RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W DRE2P36152 348 aa5.07□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W YBR056WP38081 501 aa5.07□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W GND1P38720 489 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W ISC1P40015 477 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W ALD5P40047 520 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W PRE6P40303 254 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W YIL060WP40519 144 aa5.07□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W CAK1P43568 368 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W MNN5P46982 586 aa5.07□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W SNX4P47057 423 aa5.07□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W HAM1P47119 197 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W YNL181WP53878 407 aa5.07□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W IMP4P53941 290 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W DML1Q03652 475 aa5.07□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W RNH1Q04740 348 aa5.07□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W PAR32Q12515 295 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W PDE2P06776 526 aa5.06□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W UNG1P12887 359 aa5.06□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W IDP1P21954 428 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W CPR2P23285 205 aa5.06□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W RBK1P25332 333 aa5.06□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W ATG22P25568 528 aa5.06□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W ERV1P27882 189 aa5.06□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W RML2P32611 393 aa5.06□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W LDB7P38210 180 aa5.06□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W YHL026CP38740 315 aa5.06□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W MNN9P39107 395 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W IRC18P47056 224 aa5.06□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W DBP6P53734 629 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W TRM112P53738 135 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W CWC25P53854 179 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W MET31Q03081 177 aa5.06□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W ATG31Q12421 196 aa5.06□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W PDH1Q12428 516 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W GAL4P04386 881 aa5.05□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W PEP4P07267 405 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W MDL1P33310 695 aa5.05□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W MLH1P38920 769 aa5.05□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W GDI1P39958 451 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W VRG4P40107 337 aa5.05□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W JHD2P47156 728 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W IGO1P53897 168 aa5.05□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W MPS1P54199 764 aa5.05□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W DID2P69771 204 aa5.05□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W YVH1Q02256 364 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W IRC15Q02733 499 aa5.05□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W OAZ1Q02803 292 aa5.05□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W RRP45Q05636 305 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W YDL218WQ07629 317 aa5.05□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W COS7Q07788 383 aa5.05□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W YNG1Q08465 219 aa5.05□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W RDR1Q08904 546 aa5.05□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W MDM32Q12171 622 aa5.05□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W RPN5Q12250 445 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W YDR061WQ12298 539 aa5.05□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W CDC21P06785 304 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W SPS4P09937 338 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W MAS1P10507 462 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W DBP3P20447 523 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W IDH2P28241 369 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W RNP1P32385 249 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W VPH1P32563 840 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W SEC17P32602 292 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W JEN1P36035 616 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W YCR087C-AP37263 153 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W NAT2P37293 288 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W ARA1P38115 344 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W SIF2P38262 535 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W BMT2P38278 337 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W MBA1P38300 278 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W NTC20P38302 140 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W MBB1P39534 108 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W PAN6P40459 309 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W HXT9P40885 567 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W YJL218WP40892 196 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W ATG27P46989 271 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W MDE1P47095 244 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W VPS25P47142 202 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W SMM1P53720 384 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W ERG13P54839 491 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W PIR3Q03180 325 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W CAC2Q04199 468 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W COX20Q04935 205 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W NCE102Q12207 173 aaRIP-Chip data5.04□□□□□ -1.6not detected
VHS1YDR247W LAG2Q92325 660 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W RPC40P07703 335 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W SGV1P23293 657 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W TAH1P25638 111 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W TAF14P35189 244 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W PIM1P36775 1133 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W LEU5P38702 357 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W LAG1P38703 411 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W YHR210CP38893 341 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W PHO90P39535 881 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W RRG9P40156 214 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W MEP1P40260 492 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W YGR149WP48236 432 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W TPN1P53099 579 aa5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W MPC1P53157 130 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
VHS1YDR247W MKC7P53379 596 aa5.04□□□□□ -1.6
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