RNA–Protein interactions for RNA: YKR093W

PTR2, Transcript of Integral membrane peptide transporter, yeast

Gene PTR2, Length 1,806 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PTR2	YKR093W	YBP1	P38315	674 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	SMF2	P38778	549 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	MET30	P39014	640 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	COX14	P39103	70 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	FHL1	P39521	936 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	PRM9	P39551	298 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	RPH1	P39956	796 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	KAP114	P53067	1004 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	BSC6	Q08280	497 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	APC9	Q12107	265 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	DOA4	P32571	926 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	KEL2	P50090	882 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	BTS1	Q12051	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	PRB1	P09232	635 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	HEM15	P16622	393 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	AGP3	P43548	558 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	GMC2	Q06201	188 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	NDE2	Q07500	545 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	CYC3	P06182	269 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	YSR3	P23501	404 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	YER085C	P40058	173 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	YGR210C	P42942	411 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	MRX5	P47007	382 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	COS10	P52924	374 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	MRM2	P53123	320 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	SNA4	Q07549	140 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	RGT2	Q12300	763 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	ATP6	P00854	259 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	ARG80	P07249	177 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	SUA5	P32579	426 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	LCB3	P47013	409 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	WSC2	P53832	503 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	SED5	Q01590	340 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	IRC4	Q03036	179 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	INP2	Q03824	705 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	DAP1	Q12091	152 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	ATG31	Q12421	196 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	STH1	P32597	1359 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	SAL1	D6W196	494 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	PTP1	P25044	335 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	ITR2	P30606	609 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	FMC1	P40491	155 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	TDA1	Q03533	586 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	CMS1	Q07897	291 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTR2	YKR093W	QCR6	P00127	147 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTR2	YKR093W	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PTR2	YKR093W	AGA1	P32323	725 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTR2	YKR093W	KAR9	P32526	644 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTR2	YKR093W	ZRT1	P32804	376 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTR2	YKR093W	SPO23	P33757	523 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTR2	YKR093W	AVT5	P38176	459 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTR2	YKR093W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PTR2	YKR093W	MSS2	P40990	351 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTR2	YKR093W	NUP116	Q02630	1113 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTR2	YKR093W	LOT6	Q07923	191 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTR2	YKR093W	SLM3	Q12093	417 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTR2	YKR093W	RPN6	Q12377	434 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTR2	YKR093W	PCL9	Q12477	304 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTR2	YKR093W	RAD3	P06839	778 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTR2	YKR093W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PTR2	YKR093W	RRT12	P25381	491 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTR2	YKR093W	YIL029C	P40538	142 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTR2	YKR093W	NCA3	P46955	337 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTR2	YKR093W	YMR209C	Q03648	457 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTR2	YKR093W	PRM6	Q04705	352 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTR2	YKR093W	ERP3	Q12403	225 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTR2	YKR093W	EAF3	Q12432	401 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTR2	YKR093W	TRP1	P00912	224 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PTR2	YKR093W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PTR2	YKR093W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PTR2	YKR093W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	not detected
PTR2	YKR093W	TCD1	P38756	429 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PTR2	YKR093W	YHR035W	P38769	630 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PTR2	YKR093W	CIN2	P46670	268 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PTR2	YKR093W	YOR029W	Q12243	111 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PTR2	YKR093W	SAC3	P46674	1301 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PTR2	YKR093W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PTR2	YKR093W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PTR2	YKR093W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PTR2	YKR093W	MEI5	P32489	222 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PTR2	YKR093W	ECM8	P38246	354 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PTR2	YKR093W	COA1	P40452	197 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PTR2	YKR093W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PTR2	YKR093W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PTR2	YKR093W	SRL1	Q08673	210 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PTR2	YKR093W	DDC1	Q08949	612 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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