RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)M

tW(CCA)M, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)M, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)MtW(CCA)M DBP3P20447 523 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M RPS1BP23248 255 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M RPI1P23250 407 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M HSP30P25619 332 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M EHD3P28817 500 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M DEP1P31385 405 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M GSH1P32477 678 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data2.34□□□□□ -2.03not detected
tW(CCA)MtW(CCA)M HBS1P32769 611 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M TOA1P32773 286 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M ARC19P33204 171 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M MAE1P36013 669 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M IST2P38250 946 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YGP1P38616 354 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M RFC3P38629 340 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M MNN9P39107 395 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YMR144WP40214 342 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M IDP2P41939 412 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YGR201CP42936 225 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M QRI1P43123 477 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YFL051CP43552 160 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M ACS2P52910 683 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M BRR6P53062 197 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M USE1P53146 245 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YGR126WP53274 230 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M ELA1P53861 379 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M RHO5P53879 331 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M DMA2P53924 522 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M TPS1Q00764 495 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M KAP120Q02932 1032 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M FMN1Q03778 218 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M URC2Q04411 772 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M COQ11Q05892 277 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M HRI1Q05905 244 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M ATG26Q06321 1198 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YLR413WQ06689 675 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M VPS36Q06696 566 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M MFG1Q07684 458 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M TMC1Q08422 150 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M HNT3Q08702 217 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M YDL109CQ12103 647 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M MCP1Q12106 302 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M NCE102Q12207 173 aaRIP-Chip data2.34□□□□□ -2.03not detected
tW(CCA)MtW(CCA)M RNH203Q12338 110 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M RTN2Q12443 393 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)MtW(CCA)M ATP6P00854 259 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M RHO1P06780 209 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M PUT2P07275 575 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M RPL35AP0CX84 120 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M RPL35BP0CX85 120 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M PBN1P25580 416 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M RPN2P32565 945 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M SOF1P33750 489 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M PEX6P33760 1030 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M SWH1P35845 1188 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M CUE2P36075 443 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M MAL32P38158 584 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M GDT1P38301 280 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M YMR262WP38430 313 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M MGE1P38523 228 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M PRS3P38689 320 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M SKN7P38889 622 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M YIL165CP40446 119 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M IRC7P43623 340 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M PCP1P53259 346 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M MEP3P53390 489 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M SNF12P53628 566 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M TEX1P53851 422 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M MOT3P54785 490 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M NAN1Q02931 896 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M MMT1Q03218 510 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M HSP31Q04432 237 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M EMG1Q06287 252 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M SWA2Q06677 668 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M MRL1Q06815 381 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M RSC58Q07979 502 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M NTG2Q08214 380 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M ENB1Q08299 606 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M MUM3Q08750 479 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M FMP40Q08968 688 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M YDL176WQ12027 708 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M NSL1Q12143 216 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M YOR214CQ12282 236 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M YDL180WQ12301 547 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M SET6Q12529 373 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M YBL029C-AQ3E756 94 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M CDC36P06100 191 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M SUI3P09064 285 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M PRB1P09232 635 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M RPS16AP0CX51 143 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M RPS16BP0CX52 143 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M RNA1P11745 407 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M YPK2P18961 677 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M RPB8P20436 146 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M UTR1P21373 530 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M CPR2P23285 205 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M GIT1P25346 518 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M YCR100CP25606 316 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M PEX3P28795 441 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)MtW(CCA)M NTG1P31378 399 aa2.32□□□□□ -2.04
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