RNA–Protein interactions for RNA: YLR167W

RPS31, Transcript of Fusion protein cleaved to yield ribosomal protein S31 and ubiquitin, yeast

Gene RPS31, Length 459 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS31	YLR167W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
RPS31	YLR167W	ENV9	Q08651	330 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RPS31	YLR167W	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
RPS31	YLR167W	ISF1	P32488	338 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS31	YLR167W	APL6	P46682	809 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS31	YLR167W	ECM23	Q02710	187 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RPS31	YLR167W	TPD3	P31383	635 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS31	YLR167W	KXD1	P53158	218 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS31	YLR167W	YDR344C	Q05510	147 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RPS31	YLR167W	PRT1	P06103	763 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RPS31	YLR167W	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RPS31	YLR167W	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RPS31	YLR167W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RPS31	YLR167W	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RPS31	YLR167W	YML082W	Q04533	649 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
RPS31	YLR167W	HAT1	Q12341	374 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RPS31	YLR167W	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
RPS31	YLR167W	KTR7	P40504	517 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RPS31	YLR167W	PHO87	P25360	923 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RPS31	YLR167W	YPR015C	Q12531	247 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RPS31	YLR167W	HXT10	P43581	546 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RPS31	YLR167W	HAP4	P14064	554 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RPS31	YLR167W	VAC17	P25591	423 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RPS31	YLR167W	HEM3	P28789	327 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RPS31	YLR167W	UBX7	P38349	436 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RPS31	YLR167W	RRN7	P40992	514 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RPS31	YLR167W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RPS31	YLR167W	BMT6	Q12291	365 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RPS31	YLR167W	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RPS31	YLR167W	SOH1	P38633	127 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RPS31	YLR167W	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RPS31	YLR167W	STM1	P39015	273 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RPS31	YLR167W	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RPS31	YLR167W	MOD5	P07884	428 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RPS31	YLR167W	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RPS31	YLR167W	PRE3	P38624	215 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RPS31	YLR167W	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RPS31	YLR167W	GAS4	Q08271	471 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RPS31	YLR167W	TSC13	Q99190	310 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RPS31	YLR167W	ROM1	P53046	1155 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RPS31	YLR167W	SAS4	Q04003	481 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RPS31	YLR167W	SEC20	P28791	383 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RPS31	YLR167W	SNU71	P53207	620 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RPS31	YLR167W	YBL113C	Q7M4S9	792 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RPS31	YLR167W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
RPS31	YLR167W	IXR1	P33417	597 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RPS31	YLR167W	ERP5	P38819	212 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RPS31	YLR167W	YFL034W	P43564	1073 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RPS31	YLR167W	KAR5	Q04746	504 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RPS31	YLR167W	TRL1	P09880	827 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
RPS31	YLR167W	SRS2	P12954	1174 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RPS31	YLR167W	CHL1	P22516	861 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
RPS31	YLR167W	ASF1	P32447	279 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RPS31	YLR167W	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
RPS31	YLR167W	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
RPS31	YLR167W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
RPS31	YLR167W	VAN1	P23642	535 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RPS31	YLR167W	ATG1	P53104	897 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RPS31	YLR167W	PNP1	Q05788	311 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RPS31	YLR167W	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
RPS31	YLR167W	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
RPS31	YLR167W	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.2	□□□□□ -1.26	not detected
RPS31	YLR167W	UBP1	P25037	809 aa		7.19	□□□□□ -1.26
RPS31	YLR167W	RRN6	P32786	894 aa		7.19	□□□□□ -1.26
RPS31	YLR167W	IPL1	P38991	367 aa		7.19	□□□□□ -1.26
RPS31	YLR167W	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
RPS31	YLR167W	MDJ2	P42834	146 aa		7.19	□□□□□ -1.26
RPS31	YLR167W	PUN1	Q06991	263 aa		7.19	□□□□□ -1.26
RPS31	YLR167W	ATG20	Q07528	640 aa		7.19	□□□□□ -1.26
RPS31	YLR167W	TRS33	Q99394	268 aa		7.19	□□□□□ -1.26
RPS31	YLR167W	PPX1	P38698	397 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RPS31	YLR167W	BOL3	P39724	118 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RPS31	YLR167W	HDA3	Q06623	655 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RPS31	YLR167W	GYP1	Q08484	637 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RPS31	YLR167W	MIP1	P15801	1254 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RPS31	YLR167W	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	7.17	□□□□□ -1.26
RPS31	YLR167W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
RPS31	YLR167W	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
RPS31	YLR167W	YHL050C	P38721	697 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RPS31	YLR167W	YHR219W	P38900	624 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RPS31	YLR167W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
RPS31	YLR167W	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
RPS31	YLR167W	NTH2	P35172	780 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RPS31	YLR167W	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
RPS31	YLR167W	ACF4	P47129	309 aa		7.15	□□□□□ -1.26
RPS31	YLR167W	KIP2	P28743	706 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RPS31	YLR167W	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
RPS31	YLR167W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
RPS31	YLR167W	SUV3	P32580	737 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RPS31	YLR167W	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	7.13	□□□□□ -1.27
RPS31	YLR167W	LSO1	Q3E827	93 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RPS31	YLR167W	CYT1	P07143	309 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RPS31	YLR167W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
RPS31	YLR167W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
RPS31	YLR167W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
RPS31	YLR167W	CWH41	P53008	833 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RPS31	YLR167W	ISU1	Q03020	165 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RPS31	YLR167W	ITT1	Q04638	464 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RPS31	YLR167W	FBP26	P32604	452 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RPS31	YLR167W	QDR1	P40475	563 aa		7.11	□□□□□ -1.27

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