RNA–Protein interactions for RNA: YOR349W

CIN1, Transcript of Tubulin folding factor D involved in beta-tubulin (Tub2p) folding, yeast

Gene CIN1, Length 3,045 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIN1	YOR349W	PHO87	P25360	923 aa		4.21	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	CIT2	P08679	460 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	QDR1	P40475	563 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	ACF4	P47129	309 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	PUN1	Q06991	263 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	MNL2	Q12205	849 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	HAP4	P14064	554 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	DCW1	P36091	449 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	EMP47	P43555	445 aa		4.2	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	AI4	P03878	556 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	MPH3	P0CE00	602 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	SRS2	P12954	1174 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	ATG3	P40344	310 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	BUB1	P41695	1021 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.19	□□□□□ -1.74	not detected
CIN1	YOR349W	IOC3	P43596	787 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	YNL115C	P53925	644 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	POB3	Q04636	552 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	FRT1	Q99332	602 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	MET4	P32389	672 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	FYV10	P40492	516 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	YJL049W	P47048	450 aa		4.19	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	RTF1	P53064	558 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	PUS6	P53294	404 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.18	□□□□□ -1.74	not detected
CIN1	YOR349W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	SLI15	P38283	698 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	TBF1	Q02457	562 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	NSE3	Q05541	303 aa		4.18	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	CLN2	P20438	545 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	ROM1	P53046	1155 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	VPS16	Q03308	798 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	YOR131C	Q12486	218 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.17	□□□□□ -1.74	not detected
CIN1	YOR349W	CDC73	Q06697	393 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	PIN2	Q12057	282 aa		4.17	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	MIP1	P15801	1254 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.16	□□□□□ -1.74	not detected
CIN1	YOR349W	RPN4	Q03465	531 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	GAS4	Q08271	471 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	VAN1	P23642	535 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	MCM2	P29469	868 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	TIF4632	P39936	914 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	HTA1	P04911	132 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	HTA2	P04912	132 aa		4.15	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	PEP7	P32609	515 aa		4.15	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	RMD1	Q03441	430 aa		4.15	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	YOL036W	Q08206	761 aa		4.15	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.15	□□□□□ -1.74
CIN1	YOR349W	PDR1	P12383	1068 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	SPR28	Q04921	423 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.14	□□□□□ -1.75	not detected
CIN1	YOR349W	TSC13	Q99190	310 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	TRS33	Q99394	268 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	GUT2	P32191	649 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	SOH1	P38633	127 aa		4.14	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.14	□□□□□ -1.75	not detected
CIN1	YOR349W	TEC1	P18412	486 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	TPM2	P40414	161 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	SPR3	P41901	512 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	DAN4	P47179	1161 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	YGL081W	P53156	320 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	TPO2	P53283	614 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	CWC24	P53769	259 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	FRA1	Q07825	749 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	RTT106	P40161	455 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	YRR1	Q12172	810 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	GIN4	Q12263	1142 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	MNN1	P39106	762 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	GTT3	P39996	337 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	SET4	P42948	560 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	TRS120	Q04183	1289 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	YOL057W	Q08225	711 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	LSO1	Q3E827	93 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	BUD6	P41697	788 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	KEX2	P13134	814 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	GRX4	P32642	244 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	GCD6	P32501	712 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	BDF2	Q07442	638 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	YDL206W	Q12424	762 aa		4.11	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
CIN1	YOR349W	PET112	P33893	541 aa		4.1	□□□□□ -1.75

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