RNA–Protein interactions for RNA: YOR048C

RAT1, Transcript of Nuclear 5' to 3' single-stranded RNA exonuclease, yeast

Gene RAT1, Length 3,021 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RAT1	YOR048C	RHO4	Q00246	291 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	ARG5,6	Q01217	863 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	YOR238W	Q08634	303 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	FRE3	Q08905	711 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	YPL066W	Q12194	479 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	YOR114W	Q12219	294 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	RTN2	Q12443	393 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	CAN1	P04817	590 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	RAM1	P22007	431 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	YSR3	P23501	404 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	RNQ1	P25367	405 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	PTR2	P32901	601 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
RAT1	YOR048C	SCO2	P38072	301 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	CHL4	P38907	458 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	TMN2	Q04562	672 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	YEH1	Q07804	573 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	YBR063C	P38083	404 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	LDH1	P38139	375 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	OCA5	P38738	679 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	SDT1	P53078	280 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	YLR446W	Q06204	433 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	YLR031W	Q07978	186 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	HXT2	P23585	541 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	NAT2	P37293	288 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	NTA1	P40354	457 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	AAD10	P47182	288 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	SNN1	P48232	102 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	AIM36	Q03798	255 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	RNH1	Q04740	348 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	GAS2	Q06135	555 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	TGL5	Q12043	749 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	PCL9	Q12477	304 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	UTR1	P21373	530 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	MRS4	P23500	304 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	TY2A-C	P25383	438 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	SUA5	P32579	426 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	PXA2	P34230	853 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	DTR1	P38125	572 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	MEP1	P40260	492 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	YIL060W	P40519	144 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	YFR018C	P43599	363 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	VHT1	P53241	593 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	YNR014W	P53719	212 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	YNR021W	P53723	404 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	YSA1	Q01976	231 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	RRN11	Q04712	507 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	DXO1	Q06349	442 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	YPR015C	Q12531	247 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	ISF1	P32488	338 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	GGC1	P38988	300 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	AGX1	P43567	385 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	MCM22	P47167	239 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	YGR035C	P53222	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	REC102	Q02721	264 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	YHM2	Q04013	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	ROY1	Q04847	553 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	TAZ1	Q06510	381 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	KIN3	P22209	435 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	LAG1	P38703	411 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	BUR6	P40096	142 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	POP6	P53218	158 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	YLR283W	Q05867	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	IPK1	Q06667	281 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	MMT2	Q08970	484 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	SFM1	Q12314	213 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	REV1	P12689	985 aa		4.9	□□□□□ -1.62
RAT1	YOR048C	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62

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