RNA–Protein interactions for RNA: YFL039C

ACT1, Transcript of Actin, yeast

Gene ACT1, Length 1,128 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ACT1	YFL039C	MNN2	P38069	597 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	YPK3	P38070	525 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	PCA1	P38360	1216 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	FRT2	P39734	528 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	YKE4	P40544	346 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	YIR016W	P40572	265 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	PAC11	P40960	533 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	VPS25	P47142	202 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	YNL140C	P53910	189 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	MTQ1	P53944	314 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	PFA5	Q03289	374 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	NDE2	Q07500	545 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	YLR053C	Q12026	108 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	EMP46	Q12396	444 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	YCL012C	Q8J0M4	134 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	RHO2	P06781	192 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	POX1	P13711	748 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	TAF14	P35189	244 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	HIS2	P38635	335 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	LEU5	P38702	357 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	GPI16	P38875	610 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	SEN34	P39707	275 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	SEO1	P39709	593 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	HAT2	P39984	401 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	COX15	P40086	486 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	YNL194C	P40169	301 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	YMR134W	P40207	237 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	SNL1	P40548	159 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	RCF2	P53721	224 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	GOR1	P53839	350 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	ARO80	Q04052	950 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	PEX10	Q05568	337 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	ATG9	Q12142	997 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	SIA1	Q12212	622 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	RGS2	Q99188	309 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	PET20	Q99373	253 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	RIP1	P08067	215 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	YFL068W	P0CX99	160 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	YLL066W-A	P0CY00	160 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	YLL067W-A	P0CY01	160 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	CLN3	P13365	580 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	CBS2	P14905	389 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	YMR31	P19955	123 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	SLM1	P40485	686 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	YFR020W	P43600	232 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	SNG1	P46950	547 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	ECI1	Q05871	280 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	YOL019W	Q08157	551 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	YLR112W	Q12130	139 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	SNF8	Q12483	233 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	COX3	P00420	269 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	CKI1	P20485	582 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	YSC83	P32792	385 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	QDR3	P38227	689 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	DER1	P38307	211 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	VHC1	P38329	1120 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	SHG1	P38337	142 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	VRG4	P40107	337 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	YGL108C	P53139	140 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	ZRG17	P53735	605 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	YDR248C	Q03786	193 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	BCH1	Q05029	724 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	SRL1	Q08673	210 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	YPL199C	Q08954	240 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	RAD50	P12753	1312 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	SCEI	P03882	235 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	PPZ1	P26570	692 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	MSK1	P32048	576 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	ACH1	P32316	526 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	MCH2	P36032	473 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	DRE2	P36152	348 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	ECM8	P38246	354 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ACT1	YFL039C	ICS2	P38284	255 aa		4.34	□□□□□ -1.71

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