RNA–Protein interactions for RNA: YGL196W

DSD1, Transcript of D-serine dehydratase (aka D-serine ammonia-lyase), yeastyeast

Gene DSD1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DSD1YGL196W PTK2P47116 818 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
DSD1YGL196W TRM1P15565 570 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
DSD1YGL196W UGA3P26370 528 aa7.56□□□□□ -1.2
DSD1YGL196W CSE4P36012 229 aa7.56□□□□□ -1.2
DSD1YGL196W RPL34BP40525 121 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
DSD1YGL196W PUS6P53294 404 aa7.56□□□□□ -1.2
DSD1YGL196W CAF120P53836 1060 aa7.56□□□□□ -1.2
DSD1YGL196W ALR1Q08269 859 aa7.56□□□□□ -1.2
DSD1YGL196W SSA4P22202 642 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
DSD1YGL196W YBL036CP38197 257 aa7.55□□□□□ -1.2
DSD1YGL196W TBF1Q02457 562 aa7.55□□□□□ -1.2
DSD1YGL196W OPT2Q06593 877 aa7.55□□□□□ -1.2
DSD1YGL196W KIP2P28743 706 aa7.54□□□□□ -1.2
DSD1YGL196W TYW1Q08960 810 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
DSD1YGL196W MRT4P33201 236 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
DSD1YGL196W IXR1P33417 597 aa7.53□□□□□ -1.2
DSD1YGL196W ACO2P39533 789 aa7.53□□□□□ -1.2
DSD1YGL196W TIF1P10081 395 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
DSD1YGL196W YML020WQ03722 664 aa7.51□□□□□ -1.21
DSD1YGL196W NOP8Q08287 484 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
DSD1YGL196W MMP1Q12372 583 aa7.51□□□□□ -1.21
DSD1YGL196W SLX8P40072 274 aa7.49□□□□□ -1.21
DSD1YGL196W BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data7.49□□□□□ -1.21not detected
DSD1YGL196W RAD59Q12223 238 aa7.49□□□□□ -1.21
DSD1YGL196W SRF1Q12516 437 aa7.48□□□□□ -1.21
DSD1YGL196W ESS1P22696 170 aa7.47□□□□□ -1.21
DSD1YGL196W PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
DSD1YGL196W SPT5P27692 1063 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
DSD1YGL196W BIO2P32451 375 aa7.46□□□□□ -1.22
DSD1YGL196W TTI1P36097 1038 aa7.46□□□□□ -1.22
DSD1YGL196W YJU3P28321 313 aa7.45□□□□□ -1.22
DSD1YGL196W GLY1P37303 387 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
DSD1YGL196W NUP85P46673 744 aa7.45□□□□□ -1.22
DSD1YGL196W SUP45P12385 437 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
DSD1YGL196W RTG2P32608 588 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
DSD1YGL196W YIR007WP40566 764 aa7.44□□□□□ -1.22
DSD1YGL196W ITT1Q04638 464 aa7.44□□□□□ -1.22
DSD1YGL196W YLR346CQ06139 101 aa7.44□□□□□ -1.22
DSD1YGL196W SIS2P36024 562 aa7.43□□□□□ -1.22
DSD1YGL196W YPR204WQ08995 1032 aa7.43□□□□□ -1.22
DSD1YGL196W VAC17P25591 423 aa7.42□□□□□ -1.22
DSD1YGL196W TY1A-BLQ12266 440 aa7.42□□□□□ -1.22
DSD1YGL196W ARG8P18544 423 aa7.41□□□□□ -1.22
DSD1YGL196W CPS1P27614 576 aa7.41□□□□□ -1.22
DSD1YGL196W MIP1P15801 1254 aa7.4□□□□□ -1.22
DSD1YGL196W RSC30P38781 883 aa7.4□□□□□ -1.22
DSD1YGL196W SCW11P53189 542 aa7.4□□□□□ -1.22
DSD1YGL196W YNL108CP53929 270 aa7.4□□□□□ -1.22
DSD1YGL196W YBL086CP38177 466 aa7.39□□□□□ -1.23
DSD1YGL196W MAK16P10962 306 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
DSD1YGL196W AAD14P42884 376 aa7.38□□□□□ -1.23
DSD1YGL196W YGR035CP53222 116 aa7.38□□□□□ -1.23
DSD1YGL196W TRK2P28584 889 aa7.37□□□□□ -1.23
DSD1YGL196W RTT106P40161 455 aa7.37□□□□□ -1.23
DSD1YGL196W APP1P53933 587 aa7.37□□□□□ -1.23
DSD1YGL196W RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
DSD1YGL196W HPF1Q05164 967 aa7.37□□□□□ -1.23
DSD1YGL196W NAF1P53919 492 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
DSD1YGL196W MRX10Q05648 414 aa7.36□□□□□ -1.23
DSD1YGL196W NOB1Q08444 459 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
DSD1YGL196W ENO2P00925 437 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
DSD1YGL196W CDC3P32457 520 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
DSD1YGL196W SLD2P34252 453 aa7.35□□□□□ -1.23
DSD1YGL196W YPP1P46951 817 aa7.35□□□□□ -1.23
DSD1YGL196W ARG82P07250 355 aa7.34□□□□□ -1.23
DSD1YGL196W DLD1P32891 587 aa7.34□□□□□ -1.23
DSD1YGL196W ENO1P00924 437 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
DSD1YGL196W YJR098CP47139 656 aa7.33□□□□□ -1.24
DSD1YGL196W RIM21P48565 533 aa7.33□□□□□ -1.24
DSD1YGL196W LSC2P53312 427 aa7.33□□□□□ -1.24
DSD1YGL196W YDJ1P25491 409 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
DSD1YGL196W EMW1P42842 904 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
DSD1YGL196W PUP1P25043 261 aa7.31□□□□□ -1.24
DSD1YGL196W TCB1Q12466 1186 aa7.3□□□□□ -1.24
DSD1YGL196W PEP12P32854 288 aa7.28□□□□□ -1.24
DSD1YGL196W FIG4P42837 879 aa7.28□□□□□ -1.24
DSD1YGL196W UBP2Q01476 1272 aa7.28□□□□□ -1.24
DSD1YGL196W MTC5Q03897 1148 aa7.28□□□□□ -1.24
DSD1YGL196W TGL4P36165 910 aa7.27□□□□□ -1.25
DSD1YGL196W ROG3P43602 733 aa7.27□□□□□ -1.25
DSD1YGL196W SSF1P38789 453 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
DSD1YGL196W MRX12P47084 519 aa7.26□□□□□ -1.25
DSD1YGL196W CCP1P00431 361 aa7.25□□□□□ -1.25
DSD1YGL196W YML083CQ04526 418 aa7.25□□□□□ -1.25
DSD1YGL196W MCM16Q12262 181 aa7.25□□□□□ -1.25
DSD1YGL196W TY1A-MR1Q04215 440 aa7.24□□□□□ -1.25
DSD1YGL196W DFG5Q05031 458 aa7.24□□□□□ -1.25
DSD1YGL196W OSH7P38755 437 aa7.23□□□□□ -1.25
DSD1YGL196W HEM3P28789 327 aa7.22□□□□□ -1.25
DSD1YGL196W MKS1P34072 584 aa7.22□□□□□ -1.25
DSD1YGL196W RDS2P19541 446 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
DSD1YGL196W YPR084WQ06821 456 aa7.21□□□□□ -1.26
DSD1YGL196W SEN54Q02825 467 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
DSD1YGL196W ATG3P40344 310 aa7.19□□□□□ -1.26
DSD1YGL196W HAT1Q12341 374 aa7.19□□□□□ -1.26
DSD1YGL196W GAL2P13181 574 aa7.18□□□□□ -1.26
DSD1YGL196W SNU71P53207 620 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
DSD1YGL196W TEC1P18412 486 aa7.17□□□□□ -1.26
DSD1YGL196W NOP7P53261 605 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
DSD1YGL196W NAM8Q00539 523 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 69.4 ms