RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J DBP3P20447 523 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J RPS1BP23248 255 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J RPI1P23250 407 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J HSP30P25619 332 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J EHD3P28817 500 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J DEP1P31385 405 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J GSH1P32477 678 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data2.34□□□□□ -2.03not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J HBS1P32769 611 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J TOA1P32773 286 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J ARC19P33204 171 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J MAE1P36013 669 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J IST2P38250 946 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YGP1P38616 354 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J RFC3P38629 340 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J MNN9P39107 395 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YMR144WP40214 342 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J IDP2P41939 412 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YGR201CP42936 225 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J QRI1P43123 477 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YFL051CP43552 160 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J ACS2P52910 683 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J BRR6P53062 197 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J USE1P53146 245 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YGR126WP53274 230 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J ELA1P53861 379 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J RHO5P53879 331 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J DMA2P53924 522 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J TPS1Q00764 495 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J KAP120Q02932 1032 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J FMN1Q03778 218 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J URC2Q04411 772 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J COQ11Q05892 277 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J HRI1Q05905 244 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J ATG26Q06321 1198 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR413WQ06689 675 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J VPS36Q06696 566 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J MFG1Q07684 458 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J TMC1Q08422 150 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J HNT3Q08702 217 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J YDL109CQ12103 647 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J MCP1Q12106 302 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J NCE102Q12207 173 aaRIP-Chip data2.34□□□□□ -2.03not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J RNH203Q12338 110 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J RTN2Q12443 393 aa2.34□□□□□ -2.03
tW(CCA)JtW(CCA)J ATP6P00854 259 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J RHO1P06780 209 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J PUT2P07275 575 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL35AP0CX84 120 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J RPL35BP0CX85 120 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J PBN1P25580 416 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J RPN2P32565 945 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J SOF1P33750 489 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J PEX6P33760 1030 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J SWH1P35845 1188 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J CUE2P36075 443 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J MAL32P38158 584 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J GDT1P38301 280 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YMR262WP38430 313 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J MGE1P38523 228 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J PRS3P38689 320 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J SKN7P38889 622 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YIL165CP40446 119 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J IRC7P43623 340 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J PCP1P53259 346 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J MEP3P53390 489 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J SNF12P53628 566 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J TEX1P53851 422 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J MOT3P54785 490 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J NAN1Q02931 896 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J MMT1Q03218 510 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J HSP31Q04432 237 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J EMG1Q06287 252 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J SWA2Q06677 668 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J MRL1Q06815 381 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J RSC58Q07979 502 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J NTG2Q08214 380 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J ENB1Q08299 606 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J MUM3Q08750 479 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J FMP40Q08968 688 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YDL176WQ12027 708 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J NSL1Q12143 216 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YOR214CQ12282 236 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YDL180WQ12301 547 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J SET6Q12529 373 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YBL029C-AQ3E756 94 aa2.33□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J CDC36P06100 191 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J SUI3P09064 285 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J PRB1P09232 635 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J RPS16AP0CX51 143 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J RPS16BP0CX52 143 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J RNA1P11745 407 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YPK2P18961 677 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J RPB8P20436 146 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J UTR1P21373 530 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J CPR2P23285 205 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J GIT1P25346 518 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YCR100CP25606 316 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J PEX3P28795 441 aa2.32□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J NTG1P31378 399 aa2.32□□□□□ -2.04
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