RNA–Protein interactions for RNA: YMR107W

SPG4, Transcript of Protein required for high temperature survival during stationary phase, yeast

Gene SPG4, Length 348 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPG4	YMR107W	REC102	Q02721	264 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	SKY1	Q03656	742 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	CAC2	Q04199	468 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	SMA2	Q04658	369 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	DCR2	Q05924	578 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	APC5	Q08683	685 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	INP53	Q12271	1107 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	SFG1	Q12507	346 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SPG4	YMR107W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	CDC50	P25656	391 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	YMC1	P32331	307 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	CPR5	P35176	225 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	SFK1	P35735	353 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	SCO2	P38072	301 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	ALG14	P38242	237 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	UBX7	P38349	436 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	BNA6	P43619	295 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
SPG4	YMR107W	KIN4	Q01919	800 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	GIP3	Q03016	1276 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	EST3	Q03096	181 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	VBA1	Q04301	562 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	PLM2	Q04383	521 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	CRF1	Q04930	467 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	GPN3	Q06543	272 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	TMS1	Q12116	473 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	YPK2	P18961	677 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	APN1	P22936	367 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	PRE4	P30657	266 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	MRPL9	P31334	269 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	SIP1	P32578	815 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	SUA5	P32579	426 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	ECT1	P33412	323 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	SPO23	P33757	523 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
SPG4	YMR107W	SHE1	P38200	338 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	COS111	P38308	924 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	OCA5	P38738	679 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	YHR122W	P38829	231 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	TAT2	P38967	592 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	PGD1	P40356	397 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	PAN6	P40459	309 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	PFA3	P42836	336 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	YGR201C	P42936	225 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	PHO23	P50947	330 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	SDT1	P53078	280 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	SWC4	P53201	476 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	YNL165W	P53891	406 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	IRC15	Q02733	499 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	ELP6	Q04868	273 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	RNH202	Q05635	350 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	SPO77	Q06134	477 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	MRX4	Q12467	430 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	AFI1	Q99222	893 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	MER1	P16523	270 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	IFM1	P25038	676 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	POF1	P25576	258 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	ARE1	P25628	610 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	YUR1	P26725	428 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	ITR1	P30605	584 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	KRE6	P32486	720 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	SEC17	P32602	292 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	SUR1	P33300	382 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	LOT5	P34234	306 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	MTC2	P34246	357 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	TUL1	P36096	758 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	SDH4	P37298	181 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	APM3	P38153	483 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	COS8	P38723	381 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	EFM1	P38732	585 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	ALP1	P38971	573 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	SLM1	P40485	686 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPG4	YMR107W	AGX1	P43567	385 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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