RNA–Protein interactions for RNA: YEL038W

UTR4, Transcript of Protein with sequence similarity to acireductone synthases, yeast

Gene UTR4, Length 684 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UTR4	YEL038W	IPT1	P38954	527 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	KRE29	P40026	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	SER3	P40054	469 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	YJL068C	P40363	299 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	AAD14	P42884	376 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	STE24	P47154	453 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	YGR079W	P53249	370 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	SNF12	P53628	566 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	RHO4	Q00246	291 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	RSC9	Q03124	581 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	RIM13	Q03792	727 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	KRE28	Q04431	385 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	BOP2	Q06150	570 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	ARO10	Q06408	635 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	SOG2	Q08817	791 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	YOL107W	Q12239	342 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
UTR4	YEL038W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	MGR1	P25573	417 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	OAR1	P35731	278 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	TUL1	P36096	758 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	EHT1	P38295	451 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	BIG1	P38813	335 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	GPI16	P38875	610 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	YHR210C	P38893	341 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	SOK1	P40317	901 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	IRC5	P43610	853 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	BIT61	P47041	543 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	SHE4	P51534	789 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	TWF1	P53250	332 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	FHN1	P53279	174 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	SRL4	Q03085	281 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	ARP10	Q04549	284 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	FMP42	Q04991	504 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	DCI1	Q08558	271 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	NFI1	Q12216	726 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	HER1	Q12276	1246 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	TRM10	Q12400	293 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	SKS1	Q12505	502 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	LAG2	Q92325	660 aa		4.85	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	VPS33	P20795	691 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	CLB2	P24869	491 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	PRO1	P32264	428 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	OMA1	P36163	345 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	MOH1	P38191	138 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	FAT1	P38225	669 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	RCY1	P39531	840 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	YIL086C	P40503	102 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	SNM1	P40993	198 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	CDH1	P53197	566 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	ASI1	P54074	624 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	GRX5	Q02784	150 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	YDR286C	Q05530	114 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	MDM30	Q05930	598 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	MMT2	Q08970	484 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	BSC1	Q12140	328 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	MSH5	Q12175	901 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.84	□□□□□ -1.63
UTR4	YEL038W	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
UTR4	YEL038W	SIR3	P06701	978 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UTR4	YEL038W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UTR4	YEL038W	PDX1	P16451	410 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UTR4	YEL038W	RPB5	P20434	215 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UTR4	YEL038W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UTR4	YEL038W	CTF8	P38877	133 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UTR4	YEL038W	POP2	P39008	433 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UTR4	YEL038W	YIL166C	P40445	542 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UTR4	YEL038W	MET28	P40573	187 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UTR4	YEL038W	SWP82	P43554	623 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UTR4	YEL038W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UTR4	YEL038W	TRM9	P49957	279 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UTR4	YEL038W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UTR4	YEL038W	YGR168C	P53293	376 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UTR4	YEL038W	MTQ1	P53944	314 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UTR4	YEL038W	TIM10	P87108	93 aa		4.83	□□□□□ -1.64
UTR4	YEL038W	YMD8	Q03697	442 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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