RNA–Protein interactions for RNA: YOR316C

COT1, Transcript of Vacuolar transporter that mediates zinc transport into the vacuole, yeast

Gene COT1, Length 1,320 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
COT1	YOR316C	MPS3	P47069	682 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	MDE1	P47095	244 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	YJR154W	P47181	346 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	MUP1	P50276	574 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	ATG4	P53867	494 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
COT1	YOR316C	GIP3	Q03016	1276 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	MET31	Q03081	177 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	YDR124W	Q04608	324 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	YLR345W	Q06137	509 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	CYK3	Q07533	885 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	YLR040C	Q07988	224 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	ESA1	Q08649	445 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	NFI1	Q12216	726 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.62	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	TY2A-C	P25383	438 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	RPP1	P38786	293 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	FAD1	P38913	306 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	VPS52	P39904	641 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	PCL7	P40186	285 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	AIM22	P47051	409 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	HOT1	Q03213	719 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	YMR210W	Q03649	449 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	YEH1	Q07804	573 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	REX4	Q08237	289 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	YOL159C	Q08300	171 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	SGT1	Q08446	395 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	TRM13	Q12383	476 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.61	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	CBS2	P14905	389 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	ERG4	P25340	473 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	MGR1	P25573	417 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	DGR2	P32330	852 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	SPO23	P33757	523 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	COS111	P38308	924 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	RTT105	P40063	208 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	AYR1	P40471	297 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	PAC11	P40960	533 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	AZF1	P41696	914 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	MEP2	P41948	499 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	FMP32	P43557	207 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	IMA1	P53051	589 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	YPL068C	Q02749	293 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	MMT1	Q03218	510 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	FMN1	Q03778	218 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	SWF1	Q04629	336 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	BOP2	Q06150	570 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	YEH2	Q07950	538 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	RUP1	Q12242	671 aa		4.6	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	DST1	P07273	309 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	MRP13	P12686	339 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	STE50	P25344	346 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	CBP4	P37267	147 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	YBL029W	P38201	376 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	MRX1	P40050	688 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	ICE2	P40499	491 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	IAH1	P41734	238 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	SLI1	P53304	468 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	MAL12	P53341	584 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	ASM4	Q05166	528 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	PDR8	Q06149	701 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	COS7	Q07788	383 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	RSA1	Q08932	381 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	NSL1	Q12143	216 aa		4.59	□□□□□ -1.67
COT1	YOR316C	YLR415C	O13578	112 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COT1	YOR316C	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
COT1	YOR316C	COR1	P07256	457 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COT1	YOR316C	MET3	P08536	511 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COT1	YOR316C	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
COT1	YOR316C	CSM1	P25651	190 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COT1	YOR316C	RAD14	P28519	371 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COT1	YOR316C	YMC1	P32331	307 aa		4.58	□□□□□ -1.68
COT1	YOR316C	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
COT1	YOR316C	RIB7	P33312	244 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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