RNA–Protein interactions for RNA: YJR147W

HMS2, Transcript of Protein with similarity to heat shock transcription factors, yeast

Gene HMS2, Length 1,077 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HMS2	YJR147W	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	7.78	□□□□□ -1.16
HMS2	YJR147W	TOM20	P35180	183 aa		7.77	□□□□□ -1.17
HMS2	YJR147W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	7.77	□□□□□ -1.17
HMS2	YJR147W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	7.77	□□□□□ -1.17
HMS2	YJR147W	YAF9	P53930	226 aa		7.77	□□□□□ -1.17
HMS2	YJR147W	HIR3	P47171	1648 aa		7.77	□□□□□ -1.17
HMS2	YJR147W	PET111	P08468	800 aa		7.76	□□□□□ -1.17
HMS2	YJR147W	SLI15	P38283	698 aa		7.76	□□□□□ -1.17
HMS2	YJR147W	RTT106	P40161	455 aa		7.76	□□□□□ -1.17
HMS2	YJR147W	UBX5	Q06682	500 aa		7.76	□□□□□ -1.17
HMS2	YJR147W	PDR10	P51533	1564 aa		7.76	□□□□□ -1.17
HMS2	YJR147W	IRC20	Q06554	1556 aa		7.76	□□□□□ -1.17
HMS2	YJR147W	RAD2	P07276	1031 aa		7.75	□□□□□ -1.17
HMS2	YJR147W	YPP1	P46951	817 aa		7.75	□□□□□ -1.17
HMS2	YJR147W	DPL1	Q05567	589 aa		7.75	□□□□□ -1.17
HMS2	YJR147W	RRN6	P32786	894 aa		7.74	□□□□□ -1.17
HMS2	YJR147W	BYE1	P36106	594 aa		7.74	□□□□□ -1.17
HMS2	YJR147W	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
HMS2	YJR147W	MSH3	P25336	1018 aa		7.73	□□□□□ -1.17
HMS2	YJR147W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
HMS2	YJR147W	TCD1	P38756	429 aa		7.73	□□□□□ -1.17
HMS2	YJR147W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
HMS2	YJR147W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	7.72	□□□□□ -1.17
HMS2	YJR147W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	7.72	□□□□□ -1.17
HMS2	YJR147W	RGA2	Q06407	1009 aa		7.72	□□□□□ -1.17
HMS2	YJR147W	YPK9	Q12697	1472 aa		7.72	□□□□□ -1.17
HMS2	YJR147W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	ERP2	P39704	215 aa		7.71	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	TPM2	P40414	161 aa		7.71	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	RNT1	Q02555	471 aa		7.71	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	ESC2	Q06340	456 aa		7.71	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	NUP170	P38181	1502 aa		7.71	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	SWI3	P32591	825 aa		7.7	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	7.7	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	HOS4	P40480	1083 aa		7.7	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	GRX3	Q03835	250 aa		7.7	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	MAM3	Q12296	706 aa		7.7	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	SIC1	P38634	284 aa		7.69	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	OCA5	P38738	679 aa		7.69	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	MEH1	Q02205	184 aa		7.69	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	SSM4	P40318	1319 aa		7.69	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	PAN1	P32521	1480 aa		7.68	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	RAS1	P01119	309 aa		7.68	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	DAL5	P15365	543 aa		7.68	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	7.68	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	VPS60	Q03390	229 aa		7.68	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	TAF13	P11747	167 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	CLB1	P24868	471 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	RGA1	P39083	1007 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	7.67	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	YVC1	Q12324	675 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	MLP2	P40457	1679 aa		7.67	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	MSP1	P28737	362 aa		7.66	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	SEC20	P28791	383 aa		7.66	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	CLB5	P30283	435 aa		7.66	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	7.66	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	7.66	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	7.66	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	IES1	P43579	692 aa		7.66	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	YPR015C	Q12531	247 aa		7.66	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	PCT1	P13259	424 aa		7.65	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	7.65	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	TSR4	P25040	408 aa		7.65	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	HEM3	P28789	327 aa		7.65	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	DEP1	P31385	405 aa		7.65	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	DJP1	P40564	432 aa		7.65	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	MHP1	P43638	1398 aa		7.65	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	YGL081W	P53156	320 aa		7.65	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	7.65	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	7.65	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	7.65	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	ISU2	Q12056	156 aa		7.65	□□□□□ -1.18
HMS2	YJR147W	BLI1	P35727	113 aa		7.64	□□□□□ -1.19
HMS2	YJR147W	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	7.64	□□□□□ -1.19
HMS2	YJR147W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	7.64	□□□□□ -1.19
HMS2	YJR147W	VPS30	Q02948	557 aa		7.64	□□□□□ -1.19
HMS2	YJR147W	YDL121C	Q07541	149 aa		7.64	□□□□□ -1.19
HMS2	YJR147W	RAD9	P14737	1309 aa		7.63	□□□□□ -1.19
HMS2	YJR147W	KEX1	P09620	729 aa		7.63	□□□□□ -1.19
HMS2	YJR147W	RAM1	P22007	431 aa		7.63	□□□□□ -1.19
HMS2	YJR147W	CIN4	P39110	191 aa		7.63	□□□□□ -1.19
HMS2	YJR147W	ITT1	Q04638	464 aa		7.63	□□□□□ -1.19
HMS2	YJR147W	MDM38	Q08179	573 aa		7.63	□□□□□ -1.19
HMS2	YJR147W	PSK2	Q08217	1101 aa		7.63	□□□□□ -1.19
HMS2	YJR147W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	7.63	□□□□□ -1.19
HMS2	YJR147W	STU1	P38198	1513 aa		7.62	□□□□□ -1.19
HMS2	YJR147W	GYP1	Q08484	637 aa		7.62	□□□□□ -1.19
HMS2	YJR147W	TAF2	P23255	1407 aa		7.61	□□□□□ -1.19
HMS2	YJR147W	CDC11	P32458	415 aa		7.61	□□□□□ -1.19
HMS2	YJR147W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
HMS2	YJR147W	MED8	P38304	223 aa		7.61	□□□□□ -1.19
HMS2	YJR147W	NNF1	P47149	201 aa		7.61	□□□□□ -1.19
HMS2	YJR147W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
HMS2	YJR147W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.61	□□□□□ -1.19	RIP-Chip
HMS2	YJR147W	MDS3	P53094	1487 aa		7.61	□□□□□ -1.19
HMS2	YJR147W	ECM1	P39715	212 aa		7.6	□□□□□ -1.19
HMS2	YJR147W	CDC45	Q08032	650 aa		7.6	□□□□□ -1.19

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