RNA–Protein interactions for RNA: YLR369W

SSQ1, Transcript of Mitochondrial hsp70-type molecular chaperone, yeastyeast

Gene SSQ1, Length 1,974 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1YLR369W TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa4.05□□□□□ -1.76
SSQ1YLR369W TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa4.05□□□□□ -1.76
SSQ1YLR369W TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
SSQ1YLR369W TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
SSQ1YLR369W TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa4.05□□□□□ -1.76
SSQ1YLR369W TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
SSQ1YLR369W TY1B-JR1P47098 1755 aa4.05□□□□□ -1.76
SSQ1YLR369W TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
SSQ1YLR369W TY1B-ER1Q03612 1755 aa4.05□□□□□ -1.76
SSQ1YLR369W TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
SSQ1YLR369W TY1B-GR2Q12269 1755 aa4.05□□□□□ -1.76
SSQ1YLR369W TY1B-OLQ12273 1755 aa4.05□□□□□ -1.76
SSQ1YLR369W TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
SSQ1YLR369W YRF1-1P0CX20 1796 aa4.05□□□□□ -1.76
SSQ1YLR369W YRF1-5P0CX21 1796 aa4.05□□□□□ -1.76
SSQ1YLR369W YRF1-8P0CX22 1796 aa4.05□□□□□ -1.76
SSQ1YLR369W CAF120P53836 1060 aa4.05□□□□□ -1.76
SSQ1YLR369W TY2B-BQ12491 1770 aa4.04□□□□□ -1.76
SSQ1YLR369W PUS5Q06244 254 aa4.04□□□□□ -1.76
SSQ1YLR369W MVP1P40959 511 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
SSQ1YLR369W YPR109WQ06104 294 aa4.03□□□□□ -1.76
SSQ1YLR369W ERF2Q06551 359 aa4.03□□□□□ -1.76
SSQ1YLR369W MAM3Q12296 706 aa4.03□□□□□ -1.76
SSQ1YLR369W MOD5P07884 428 aa4.03□□□□□ -1.76
SSQ1YLR369W DNF2Q12675 1612 aa4.03□□□□□ -1.76
SSQ1YLR369W KEX2P13134 814 aa4.02□□□□□ -1.77
SSQ1YLR369W TRK2P28584 889 aa4.02□□□□□ -1.77
SSQ1YLR369W PSE1P32337 1089 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
SSQ1YLR369W TY1B-DR3Q99231 1755 aa4.02□□□□□ -1.77
SSQ1YLR369W ACO2P39533 789 aa4.02□□□□□ -1.77
SSQ1YLR369W PAC1P39946 494 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
SSQ1YLR369W DRS2P39524 1355 aa4.01□□□□□ -1.77
SSQ1YLR369W RGR1P19263 1082 aa4□□□□□ -1.77
SSQ1YLR369W VPS15P22219 1454 aa3.99□□□□□ -1.77
SSQ1YLR369W MMS22Q06164 1454 aa3.99□□□□□ -1.77
SSQ1YLR369W IES2P40154 320 aa3.99□□□□□ -1.77
SSQ1YLR369W CLB5P30283 435 aa3.98□□□□□ -1.77
SSQ1YLR369W NUP42P49686 430 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
SSQ1YLR369W YGR035CP53222 116 aa3.98□□□□□ -1.77
SSQ1YLR369W TRM732Q03496 1420 aa3.98□□□□□ -1.77
SSQ1YLR369W SPB4P25808 606 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
SSQ1YLR369W TOP2P06786 1428 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
SSQ1YLR369W NUP159P40477 1460 aa3.97□□□□□ -1.77
SSQ1YLR369W NRD1P53617 575 aaKnown RBP RIP-Chip data3.97□□□□□ -1.77not detected
SSQ1YLR369W OPT2Q06593 877 aa3.96□□□□□ -1.77
SSQ1YLR369W TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
SSQ1YLR369W TY1B-ER2Q03619 1755 aa3.96□□□□□ -1.78
SSQ1YLR369W TY1B-MR1Q04214 1755 aa3.96□□□□□ -1.78
SSQ1YLR369W TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
SSQ1YLR369W TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
SSQ1YLR369W TY1B-NL1Q12112 1755 aa3.96□□□□□ -1.78
SSQ1YLR369W TY1B-GR1Q12141 1755 aa3.96□□□□□ -1.78
SSQ1YLR369W TY1B-BLQ12490 1755 aa3.96□□□□□ -1.78
SSQ1YLR369W MSB3P48566 633 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
SSQ1YLR369W YOR093CQ12275 1648 aa3.96□□□□□ -1.78
SSQ1YLR369W AGE1Q04412 482 aa3.95□□□□□ -1.78
SSQ1YLR369W TUB4P53378 473 aa3.94□□□□□ -1.78
SSQ1YLR369W NTE1Q04958 1679 aa3.94□□□□□ -1.78
SSQ1YLR369W HPF1Q05164 967 aa3.94□□□□□ -1.78
SSQ1YLR369W YLR346CQ06139 101 aa3.94□□□□□ -1.78
SSQ1YLR369W YIR007WP40566 764 aa3.93□□□□□ -1.78
SSQ1YLR369W DIT2P21595 489 aa3.93□□□□□ -1.78
SSQ1YLR369W LSB3P43603 459 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
SSQ1YLR369W YNR021WP53723 404 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
SSQ1YLR369W RPO21P04050 1733 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
SSQ1YLR369W PTK2P47116 818 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
SSQ1YLR369W RTF1P53064 558 aa3.92□□□□□ -1.78
SSQ1YLR369W LEU3P08638 886 aa3.91□□□□□ -1.78
SSQ1YLR369W UGA3P26370 528 aa3.91□□□□□ -1.78
SSQ1YLR369W SIT4P20604 311 aa3.91□□□□□ -1.78
SSQ1YLR369W TEA1P47988 759 aa3.91□□□□□ -1.78
SSQ1YLR369W SRF1Q12516 437 aa3.91□□□□□ -1.78
SSQ1YLR369W NUP170P38181 1502 aa3.9□□□□□ -1.78
SSQ1YLR369W GLY1P37303 387 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
SSQ1YLR369W SPP41P38904 1435 aa3.9□□□□□ -1.79
SSQ1YLR369W ICP55P40051 511 aa3.89□□□□□ -1.79
SSQ1YLR369W DOP1Q03921 1698 aa3.89□□□□□ -1.79
SSQ1YLR369W SPO14P36126 1683 aa3.89□□□□□ -1.79
SSQ1YLR369W SCW11P53189 542 aa3.89□□□□□ -1.79
SSQ1YLR369W SYH1Q02875 849 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
SSQ1YLR369W AIM7Q12156 149 aa3.89□□□□□ -1.79
SSQ1YLR369W VTH1P40438 1549 aa3.88□□□□□ -1.79
SSQ1YLR369W VTH2P40890 1549 aa3.88□□□□□ -1.79
SSQ1YLR369W TSC11P40061 1430 aa3.88□□□□□ -1.79
SSQ1YLR369W KXD1P53158 218 aa3.87□□□□□ -1.79
SSQ1YLR369W NIS1P53939 407 aa3.87□□□□□ -1.79
SSQ1YLR369W PUS1Q12211 544 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
SSQ1YLR369W SMC4Q12267 1418 aa3.87□□□□□ -1.79
SSQ1YLR369W NUP85P46673 744 aa3.87□□□□□ -1.79
SSQ1YLR369W YNL115CP53925 644 aa3.87□□□□□ -1.79
SSQ1YLR369W TYW1Q08960 810 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
SSQ1YLR369W TY1A-BLQ12266 440 aa3.87□□□□□ -1.79
SSQ1YLR369W POL1P13382 1468 aa3.86□□□□□ -1.79
SSQ1YLR369W TPD3P31383 635 aa3.86□□□□□ -1.79
SSQ1YLR369W YPR204WQ08995 1032 aa3.86□□□□□ -1.79
SSQ1YLR369W SNT2P53127 1403 aa3.86□□□□□ -1.79
SSQ1YLR369W YOR1P53049 1477 aa3.86□□□□□ -1.79
SSQ1YLR369W MIP1P15801 1254 aa3.85□□□□□ -1.79
SSQ1YLR369W YMR196WQ04336 1088 aa3.85□□□□□ -1.79
SSQ1YLR369W GLC3P32775 704 aa3.85□□□□□ -1.79
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