RNA–Protein interactions for RNA: YKR088C

TVP38, Transcript of Integral membrane protein, yeast

Gene TVP38, Length 1,014 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TVP38	YKR088C	YLR012C	Q07927	99 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	TRM8	Q12009	286 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	YDL109C	Q12103	647 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	LAG2	Q92325	660 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	STE3	P06783	470 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	MSF1	P08425	469 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	PET54	P10834	293 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	RER1	P25560	188 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	CPR3	P25719	182 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	OAC1	P32332	324 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	RNP1	P32385	249 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	NDC1	P32500	655 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	MSN2	P33748	704 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	LOT5	P34234	306 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	RSM22	P36056	628 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	MNN2	P38069	597 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	SBE22	P38814	852 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	MDM31	P38880	579 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	NVJ1	P38881	321 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	TVP23	P38962	199 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	YIL089W	P40500	205 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	ATG18	P43601	500 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	SIP4	P46954	829 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.23	□□□□□ -1.73	RIP-Chip
TVP38	YKR088C	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	TRM82	Q03774	444 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	VHS1	Q03785	461 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	AIM36	Q03798	255 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	YMR087W	Q04299	284 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	YLR283W	Q05867	314 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	SPO77	Q06134	477 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	ATG33	Q06485	197 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	ASR1	Q06834	288 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	YLR031W	Q07978	186 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	FRE7	Q12333	620 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	ATP14	Q12349	124 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	PST1	Q12355	444 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	MRX4	Q12467	430 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	TMA17	Q12513	150 aa		4.23	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	MET2	P08465	486 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	PPH22	P23595	377 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	YCR102C	P25608	368 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	ERG9	P29704	444 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	HYM1	P32464	399 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	SPO23	P33757	523 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	MRPL3	P36516	390 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	SOL2	P37262	315 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	NDE1	P40215	560 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	HXT9	P40885	567 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	YGR067C	P53243	804 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	ERV29	P53337	310 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	RRN9	P53437	365 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	ZRG17	P53735	605 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	GOR1	P53839	350 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	YNL034W	P53963	612 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	GIP3	Q03016	1276 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	FDC1	Q03034	503 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	MFB1	Q04922	465 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	BSC1	Q12140	328 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	YOR012W	Q12351	137 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	POM34	Q12445	299 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	PEX11	Q12462	236 aa		4.22	□□□□□ -1.73
TVP38	YKR088C	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TVP38	YKR088C	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
TVP38	YKR088C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
TVP38	YKR088C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
TVP38	YKR088C	SPS2	P08459	502 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TVP38	YKR088C	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
TVP38	YKR088C	BAR1	P12630	587 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TVP38	YKR088C	RED1	P14291	827 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TVP38	YKR088C	MER1	P16523	270 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TVP38	YKR088C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
TVP38	YKR088C	DAL81	P21657	970 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TVP38	YKR088C	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
TVP38	YKR088C	YIM1	P28625	365 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TVP38	YKR088C	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
TVP38	YKR088C	SNC1	P31109	117 aa		4.21	□□□□□ -1.74
TVP38	YKR088C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
TVP38	YKR088C	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.8 ms