RNA–Protein interactions for RNA: YJL054W

TIM54, Transcript of Component of the mitochondrial TIM22 complex, yeast

Gene TIM54, Length 1,437 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TIM54	YJL054W	GAS2	Q06135	555 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	ARR1	Q06596	294 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	ENB1	Q08299	606 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	NSL1	Q12143	216 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	SFG1	Q12507	346 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	ATP6	P00854	259 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	ARG3	P05150	338 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	PUT2	P07275	575 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	CLB3	P24870	427 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	RAD14	P28519	371 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	YPT7	P32939	208 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	MIA40	P36046	403 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	ROT2	P38138	954 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	IST2	P38250	946 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	EXO84	P38261	753 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	RPP1	P38786	293 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	NSG1	P38837	291 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	YIL169C	P40442	995 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	SMK1	P41808	388 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	INP1	Q03694	420 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	RAD30	Q04049	632 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	URC2	Q04411	772 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	HNT3	Q08702	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	RCN2	Q12044	265 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	LAS17	Q12446	633 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	FLO9	P39712	1322 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	TPK2	P06245	380 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	MER1	P16523	270 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	CSM1	P25651	190 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	TUL1	P36096	758 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	APD1	P38281	316 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	TSC10	P38342	320 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	RCK1	P38622	512 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	LSG1	P53145	640 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	ASI2	P53895	289 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	SDC1	Q03323	175 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	ASM4	Q05166	528 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	BUR2	Q05949	395 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	MFG1	Q07684	458 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	MAK32	P23060	363 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	RAD51	P25454	400 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	DEP1	P31385	405 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	RFC3	P38629	340 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	YJL193W	P39542	402 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	LAS21	P40367	830 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	REE1	P40893	198 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	RIM13	Q03792	727 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	RAD33	Q04231	177 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	HSP31	Q04432	237 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	YKU80	Q04437	629 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	YOR214C	Q12282	236 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	PCL2	P25693	308 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	EHD3	P28817	500 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	YEF1	P32622	495 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	TOA1	P32773	286 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	YMR262W	P38430	313 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	ALG5	P40350	334 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	YGR066C	P53242	292 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	DYN3	Q04949	312 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	GGA1	Q06336	557 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	DCI1	Q08558	271 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	YPR202W	Q08993	238 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TIM54	YJL054W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TIM54	YJL054W	YLR415C	O13578	112 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIM54	YJL054W	HMG1	P12683	1054 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIM54	YJL054W	GAL3	P13045	520 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIM54	YJL054W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TIM54	YJL054W	LHP1	P33399	275 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TIM54	YJL054W	BIG1	P38813	335 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIM54	YJL054W	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TIM54	YJL054W	MTW1	P39731	289 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIM54	YJL054W	ECM10	P39987	644 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIM54	YJL054W	YER010C	P40011	234 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIM54	YJL054W	YJR142W	P47173	342 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIM54	YJL054W	NRG1	Q03125	231 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIM54	YJL054W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TIM54	YJL054W	EKI1	Q03764	534 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TIM54	YJL054W	SNX41	Q04053	625 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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