RNA–Protein interactions for RNA: YPL212C

PUS1, Transcript of tRNA:pseudouridine synthase, yeast

Gene PUS1, Length 1,635 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUS1	YPL212C	NTH1	P32356	751 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	KRE6	P32486	720 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	DUT1	P33317	147 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	MAC1	P35192	417 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	MRPL3	P36516	390 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	SAF1	P38352	637 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	MET30	P39014	640 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	ECM27	P47144	725 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	SGF73	P53165	657 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	IMO32	P53219	342 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	MRPS16	Q02608	121 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	YMR130W	Q04223	302 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	ELP6	Q04868	273 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	YLR283W	Q05867	314 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	BOP2	Q06150	570 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	OPI10	Q08202	246 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	VPS68	Q12016	184 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	YOR114W	Q12219	294 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	YOL114C	Q12322	202 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	FMP16	Q12497	93 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	TOM1	Q03280	3268 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	SEC12	P11655	471 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	ADE1	P27616	306 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	ITR1	P30605	584 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	SNC1	P31109	117 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	SSH4	P32343	579 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
PUS1	YPL212C	PDR3	P33200	976 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	SKN1	P33336	771 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	TAT1	P38085	619 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	BNA4	P38169	460 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	CHL4	P38907	458 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	VRG4	P40107	337 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	OSW5	P40219	148 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	HXT9	P40885	567 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	YGR210C	P42942	411 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	YFR020W	P43600	232 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	IDS2	P46958	469 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	TIM54	P47045	478 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	YGR067C	P53243	804 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	YKR011C	Q02209	353 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	OST6	Q03723	332 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	TMN2	Q04562	672 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	ROY1	Q04847	553 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	RSF1	Q05043	376 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	SKI7	Q08491	747 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	FEX1	Q08913	375 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	PUS9	Q12069	462 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	TPO4	Q12256	659 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	YOR214C	Q12282	236 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	CMP2	P14747	604 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	PHO80	P20052	293 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	FUN26	P31381	517 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	SDS22	P36047	338 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	SRO77	P38163	1010 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	CCZ1	P38273	704 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	TAE1	P38340	232 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.75	□□□□□ -1.65	not detected
PUS1	YPL212C	SWM2	P40342	146 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	MOB1	P40484	314 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	APS3	P47064	194 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	YGL101W	P53144	215 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	RHO4	Q00246	291 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	EAR1	Q03212	550 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	PLM2	Q04383	521 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	EAF1	Q06337	982 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	TPO3	Q06451	622 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	MRL1	Q06815	381 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	XYL2	Q07993	356 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	PLB3	Q08108	686 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	FDH1	Q08911	376 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	YDL176W	Q12027	708 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	SPC3	Q12133	184 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	BSC1	Q12140	328 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	APC2	Q12440	853 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.75	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	GCN4	P03069	281 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	YOL162W	P0CF19	215 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PUS1	YPL212C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65

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