3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W YJR011CP47086 261 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W YIP3P53633 176 aa3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W YNL140CP53910 189 aa3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W GPD1Q00055 391 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W RSC9Q03124 581 aa3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W CTL1Q03220 320 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W SDH7Q04401 133 aa3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W APC4Q04601 652 aa3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W YDR278CQ05612 105 aa3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W GAS2Q06135 555 aa3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W HIM1Q06674 414 aa3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W SSK1Q07084 712 aa3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W RTT109Q07794 436 aa3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W YOR365CQ08844 703 aa3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W GPM2Q12008 311 aa3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W YRA1Q12159 226 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W RPL7BQ12213 244 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W YIR021W-AQ3E739 70 aa3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W YLR361C-AQ3E795 98 aa3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W YOR1P53049 1477 aa3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W DNF1P32660 1571 aa3.19□□□□□ -1.9
VFA1YER128W YBR085C-AO43137 85 aa3.18□□□□□ -1.9
VFA1YER128W TDH2P00358 332 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
VFA1YER128W TDH3P00359 332 aaKnown RBP RIP-Chip data3.18□□□□□ -1.9not detected
VFA1YER128W GAL80P04387 435 aa3.18□□□□□ -1.9
VFA1YER128W BCY1P07278 416 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
VFA1YER128W RPL3P14126 387 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
VFA1YER128W YCK1P23291 538 aa3.18□□□□□ -1.9
VFA1YER128W YCP4P25349 247 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
VFA1YER128W SGF29P25554 259 aa3.18□□□□□ -1.9
VFA1YER128W PPA2P28239 310 aa3.18□□□□□ -1.9
VFA1YER128W PEX4P29340 183 aa3.18□□□□□ -1.9
VFA1YER128W SPS19P32573 292 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
VFA1YER128W UTR4P32626 227 aa3.18□□□□□ -1.9
VFA1YER128W SKT5P34226 696 aa3.18□□□□□ -1.9
VFA1YER128W SSS1P35179 80 aa3.18□□□□□ -1.9
VFA1YER128W TCD2P36101 447 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
VFA1YER128W GEX2P36173 615 aa3.18□□□□□ -1.9
VFA1YER128W VHC1P38329 1120 aa3.18□□□□□ -1.9
VFA1YER128W CHL4P38907 458 aa3.18□□□□□ -1.9
VFA1YER128W SRP14P38985 146 aa3.18□□□□□ -1.9
VFA1YER128W DHH1P39517 506 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
VFA1YER128W LCP5P40079 357 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
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