RNA–Protein interactions for RNA: YGR035C

YGR035C, Transcript of Putative protein of unknown function, potential Cdc28p substrate, yeast

Gene YGR035C, Length 351 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YGR035C	YGR035C	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
YGR035C	YGR035C	FEX1	Q08913	375 aa		0.98	□□□□□ -2.25
YGR035C	YGR035C	FEX2	Q08991	375 aa		0.98	□□□□□ -2.25
YGR035C	YGR035C	GPM3	Q12326	303 aa		0.98	□□□□□ -2.25
YGR035C	YGR035C	ISA2	Q12425	185 aa		0.98	□□□□□ -2.25
YGR035C	YGR035C	YNL320W	P42840	284 aa		0.97	□□□□□ -2.25
YGR035C	YGR035C	FAR1	P21268	830 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	0.96	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	SLM1	P40485	686 aa		0.96	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	SMF2	P38778	549 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	DSE1	P40077	573 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	0.95	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	LST7	P53237	242 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	RET3	P53600	189 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	YNL095C	P53932	642 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	RPN6	Q12377	434 aa		0.95	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	ATG7	P38862	630 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	TPC1	P53257	314 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	0.94	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	SRN2	Q99176	213 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	MHP1	P43638	1398 aa		0.94	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	0.93	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	MSK1	P32048	576 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	YEL043W	P32618	956 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	JNM1	P36224	373 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	CTM1	P38818	585 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	MLH1	P38920	769 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.93	□□□□□ -2.26	RIP-Chip
YGR035C	YGR035C	EPL1	P43572	832 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	0.93	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	AIM33	Q04516	312 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	YPR078C	Q06813	372 aa		0.93	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	DAP2	P18962	818 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	TFC7	Q12415	435 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	FSH3	Q99369	266 aa		0.92	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	YKL187C	P34231	750 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	SNL1	P40548	159 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	PMT4	P46971	762 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	SDS23	P53172	527 aa		0.91	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
YGR035C	YGR035C	CDC42	P19073	191 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.9	□□□□□ -2.27	not detected
YGR035C	YGR035C	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	GYL1	Q04322	720 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	CSM3	Q04659	317 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	PEX27	Q08580	376 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	TRM10	Q12400	293 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	ERP3	Q12403	225 aa		0.9	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	PSO2	P30620	661 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	CLB6	P32943	380 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	CSE1	P33307	960 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	DSK2	P48510	373 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	SMP3	Q04174	516 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	SPH1	Q06160	661 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	MIM1	Q08176	113 aa		0.89	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	PHO80	P20052	293 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	CKI1	P20485	582 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	MRPS5	P33759	307 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	NRG2	P38082	220 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	YBL028C	P38202	106 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	DAN1	P47178	298 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	0.88	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	SPC19	Q03954	165 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	TIM22	Q12328	207 aa		0.88	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	0.87	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	YOL163W	P0CF20	169 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	YAK1	P14680	807 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	CAB3	P36076	571 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	POP2	P39008	433 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	0.87	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	EFM4	P40516	257 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	NAT4	Q04751	285 aa		0.87	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	PIR5	P46999	287 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	UFD1	P53044	361 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	VPS68	Q12016	184 aa		0.86	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	UTR1	P21373	530 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	GRR1	P24814	1151 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	MXR2	P25566	168 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	YFR054C	P43622	192 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	APC5	Q08683	685 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	YHR086W-A	Q3E746	53 aa		0.85	□□□□□ -2.27
YGR035C	YGR035C	RAD1	P06777	1100 aa		0.84	□□□□□ -2.27

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 130 ms