RNA–Protein interactions for RNA: YDL007W

RPT2, Transcript of ATPase of the 19S regulatory particle of the 26S proteasome, yeast

Gene RPT2, Length 1,314 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPT2	YDL007W	RCK1	P38622	512 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	NVJ1	P38881	321 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.07	□□□□□ -1.6	not detected
RPT2	YDL007W	SEN34	P39707	275 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	RRG9	P40156	214 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	MAD2	P40958	196 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	CIN1	P40987	1014 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	GAB1	P41733	394 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	GDS1	P41913	522 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	YJL016W	P47072	561 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	BFA1	P47113	574 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	BNA2	P47125	453 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	GTO1	P48239	356 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	RRN9	P53437	365 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	MET14	Q02196	202 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	CLP1	Q08685	445 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	TRM8	Q12009	286 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	NUS1	Q12063	375 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	SWM1	Q12379	170 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	DST1	P07273	309 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	ATP11	P32453	318 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	PDC2	P32896	925 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	PTR2	P32901	601 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	TVP38	P36164	337 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	APL3	P38065	1025 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	CTF8	P38877	133 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	YEL028W	P39989	153 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	BIT61	P47041	543 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	PEX31	P53203	462 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	YGR067C	P53243	804 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	KTR6	P54070	446 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	NHP10	Q03435	203 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	TPO3	Q06451	622 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	CDD1	Q06549	142 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	SWC7	Q06707	132 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	DIN7	Q12086	430 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	YLR108C	Q12259	485 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	YOS9	Q99220	542 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	COX5A	P00424	153 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	AAC3	P18238	307 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	YCR099C	P25657	155 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	SRB6	P32570	121 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	PET127	P32606	800 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	FAT1	P38225	669 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	FMO1	P38866	432 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	MDM31	P38880	579 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	RFC2	P40348	353 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	HIS6	P40545	261 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	OPT1	P40897	799 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	MEP2	P41948	499 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	IRC7	P43623	340 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	HMS2	P47175	358 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	PMT5	P52867	743 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	IMO32	P53219	342 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	TIM13	P53299	105 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	IGO1	P53897	168 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	SPP2	Q02521	185 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	YPL113C	Q02961	396 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	MSS11	Q03825	758 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	YMR087W	Q04299	284 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	MRPL35	Q06678	367 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	PLB3	Q08108	686 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	NMD4	Q12129	218 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	RKM5	Q12367	367 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	PCC1	Q3E833	88 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	UNG1	P12887	359 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	POX1	P13711	748 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	UTR1	P21373	530 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	DBF20	P32328	564 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	SIP1	P32578	815 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	MIA40	P36046	403 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	ALY1	P36117	915 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	YHR054C	P38780	354 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	LAS21	P40367	830 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	YIL024C	P40543	189 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	BAP3	P41815	604 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	PMT4	P46971	762 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPT2	YDL007W	AIM24	P47127	394 aa		5.04	□□□□□ -1.6

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